165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2464 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1788  hypothetical protein  100 
 
 		 390 aa  811    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000460947  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2464  hypothetical protein  100 
 
 		 390 aa  811    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2477  hypothetical protein  100 
 
 		 390 aa  811    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00863555  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2535  hypothetical protein  100 
 
 		 390 aa  811    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3217  hypothetical protein  100 
 
 		 390 aa  811    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3824  hypothetical protein  100 
 
 		 390 aa  811    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000051596  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0708  hypothetical protein  40.36 
 
 		 389 aa  275  8e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2256  hypothetical protein  40.36 
 
 		 389 aa  275  8e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000262117  hitchhiker  0.0000000000169 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2593  hypothetical protein  40.36 
 
 		 389 aa  275  8e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3081  hypothetical protein  40.36 
 
 		 389 aa  275  8e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0007  hypothetical protein  40.88 
 
 		 179 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.860463 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0093  hypothetical protein  40.88 
 
 		 179 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000392722  hitchhiker  0.000145622 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2634  IS3 family transposase B  27.88 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000161209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4519  IS3 family transposase B  27.88 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000685336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4864  integrase catalytic subunit  27.27 
 
 		 279 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3301  integrase catalytic subunit  27.27 
 
 		 279 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0294  integrase catalytic subunit  26.67 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0170  transposase B  26.67 
 
 		 227 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000123124  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22320  Integrase, catalytic domain-containing protein  22.15 
 
 		 381 aa  59.3  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15790  Integrase, catalytic domain-containing protein  22.15 
 
 		 381 aa  59.3  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33550  transposase  22.15 
 
 		 381 aa  59.3  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50600  transposase  22.15 
 
 		 381 aa  59.3  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.138059  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21030  Integrase, catalytic domain-containing protein  22.15 
 
 		 381 aa  59.3  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.436118  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11320  Integrase, catalytic domain-containing protein  22.15 
 
 		 381 aa  59.3  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09100  Integrase, catalytic domain-containing protein  22.15 
 
 		 381 aa  59.3  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.387294  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1303  Integrase catalytic region  21.66 
 
 		 378 aa  57.8  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0789864  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1220  Integrase catalytic region  21.66 
 
 		 378 aa  57.8  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1250  Integrase catalytic region  21.66 
 
 		 378 aa  57.8  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3192  Integrase catalytic region  21.66 
 
 		 378 aa  57.8  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00354129  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1347  Integrase catalytic region  21.66 
 
 		 378 aa  57.8  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.519975  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0339  Integrase catalytic region  21.66 
 
 		 378 aa  57.8  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0433  Integrase catalytic region  21.66 
 
 		 378 aa  57.8  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.705419  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1705  Integrase catalytic region  21.66 
 
 		 378 aa  57.8  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1219  Integrase catalytic region  21.66 
 
 		 378 aa  57.8  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0109  integrase catalytic subunit  25.18 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2021  integrase catalytic subunit  25.18 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2783  integrase catalytic subunit  25.18 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.983973  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0735  integrase catalytic subunit  25.38 
 
 		 391 aa  55.8  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1525  Integrase catalytic region  22.73 
 
 		 391 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.88681  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7250  Integrase catalytic region  22.73 
 
 		 391 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186063  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0129  Integrase catalytic region  22.73 
 
 		 391 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162314  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0176  transposase, putative  22.3 
 
 		 320 aa  54.3  0.000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0541  putative transposase integrase  21.47 
 
 		 379 aa  54.3  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3643  putative transposase  21.47 
 
 		 379 aa  54.3  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4261  putative transposase  21.47 
 
 		 379 aa  54.3  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.234878 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4349  putative transposase  21.47 
 
 		 379 aa  54.3  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.732851  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4350  putative transposase  21.47 
 
 		 379 aa  54.3  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244718  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2546  integrase catalytic subunit  21.77 
 
 		 333 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303835  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3937  integrase catalytic subunit  21.77 
 
 		 333 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2591  integrase catalytic subunit  21.77 
 
 		 333 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4011  integrase catalytic subunit  21.77 
 
 		 333 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.141418  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3338  Integrase catalytic region  21.51 
 
