195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2256 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0708  hypothetical protein  100 
 
 		 389 aa  810    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2256  hypothetical protein  100 
 
 		 389 aa  810    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000262117  hitchhiker  0.0000000000169 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2593  hypothetical protein  100 
 
 		 389 aa  810    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3081  hypothetical protein  100 
 
 		 389 aa  810    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0007  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  374  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.860463 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0093  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  374  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000392722  hitchhiker  0.000145622 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1788  hypothetical protein  40.36 
 
 		 390 aa  275  8e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000460947  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2464  hypothetical protein  40.36 
 
 		 390 aa  275  8e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2477  hypothetical protein  40.36 
 
 		 390 aa  275  8e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00863555  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2535  hypothetical protein  40.36 
 
 		 390 aa  275  8e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3217  hypothetical protein  40.36 
 
 		 390 aa  275  8e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3824  hypothetical protein  40.36 
 
 		 390 aa  275  8e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000051596  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1525  Integrase catalytic region  25.07 
 
 		 391 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.88681  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0129  Integrase catalytic region  25.07 
 
 		 391 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162314  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7250  Integrase catalytic region  25.07 
 
 		 391 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186063  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4799  Integrase catalytic region  28.85 
 
 		 385 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2180  integrase catalytic region  31.39 
 
 		 400 aa  69.7  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0943007  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0336  Integrase catalytic region  28.85 
 
 		 385 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0795  Integrase catalytic region  27.05 
 
 		 425 aa  63.2  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0926  integrase catalytic region  26.18 
 
 		 269 aa  62.4  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3357  integrase catalytic region  26.18 
 
 		 269 aa  62.4  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0458  integrase catalytic subunit  22.56 
 
 		 338 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2923  transposase  26.32 
 
 		 377 aa  60.8  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.698804 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0404  integrase catalytic region  25.65 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.980653 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4089  integrase catalytic region  25.65 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.805064  normal  0.114736 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0886  integrase catalytic region  26.06 
 
 		 395 aa  60.5  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406047 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0954  integrase catalytic region  26.06 
 
 		 395 aa  60.5  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1567  integrase catalytic region  26.06 
 
 		 395 aa  60.5  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.210525  normal  0.165207 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2308  integrase catalytic region  26.06 
 
 		 395 aa  60.5  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.349393 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2452  integrase catalytic region  26.06 
 
 		 395 aa  60.5  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3168  integrase catalytic region  26.06 
 
 		 395 aa  60.5  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0686485  hitchhiker  0.0000277573 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2890  transposase  26.32 
 
 		 377 aa  60.1  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0319653  normal  0.0477074 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5108  transposase  26.32 
 
 		 377 aa  60.1  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5697  transposase  26.32 
 
 		 377 aa  60.1  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.308774  normal  0.641944 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3594  transposase  26.32 
 
 		 377 aa  60.1  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0294035 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0573  integrase catalytic subunit  24.12 
 
 		 597 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2172  Integrase catalytic region  25.42 
 
 		 402 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0104319  normal  0.0206375 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2234  Integrase catalytic region  25.42 
 
 		 402 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.715682  normal  0.416397 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4351  Integrase catalytic region  25.42 
 
 		 402 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000366675 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0541  putative transposase integrase  28.03 
 
 		 379 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3643  putative transposase  28.03 
 
 		 379 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4261  putative transposase  28.03 
 
 		 379 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.234878 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4349  putative transposase  28.03 
 
 		 379 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.732851  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4350  putative transposase  28.03 
 
 		 379 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244718  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1246  Integrase catalytic region  25.42 
 
 		 402 aa  58.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0188803  hitchhiker  0.00619914 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3338  Integrase catalytic region  26.02 
 
 		 380 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.858997  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7219  transposase  26.74 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0789  transposase  26.74 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176196 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0221  integrase catalytic region  25.79 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0898 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1064  integrase catalytic region  25.79 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1602  Integrase catalytic region  27.34 
 
 		 607 aa  56.6  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.090134  normal  0.142555 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3847  Integrase catalytic region  25.82 
 
 		 383 aa  56.6  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1705  Integrase catalytic region  20.58 
 
