More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_12390 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_12390  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  100 
 
 
210 aa  417  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2397  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  67.86 
 
 
341 aa  220  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0755319  decreased coverage  0.00145448 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3614  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  61.76 
 
 
348 aa  185  4e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0660954 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2351  zinc-binding alcohol dehydrogenase  62.35 
 
 
341 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.363076  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2398  alcohol dehydrogenase  62.35 
 
 
341 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.818361  normal  0.171565 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2392  alcohol dehydrogenase  62.35 
 
 
350 aa  182  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138903  normal  0.0541679 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2422  alcohol dehydrogenase  60.12 
 
 
343 aa  169  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2099  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  54.19 
 
 
343 aa  167  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000136181 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1477  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  53.25 
 
 
337 aa  149  4e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616601  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6226  alcohol dehydrogenase  50 
 
 
152 aa  118  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4357  alcohol dehydrogenase  46.2 
 
 
337 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.642498 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2230  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.19 
 
 
332 aa  105  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3729  alcohol dehydrogenase  32.61 
 
 
329 aa  82  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.17576 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0899  putative NADPH:quinone oxidoreductase protein  35.36 
 
 
328 aa  77.4  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.504483  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1920  quinone oxidoreductase  28.97 
 
 
328 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2194  quinone oxidoreductase  28.5 
 
 
328 aa  75.1  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0247156  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1965  quinone oxidoreductase  28.97 
 
 
328 aa  74.7  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2113  quinone oxidoreductase  28.97 
 
 
328 aa  74.7  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2147  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.97 
 
 
328 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1944  quinone oxidoreductase  28.5 
 
 
328 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0819038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3191  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.97 
 
 
328 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0472649  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1957  alcohol dehydrogenase  30.16 
 
 
328 aa  71.2  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0178184  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2265  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.04 
 
 
328 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.846418  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1603  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.44 
 
 
331 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2722  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.98 
 
 
346 aa  65.5  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3581  response regulator receiver protein  30.94 
 
 
332 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.84389 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5020  alcohol dehydrogenase  32.12 
 
 
321 aa  64.7  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00109136  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2123  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  26.63 
 
 
328 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0765  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.69 
 
 
341 aa  63.9  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1496  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.16 
 
 
321 aa  63.9  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000022092 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0660  alcohol dehydrogenase  35.62 
 
 
336 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.179188  normal  0.126131 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4772  alcohol dehydrogenase  35.83 
 
 
336 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.297187  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4760  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.83 
 
 
336 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000489958  hitchhiker  0.00289101 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1471  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.35 
 
 
334 aa  62.4  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.895383  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4634  alcohol dehydrogenase  35.83 
 
 
336 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325342  hitchhiker  0.00283653 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2724  alcohol dehydrogenase  37.75 
 
 
324 aa  62  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0988305  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23320  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  30.81 
 
 
322 aa  62  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115564  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3419  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  26.92 
 
 
331 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.816241  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1171  alcohol dehydrogenase  33.88 
 
 
325 aa  61.6  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.356223 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0109  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.08 
 
 
326 aa  61.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22350  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  34.74 
 
 
327 aa  61.2  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0308  Quinone oxidoreductase putative PIG3  30.94 
 
 
329 aa  61.2  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.166873  normal  0.0546383 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1113  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.51 
 
 
341 aa  59.7  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3186  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  26.34 
 
 
335 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3438  alcohol dehydrogenase  26.34 
 
 
335 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1425  alcohol dehydrogenase  35.59 
 
 
339 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000155733 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2465  alcohol dehydrogenase  32.61 
 
 
324 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.955919  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3002  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.75 
 
 
335 aa  59.3  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4023  alcohol dehydrogenase  29.9 
 
 
345 aa  59.3  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.961336  unclonable  0.000000000225765 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2985  alcohol dehydrogenase  34.86 
 
 
323 aa  58.9  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2472  alcohol dehydrogenase  32.02 
 
 
325 aa  58.9  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.439289  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3646  alcohol dehydrogenase  35.16 
 
 
339 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237397 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5952  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.52 
 
 
338 aa  58.2  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187341  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2645  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.21 
 
 
339 aa  58.5  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.165067  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0562  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.45 
 
 
326 aa  58.2  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.6978  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3087  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  26.37 
 
 
331 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_45840  predicted protein  31.31 
 
 
364 aa  57.8  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3406  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  26.37 
 
 
331 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0783  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.32 
 
 
347 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.604967  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2633  alcohol dehydrogenase  35.59 
 
 
335 aa  57.8  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1981  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.56 
 
 
326 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.642936 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1367  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.05 
 
 
323 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.9935  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3391  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  26.37 
 
 
331 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116422  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4426  alcohol dehydrogenase  29.89 
 
 
319 aa  56.6  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3686  alcohol dehydrogenase  32.98 
 
 
331 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.343623  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3168  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  25.82 
 
 
331 aa  57  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00212321  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1170  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.41 
 
 
331 aa  56.6  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.636549 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2529  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.65 
 
 
322 aa  57.4  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3010  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.15 
 
 
322 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1245  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  29.57 
 
 
338 aa  57.4  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.490679  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5054  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.33 
 
 
340 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.436848  normal  0.803316 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1317  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.91 
 
 
342 aa  57  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1494  alcohol dehydrogenase  30.77 
 
 
321 aa  57  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.275992  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0904  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  37.29 
 
 
378 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3127  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  37.29 
 
 
405 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1575  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.14 
 
 
336 aa  56.2  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0411  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.51 
 
 
329 aa  56.2  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.201425  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3164  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  37.29 
 
 
405 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4860  alcohol dehydrogenase  31.61 
 
 
340 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0353609  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2006  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  37.29 
 
 
335 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2737  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  37.29 
 
 
335 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.537228  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16820  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  35.83 
 
 
336 aa  56.2  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0869  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  38.38 
 
 
334 aa  55.8  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3181  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  37.29 
 
 
335 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.192137  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5369  alcohol dehydrogenase  29.73 
 
 
327 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0954  alcohol dehydrogenase  38.38 
 
 
334 aa  55.8  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000352815 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1871  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  37.29 
 
 
335 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.584348  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4988  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.73 
 
 
327 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0100  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  31.32 
 
 
328 aa  56.2  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5076  alcohol dehydrogenase  29.73 
 
 
327 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1260  alcohol dehydrogenase  38.14 
 
 
334 aa  55.8  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.105782 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2563  alcohol dehydrogenase  36.78 
 
 
331 aa  55.5  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1484  alcohol dehydrogenase  32.24 
 
 
322 aa  55.8  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1264  alcohol dehydrogenase  30.77 
 
 
327 aa  55.5  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2092  quinone oxidoreductase putative PIG3  29.89 
 
 
332 aa  55.5  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187867  hitchhiker  0.000106437 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3027  alcohol dehydrogenase  30.51 
 
 
324 aa  55.5  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5001  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.17 
 
 
340 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.293962  normal  0.773613 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26780  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  32.23 
 
 
327 aa  55.5  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.498832 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4541  alcohol dehydrogenase  32.17 
 
 
340 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.125747 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1137  quinone oxidoreductase putative PIG3  30.73 
 
 
327 aa  55.5  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0153102  normal  0.45534 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>