119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1293 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1293  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  100 
 
 		 405 aa  803    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.295988  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2628  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  30.02 
 
 		 503 aa  100  6e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.344262  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2155  Ferric reductase NAD binding protein  33.57 
 
 		 523 aa  87.4  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.153422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2361  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  26.9 
 
 		 514 aa  79.3  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000108659 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0157  ferredoxin-NADP reductase  26.69 
 
 		 248 aa  61.2  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0172  ferredoxin-NADP reductase  25.5 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.860143  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4802  ferredoxin-NADP reductase  27.31 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000567342 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1284  oxidoreductase FAD-binding subunit  39.52 
 
 		 355 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.487171  normal  0.0700111 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0090  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  34.23 
 
 		 494 aa  55.1  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4640  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  26.41 
 
 		 278 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.687921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0792  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  25.71 
 
 		 258 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.367112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3739  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  27.64 
 
 		 419 aa  54.7  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1258  oxidoreductase FAD-binding region  38.71 
 
 		 355 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.514562  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1275  oxidoreductase FAD-binding subunit  38.71 
 
 		 355 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.382937  normal  0.699268 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3067  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  26.77 
 
 		 246 aa  54.7  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3391  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  39.05 
 
 		 242 aa  53.5  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00300696  normal  0.0908673 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1577  putative ferredoxin oxidoreductase protein  32.1 
 
 		 418 aa  53.1  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1929  ferric reductase-like transmembrane component-like  32.79 
 
 		 425 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0106  ferredoxin-NADP reductase  25 
 
 		 248 aa  52.8  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0099  ferredoxin-NADP reductase  25.55 
 
 		 248 aa  52.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0098  ferredoxin-NADP reductase  25.55 
 
 		 248 aa  52.4  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4115  ferredoxin-NADP reductase  25.55 
 
 		 248 aa  52.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03522  nitric oxide oxidoreductase (Eurofung)  24.9 
 
 		 426 aa  52  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4646  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  25.54 
 
 		 258 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2874  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  32.59 
 
 		 447 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4508  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  25.97 
 
 		 284 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4049  ferredoxin-NADP reductase  26.29 
 
 		 248 aa  51.2  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0104  ferredoxin--NADP(+) reductase  27.04 
 
 		 269 aa  51.2  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.459538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5071  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.76 
 
 		 414 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407916  hitchhiker  0.00354835 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5259  putative oxidoreductase  25.76 
 
 		 258 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5247  ferredoxin  27.18 
 
 		 366 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3098  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  27.44 
 
 		 336 aa  50.4  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0663  ferredoxin--NADP reductase  26.05 
 
 		 260 aa  50.1  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0650463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0653  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  29.56 
 
 		 402 aa  50.1  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2329  flavohemoglobin  28.92 
 
 		 395 aa  49.7  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.32871 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6582  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  27.63 
 
 		 341 aa  49.7  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10458  normal  0.992183 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0253  globin  27.81 
 
 		 402 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0901  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  32.12 
 
 		 261 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.19999  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3805  ferredoxin-NADP reductase  24.89 
 
 		 247 aa  49.3  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.100847  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2649  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  27.59 
 
 		 402 aa  49.3  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0504658 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4413  ferredoxin-NADP reductase  26.18 
 
 		 248 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4330  ferredoxin-NADP reductase  26.18 
 
 		 248 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3266  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  25.87 
 
 		 270 aa  48.5  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.298678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3338  flavohemoprotein  29.45 
 
 		 402 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3520  ferredoxin  32.18 
 
 		 351 aa  48.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1032  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  24.52 
 
 		 271 aa  48.5  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.799175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3293  flavohemoprotein  29.45 
 
 		 402 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1353  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.75 
 
 		 848 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.155715  normal  0.293689 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3622  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  30 
 
 		 371 aa  48.9  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4415  ferredoxin-NADP reductase  26.18 
 
 		 248 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.01657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4300  ferredoxin-NADP reductase  26.18 
 
 		 248 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4483  ferredoxin-NADP reductase  26.18 
 
 		 248 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.896178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0627  globin  28.48 
 
 		 402 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.286968  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3813  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  24.9 
 
 		 428 aa  47.8  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0737  globin  27.27 
 
 		 402 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.069446  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3326  flavohemoprotein  29.45 
 
 		 399 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000871976  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3009  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  33.06 
 
 		 254 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6290  oxidoreductase FAD-binding region  31.21 
 
 		 250 aa  47.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353105  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0845  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  25.51 
 
 		 740 aa  47.4  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3240  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  26.43 
 
 		 342 aa  47.4  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.171038 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1346  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  31.55 
 
 		 686 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.806534  normal  0.147049 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1003  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  26.55 
 
 		 232 aa  47.4  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0767171 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2269  ferredoxin  28.78 
 
 		 360 aa  47  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2316  ferredoxin  28.78 
 
 		 360 aa  47  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2053  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  26.52 
 
 		 229 aa  46.6  0.0008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000007683  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1265  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  32.03 
 
 		 338 aa  46.6  0.0008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0652  NQR2 and RnfD family protein  25.98 
 
 		 295 aa  46.6  0.0008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.114634  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0705  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  26.07 
 
 		 402 aa  46.6  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.727633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1326  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  31.65 
 
 		 337 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7048  benzoate 1,2-dioxygenase ferredoxin reductase subunit  26.75 
 
 		 340 aa  46.2  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268276 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1294  flavohemoprotein  28.12 
 
 		 402 aa  45.8  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1179  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  25.68 
 
 		 342 aa  45.8  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6297  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  27.63 
 
 		 341 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170872 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3723  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  25.16 
 
 		 358 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2417  flavohemoprotein  28.83 
 
 		 402 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4277  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  23.58 
 
 		 258 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.200654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1104  hypothetical protein  29.13 
 
 		 234 aa  45.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0241757  normal  0.525247 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3823  hemoglobin-like flavoprotein  25.86 
 
 		 402 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1304  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  27.19 
 
 		 340 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6526  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  27.19 
 
 		 340 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2786  ferredoxin  27.05 
 
 		 320 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224579  normal  0.0721764 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0334  flavohemoprotein  28.83 
 
 		 402 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4058  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.41 
 
 		 383 aa  45.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0362952  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1195  flavohemoprotein  28.83 
 
 		 402 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.699532  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4965  ferredoxin  27.05 
 
 		 320 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.222707  normal  0.0138132 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2605  flavohemoprotein  28.83 
 
 		 402 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0752  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  24.12 
 
 		 258 aa  45.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5577  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.6 
 
 		 261 aa  45.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1957  Pdr/VanB family oxidoreductase  30.3 
 
 		 317 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.334574  hitchhiker  0.000300419 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4642  ferredoxin--NADP reductase  22.86 
 
 		 258 aa  45.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0597  ferredoxin--NADP(+) reductase  22.89 
 
 		 276 aa  44.7  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1371  oxidoreductase FAD-binding region  31.97 
 
 		 881 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.651375  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1389  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.97 
 
 		 881 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0387303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4632  ferredoxin  32.54 
 
 		 316 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0189827  normal  0.0263883 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2076  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.41 
 
 		 372 aa  44.7  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.439057  normal  0.29411 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2219  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.28 
 
 		 363 aa  44.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.217987  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4500  ferredoxin  32.54 
 
 		 316 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.125259  normal  0.496442 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1366  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  27.94 
 
 		 342 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0161467  normal  0.193638 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0319  ferredoxin  32 
 
 		 346 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220078  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0329  ferredoxin  32 
 
 		 346 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.106229 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>