 		 378 aa  55.8  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1303  Integrase catalytic region  20.58 
 
 		 378 aa  55.8  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0789864  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1347  Integrase catalytic region  20.58 
 
 		 378 aa  55.8  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.519975  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0433  Integrase catalytic region  20.58 
 
 		 378 aa  55.8  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.705419  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0339  Integrase catalytic region  20.58 
 
 		 378 aa  55.8  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3192  Integrase catalytic region  20.58 
 
 		 378 aa  55.8  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00354129  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1219  Integrase catalytic region  20.58 
 
 		 378 aa  55.8  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1220  Integrase catalytic region  20.58 
 
 		 378 aa  55.8  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1250  Integrase catalytic region  20.58 
 
 		 378 aa  55.8  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2464  integrase catalytic subunit  22.83 
 
 		 382 aa  55.8  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3160  integrase catalytic subunit  22.83 
 
 		 382 aa  56.2  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.40278  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3658  Integrase catalytic region  25.82 
 
 		 383 aa  55.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1834  integrase catalytic subunit  23.63 
 
 		 387 aa  54.7  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1608  integrase catalytic region  26.32 
 
 		 290 aa  55.1  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0124752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3472  integrase catalytic region  26.32 
 
 		 290 aa  55.1  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0238059  normal  0.994317 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2509  integrase  28.29 
 
 		 231 aa  55.5  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0263754 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1842  integrase catalytic subunit  23.63 
 
 		 387 aa  54.7  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0837  integrase catalytic subunit  22.46 
 
 		 382 aa  54.3  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.767179 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3288  integrase catalytic subunit  22.46 
 
 		 382 aa  54.3  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.672557  normal  0.734734 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2320  integrase catalytic subunit  22.46 
 
 		 382 aa  54.3  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.801318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0945a  transposase  22.5 
 
 		 276 aa  53.9  0.000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.763205  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0166  ISDet2, transposase orfB  26.84 
 
 		 274 aa  52.8  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.101481  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0598  Integrase catalytic region  29.03 
 
 		 389 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.53363  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4336  Integrase catalytic region  29.03 
 
 		 389 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0872722  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2409  Integrase catalytic region  25.45 
 
 		 383 aa  52.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.359193  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0744  integrase catalytic subunit  25.57 
 
 		 393 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4748  Integrase catalytic region  29.03 
 
 		 389 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4005  integrase catalytic region  24.74 
 
 		 284 aa  52.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.5936 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0735  integrase catalytic subunit  25 
 
 		 391 aa  51.6  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_90  transposase  31.54 
 
 		 267 aa  52  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0109  integrase catalytic subunit  27.38 
 
 		 273 aa  52  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2021  integrase catalytic subunit  27.38 
 
 		 273 aa  52  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2783  integrase catalytic subunit  27.38 
 
 		 273 aa  52  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.983973  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_776  transposase  31.54 
 
 		 271 aa  52  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_65  transposase  29.53 
 
 		 209 aa  52  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1310  transposase  31.54 
 
 		 267 aa  52  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1333  transposase  29.53 
 
 		 209 aa  52  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0115  integrase catalytic subunit  28.78 
 
 		 231 aa  52  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0273  integrase catalytic subunit  28.78 
 
 		 231 aa  52  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0289  integrase catalytic subunit  28.78 
 
 		 231 aa  52  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1301  integrase catalytic subunit  28.78 
 
 		 231 aa  52  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5264  Integrase catalytic region  23.29 
 
 		 330 aa  51.2  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3083  Integrase catalytic region  23.29 
 
 		 330 aa  51.2  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00428734  hitchhiker  0.0000289484 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0788  Integrase catalytic region  23.29 
 
 		 347 aa  51.2  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3733  Integrase catalytic region  23.29 
 
 		 330 aa  51.2  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0167687  normal  0.270652 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4853  Integrase catalytic region  23.29 
 
 		 330 aa  51.2  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4852  integrase catalytic region  24.32 
 
 		 260 aa  51.2  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0318827 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5439  integrase catalytic subunit  29.66 
 
 		 278 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.298779  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>