More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3729 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009620  Smed_3729  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
329 aa  663    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.17576 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0899  putative NADPH:quinone oxidoreductase protein  53.21 
 
 
328 aa  333  2e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.504483  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2230  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.58 
 
 
332 aa  257  2e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1603  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40.96 
 
 
331 aa  215  7e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2099  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.71 
 
 
343 aa  204  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000136181 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1477  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.88 
 
 
337 aa  186  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616601  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2397  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.02 
 
 
341 aa  183  4.0000000000000006e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0755319  decreased coverage  0.00145448 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3614  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.83 
 
 
348 aa  181  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0660954 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2398  alcohol dehydrogenase  39.66 
 
 
341 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.818361  normal  0.171565 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2351  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.66 
 
 
341 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.363076  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2392  alcohol dehydrogenase  39.37 
 
 
350 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138903  normal  0.0541679 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4357  alcohol dehydrogenase  38.66 
 
 
337 aa  155  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.642498 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1228  alcohol dehydrogenase  35.91 
 
 
327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1944  quinone oxidoreductase  31.56 
 
 
328 aa  146  5e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0819038  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2422  alcohol dehydrogenase  39.65 
 
 
343 aa  146  5e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2147  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.56 
 
 
328 aa  146  5e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1957  alcohol dehydrogenase  31.78 
 
 
328 aa  145  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0178184  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1920  quinone oxidoreductase  30.94 
 
 
328 aa  142  8e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2194  quinone oxidoreductase  31.25 
 
 
328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0247156  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1965  quinone oxidoreductase  31.25 
 
 
328 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2113  quinone oxidoreductase  31.25 
 
 
328 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3191  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.94 
 
 
328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0472649  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2788  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.82 
 
 
332 aa  140  3e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.147926  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49690  oxidoreductase  32.4 
 
 
328 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3419  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.35 
 
 
331 aa  139  6e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.816241  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2123  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.53 
 
 
328 aa  139  6e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2265  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.31 
 
 
328 aa  138  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.846418  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2398  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
335 aa  138  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.860037  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0913  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  33.83 
 
 
326 aa  138  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0537467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3168  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  31.35 
 
 
331 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00212321  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3087  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  31.35 
 
 
331 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1484  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  34.23 
 
 
342 aa  136  4e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.269368 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2503  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.75 
 
 
327 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.731792  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1367  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.12 
 
 
323 aa  135  7.000000000000001e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.9935  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3391  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.94 
 
 
331 aa  135  9e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116422  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0571  quinone oxidoreductase  33.12 
 
 
324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5835  alcohol dehydrogenase  32.14 
 
 
345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0954  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.13 
 
 
330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.319163  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3406  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.72 
 
 
331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5025  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.14 
 
 
345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.583153  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0196  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  34.03 
 
 
322 aa  133  3e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1959  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.44 
 
 
333 aa  133  3e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1113  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.99 
 
 
341 aa  134  3e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0231  alcohol dehydrogenase  40.93 
 
 
320 aa  133  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000570336  unclonable  8.70956e-23 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3468  alcohol dehydrogenase  33.55 
 
 
328 aa  132  6e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92927  normal  0.411159 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3186  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.65 
 
 
335 aa  132  6e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3438  alcohol dehydrogenase  30.65 
 
 
335 aa  132  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3745  alcohol dehydrogenase  34.72 
 
 
329 aa  132  6.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00017214 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2124  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.59 
 
 
328 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.386337  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0930  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.22 
 
 
324 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0815  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.88 
 
 
335 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4344  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  31.92 
 
 
356 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1137  quinone oxidoreductase putative PIG3  32.74 
 
 
327 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0153102  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7175  alcohol dehydrogenase  33.85 
 
 
327 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6946  putative NADPH quinone oxidoreductase  30.41 
 
 
332 aa  130  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2740  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.33 
 
 
328 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.42219  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5388  alcohol dehydrogenase  30.91 
 
 
326 aa  129  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3633  alcohol dehydrogenase  32.4 
 
 
325 aa  129  6e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0219  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  34.24 
 
 
328 aa  129  6e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1171  alcohol dehydrogenase  32.53 
 
 
325 aa  129  7.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.356223 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3049  quinone oxidoreductase, putative  33.03 
 
 
331 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.658374  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1429  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.43 
 
 
331 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1484  alcohol dehydrogenase  30.51 
 
 
322 aa  129  8.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0501  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.44 
 
 
332 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4323  putative oxidoreductase, zinc-containing alcohol dehydrogenase  32.3 
 
 
333 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0482  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.12 
 
 
322 aa  129  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1093  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  29.32 
 
 
337 aa  128  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2042  quinone oxidoreductase  35.09 
 
 
327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.282793  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3099  putative quinone oxidoreductase  35.09 
 
 
327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5020  alcohol dehydrogenase  31.65 
 
 
321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00109136  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1065  quinone oxidoreductase  35.09 
 
 
327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1439  quinone oxidoreductase  35.09 
 
 
327 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.845456  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2060  alcohol dehydrogenase  33.83 
 
 
324 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285411  normal  0.174232 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1350  quinone oxidoreductase  35.09 
 
 
327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4494  alcohol dehydrogenase  31.45 
 
 
332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218287  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2332  quinone oxidoreductase  35.09 
 
 
327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3068  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.12 
 
 
326 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0181294  normal  0.830882 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2184  NADPH:quinone reductase, zeta-crystallin homolog oxidoreductase protein  32.81 
 
 
324 aa  126  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200214  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  29.18 
 
 
327 aa  125  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1431  putative alcohol dehydrogenase  35.87 
 
 
336 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0161309 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1191  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.33 
 
 
323 aa  124  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00210  NADH-quinone oxidoreductase  33.23 
 
 
325 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.336084  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3044  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.91 
 
 
369 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.821698 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1056  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.58 
 
 
334 aa  124  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.691912  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1981  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.18 
 
 
326 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.642936 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1371  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29.43 
 
 
331 aa  123  4e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.544729  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.15 
 
 
326 aa  123  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722017  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3529  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.43 
 
 
328 aa  123  4e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2376  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.14 
 
 
322 aa  123  5e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.487886  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1621  quinone oxidoreductase putative PIG3  29.09 
 
 
336 aa  123  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.463823  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0180  alcohol dehydrogenase  32.51 
 
 
325 aa  123  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0985  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  30.5 
 
 
332 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.567707  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2572  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  34.29 
 
 
319 aa  122  6e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0649604  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3548  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.91 
 
 
332 aa  122  6e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0782  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  30.3 
 
 
338 aa  122  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.793313  normal  0.107326 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2827  alcohol dehydrogenase  31.59 
 
 
339 aa  122  7e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.582411  normal  0.0605973 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0529  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.53 
 
 
325 aa  122  7e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.41 
 
 
326 aa  122  9e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0562  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.32 
 
 
326 aa  122  9e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.6978  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2075  alcohol dehydrogenase  30.79 
 
 
322 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>