34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0569 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0569  hypothetical protein  100 
 
 		 931 aa  1895    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  unclonable  0.00000000706719  unclonable  6.43821e-20 
 
 
-
 
NC_002978  WD0382  hypothetical protein  26.78 
 
 		 1111 aa  88.6  6e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0836  hypothetical protein  28.62 
 
 		 1201 aa  85.1  0.000000000000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0919  gene transfer agent (GTA) like protein  25 
 
 		 1286 aa  84.3  0.000000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0253  hypothetical protein  29.45 
 
 		 1206 aa  82.4  0.00000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1646  hypothetical protein  23.9 
 
 		 1483 aa  75.1  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.734787 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1181  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  25.18 
 
 		 1285 aa  74.7  0.000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1426  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  26.79 
 
 		 1284 aa  72.8  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1824  gene transfer agent (GTA) orfg15  24.06 
 
 		 1280 aa  65.9  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51325  normal  0.391339 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0792  gene transfer agent (GTA) like protein  23.38 
 
 		 1313 aa  62  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.780926 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3901  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  24.6 
 
 		 1279 aa  60.1  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.75252  normal  0.0322249 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1993  gene transfer agent (GTA) orfg15  24.94 
 
 		 1283 aa  59.3  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.263252  normal  0.679187 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2887  putative phage host specificity protein  24.6 
 
 		 1296 aa  58.9  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0568102  normal  0.211291 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1414  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  25.56 
 
 		 1300 aa  58.9  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.186863  normal  0.0805686 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1072  hypothetical protein  25.08 
 
 		 1306 aa  58.5  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0995947 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0933  gene transfer agent (GTA) orfg15  28.29 
 
 		 1252 aa  57.8  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.264711 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3077  gene transfer agent (GTA) like protein  24.84 
 
 		 996 aa  56.6  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.759421  normal  0.242623 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1418  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  25.75 
 
 		 1302 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170545  normal  0.0550012 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1354  gene transfer agent (GTA) orfg15  24.14 
 
 		 1263 aa  55.8  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.678989  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0270  gene transfer agent (GTA) like protein  23.91 
 
 		 1339 aa  55.5  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.67619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3458  gene transfer agent (GTA) orfg15  24.57 
 
 		 1297 aa  54.7  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384127  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0600  hypothetical protein  23.42 
 
 		 1287 aa  53.9  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1692  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  26.49 
 
 		 1302 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.281256  normal  0.701211 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4980  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  25.09 
 
 		 1302 aa  52.4  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661116 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1144  putative phage host specificity protein  23.45 
 
 		 1296 aa  51.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5975  gene transfer agent (GTA) like protein  22.06 
 
 		 1301 aa  50.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.161454 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2479  putative phage host specificity protein  22.01 
 
 		 1296 aa  49.7  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3714  hypothetical protein  20.98 
 
 		 1117 aa  48.9  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2163  hypothetical protein  25.58 
 
 		 1305 aa  48.5  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2122  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  24.22 
 
 		 1290 aa  46.2  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0264351  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2599  gene transfer agent (GTA) like protein  21.48 
 
 		 1301 aa  46.2  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6574  gene transfer agent (GTA) like protein  21.94 
 
 		 1300 aa  46.2  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2012  gene transfer agent (GTA) like protein  21.68 
 
 		 1300 aa  45.1  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190757  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7312  gene transfer agent (GTA) like protein  21.74 
 
 		 1300 aa  44.7  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>