 		 380 aa  53.1  0.000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.858997  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3720  integrase catalytic subunit  21.77 
 
 		 333 aa  53.1  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158828  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3793  integrase catalytic subunit  21.77 
 
 		 321 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.338369  normal  0.128891 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1602  Integrase catalytic region  25.39 
 
 		 607 aa  52.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.090134  normal  0.142555 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2014  Integrase catalytic region  26.7 
 
 		 297 aa  52.4  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0837  integrase catalytic subunit  23.6 
 
 		 382 aa  52  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.767179 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2320  integrase catalytic subunit  23.6 
 
 		 382 aa  52  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.801318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3288  integrase catalytic subunit  23.6 
 
 		 382 aa  52  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.672557  normal  0.734734 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0554  hypothetical protein  23.58 
 
 		 314 aa  51.6  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000279647 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4005  Integrase catalytic region  23.84 
 
 		 281 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795108  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0115  integrase catalytic subunit  23.9 
 
 		 231 aa  51.2  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0273  integrase catalytic subunit  23.9 
 
 		 231 aa  51.2  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0289  integrase catalytic subunit  23.9 
 
 		 231 aa  51.2  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1301  integrase catalytic subunit  23.9 
 
 		 231 aa  51.2  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2464  integrase catalytic subunit  23.6 
 
 		 382 aa  50.8  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3160  integrase catalytic subunit  23.6 
 
 		 382 aa  50.8  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.40278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3520  integrase catalytic subunit  22.78 
 
 		 392 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.674245  normal  0.0855075 
 
 
-
 
NC_002936  DET0166  ISDet2, transposase orfB  23.24 
 
 		 274 aa  50.1  0.00006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.101481  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2225  integrase, catalytic region  22.51 
 
 		 316 aa  50.1  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00213091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2918  integrase, catalytic region  22.45 
 
 		 316 aa  49.7  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1273  hypothetical protein  30.51 
 
 		 314 aa  49.7  0.00009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0999856 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1262  Integrase catalytic region  25.64 
 
 		 262 aa  49.7  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.632188  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0308  integrase, catalytic region  22.51 
 
 		 316 aa  49.3  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0481  integrase, catalytic region  22.51 
 
 		 316 aa  49.3  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1097  integrase, catalytic region  22.51 
 
 		 316 aa  49.3  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.495543  normal  0.303219 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1296  integrase, catalytic region  22.51 
 
 		 316 aa  49.3  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1717  integrase, catalytic region  22.51 
 
 		 316 aa  49.3  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0171721  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2818  integrase, catalytic region  22.51 
 
 		 316 aa  49.3  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2899  integrase, catalytic region  22.45 
 
 		 327 aa  49.3  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0219368 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1511  integrase catalytic subunit  21.54 
 
 		 341 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1534  integrase catalytic subunit  21.54 
 
 		 341 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0573  integrase catalytic subunit  23.42 
 
 		 597 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0336  Integrase catalytic region  24.62 
 
 		 385 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2543  Integrase catalytic region  25.17 
 
 		 280 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1167  integrase catalytic subunit  22.05 
 
 		 284 aa  48.9  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4799  Integrase catalytic region  24.62 
 
 		 385 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2192  Integrase catalytic region  24.59 
 
 		 270 aa  48.5  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1289  Integrase catalytic region  24.59 
 
 		 270 aa  48.5  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5439  integrase catalytic subunit  32.35 
 
 		 278 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.298779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0945a  transposase  21.29 
 
 		 276 aa  48.9  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.763205  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1236  Integrase catalytic region  24.59 
 
 		 270 aa  48.5  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2839  integrase, catalytic region  26.83 
 
 		 153 aa  47.8  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.489873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0603  integrase catalytic subunit  29.25 
 
 		 271 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1474  integrase catalytic subunit  25.76 
 
 		 250 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1721  integrase catalytic subunit  25.76 
 
 		 250 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1737  integrase catalytic subunit  25.76 
 
 		 250 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.524311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1753  integrase catalytic subunit  25.76 
 
 		 250 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.344033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1590  integrase catalytic subunit  25.76 
 
 		 250 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1664  integrase catalytic subunit  25.76 
 
 		 250 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.183363  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>