More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2230 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008044  TM1040_2230  zinc-binding alcohol dehydrogenase  100 
 
 
332 aa  660    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0899  putative NADPH:quinone oxidoreductase protein  43.71 
 
 
328 aa  257  2e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.504483  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3729  alcohol dehydrogenase  43.58 
 
 
329 aa  257  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.17576 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2099  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.52 
 
 
343 aa  210  2e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000136181 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1603  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  38.24 
 
 
331 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2397  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.52 
 
 
341 aa  186  4e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0755319  decreased coverage  0.00145448 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3614  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.03 
 
 
348 aa  179  7e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0660954 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1477  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.94 
 
 
337 aa  172  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616601  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2422  alcohol dehydrogenase  38.64 
 
 
343 aa  157  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2398  alcohol dehydrogenase  37.93 
 
 
341 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.818361  normal  0.171565 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2351  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.93 
 
 
341 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.363076  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2392  alcohol dehydrogenase  37.64 
 
 
350 aa  152  5e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138903  normal  0.0541679 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3728  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.16 
 
 
334 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3780  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.02 
 
 
334 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.107753  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4357  alcohol dehydrogenase  41.96 
 
 
337 aa  139  4.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.642498 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5020  alcohol dehydrogenase  35.65 
 
 
321 aa  136  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00109136  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4742  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.77 
 
 
334 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2418  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.53 
 
 
338 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0913  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  31.66 
 
 
326 aa  135  8e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0537467  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3184  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.95 
 
 
331 aa  132  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.500973  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1148  alcohol dehydrogenase  32.5 
 
 
339 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3232  alcohol dehydrogenase  30.67 
 
 
331 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1250  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.9 
 
 
339 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0692  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.17 
 
 
320 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3438  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.43 
 
 
321 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661509  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0660  alcohol dehydrogenase  33.73 
 
 
336 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.179188  normal  0.126131 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3087  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  29.71 
 
 
331 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3419  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  29.41 
 
 
331 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.816241  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1429  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.91 
 
 
331 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2797  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.23 
 
 
317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0771012  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0419  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  34.32 
 
 
320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0538396  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3027  alcohol dehydrogenase  32.92 
 
 
324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1093  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  30.26 
 
 
337 aa  127  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3186  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.65 
 
 
335 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3168  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  29.12 
 
 
331 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00212321  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3027  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.83 
 
 
342 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3438  alcohol dehydrogenase  29.65 
 
 
335 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0561  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.31 
 
 
332 aa  128  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3406  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  29.12 
 
 
331 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5428  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.86 
 
 
330 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0255  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.27 
 
 
336 aa  127  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3745  alcohol dehydrogenase  30.27 
 
 
329 aa  127  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00017214 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3391  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  29.12 
 
 
331 aa  126  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116422  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0482  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.09 
 
 
322 aa  126  5e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1864  alcohol dehydrogenase  32.64 
 
 
337 aa  126  6e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.410641  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3861  hypothetical protein  32.6 
 
 
324 aa  125  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3381  NAD(P)H -dependent quinone oxidoreductase  32.19 
 
 
324 aa  125  7e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.41624  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16820  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  33.33 
 
 
336 aa  125  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0313  alcohol dehydrogenase  32.84 
 
 
326 aa  125  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4760  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.73 
 
 
336 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000489958  hitchhiker  0.00289101 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2788  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.55 
 
 
332 aa  124  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.147926  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1137  quinone oxidoreductase putative PIG3  30.29 
 
 
327 aa  124  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0153102  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2124  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.54 
 
 
328 aa  124  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.386337  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4634  alcohol dehydrogenase  33.73 
 
 
336 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325342  hitchhiker  0.00283653 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4772  alcohol dehydrogenase  33.73 
 
 
336 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.297187  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0815  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.34 
 
 
335 aa  124  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2892  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.04 
 
 
317 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3002  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.34 
 
 
335 aa  124  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1539  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.23 
 
 
339 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5388  alcohol dehydrogenase  32.52 
 
 
326 aa  123  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69110  putative oxidoreductase  30.65 
 
 
325 aa  123  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1191  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.46 
 
 
323 aa  122  6e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2932  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.93 
 
 
342 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1030  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.81 
 
 
339 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2503  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.56 
 
 
327 aa  122  8e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.731792  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1959  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.43 
 
 
333 aa  122  9e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0100  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  30.86 
 
 
328 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2736  alcohol dehydrogenase  31.18 
 
 
328 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00823064  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0716  NADPH/quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase  29.67 
 
 
328 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.655261  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3084  alcohol dehydrogenase  29.33 
 
 
337 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2974  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.33 
 
 
337 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.133874  normal  0.173766 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0281  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.63 
 
 
320 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0697  alcohol dehydrogenase  29.36 
 
 
329 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00374337  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0954  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.75 
 
 
330 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.319163  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2843  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.55 
 
 
342 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0985  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  30.96 
 
 
332 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.567707  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2435  alcohol dehydrogenase  30.27 
 
 
333 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.953157  normal  0.115745 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2563  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.14 
 
 
311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.111047  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0018  alcohol dehydrogenase  32.34 
 
 
336 aa  120  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.760899  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2371  alcohol dehydrogenase  29.67 
 
 
328 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.603906  normal  0.87569 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2740  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.49 
 
 
328 aa  120  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.42219  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0548  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.71 
 
 
324 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.967786 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5952  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.03 
 
 
338 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187341  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1693  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.14 
 
 
334 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.201135  hitchhiker  0.000000656325 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2235  alcohol dehydrogenase  30.82 
 
 
330 aa  120  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0571  quinone oxidoreductase  31.9 
 
 
324 aa  119  7e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3890  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.59 
 
 
337 aa  119  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.171852  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3468  alcohol dehydrogenase  29.66 
 
 
328 aa  119  7e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92927  normal  0.411159 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2580  alcohol dehydrogenase  32.1 
 
 
324 aa  119  7.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277094 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0991  oxidoreductase, zinc-binding  30.06 
 
 
325 aa  119  9e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3853  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.66 
 
 
344 aa  119  9e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7175  alcohol dehydrogenase  30.25 
 
 
327 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49690  oxidoreductase  28.92 
 
 
328 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5977  putative oxidoreductase  30.36 
 
 
325 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3470  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.15 
 
 
337 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0219  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  30.46 
 
 
328 aa  118  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1425  alcohol dehydrogenase  32.63 
 
 
339 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000155733 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3049  quinone oxidoreductase, putative  30.46 
 
 
331 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.658374  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1171  alcohol dehydrogenase  33.82 
 
 
325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.356223 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1660  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.39 
 
 
332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.384338  normal  0.405975 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>