More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2628 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2628  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  100 
 
 		 503 aa  992    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.344262  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2361  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  72.4 
 
 		 514 aa  631  1e-180  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000108659 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2155  Ferric reductase NAD binding protein  38.46 
 
 		 523 aa  225  1e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.153422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1293  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  30.26 
 
 		 405 aa  114  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.295988  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1895  nitric oxide dioxygenase  40.15 
 
 		 419 aa  77.8  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00231107  normal  0.14211 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3408  nitric oxide dioxygenase  35.33 
 
 		 393 aa  76.3  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2076  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.58 
 
 		 372 aa  75.1  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.439057  normal  0.29411 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1593  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  33.87 
 
 		 456 aa  73.6  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000201002  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1304  nitric oxide dioxygenase  32.93 
 
 		 393 aa  68.6  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2333  nitric oxide dioxygenase  31.33 
 
 		 393 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51090  nitric oxide dioxygenase  33.33 
 
 		 393 aa  68.2  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.901992  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0190  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  33.17 
 
 		 393 aa  67.8  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1593  putative ferredoxin NAD(+) reductase  30.7 
 
 		 332 aa  67.8  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655318  normal  0.685768 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1711  ferredoxin  29.73 
 
 		 372 aa  67.4  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2412  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.13 
 
 		 367 aa  67.4  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010936  hitchhiker  0.0000737899 
 
 
-
 
NC_004310  BR1462  NADH oxidoreductase, putative  29.41 
 
 		 372 aa  67.4  0.0000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.345138  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2770  nitric oxide dioxygenase  30 
 
 		 394 aa  67.4  0.0000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3579  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  34.39 
 
 		 318 aa  67  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147796  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2535  nitric oxide dioxygenase  30.12 
 
 		 393 aa  66.6  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4026  nitric oxide dioxygenase  32.84 
 
 		 393 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.874831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6164  nitric oxide dioxygenase  31.3 
 
 		 393 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3879  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  27.71 
 
 		 249 aa  65.5  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.714131 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2219  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.01 
 
 		 363 aa  65.9  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.217987  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1230  nitric oxide dioxygenase  28.39 
 
 		 396 aa  65.1  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3398  flavohemoprotein (hemoglobin-like) transmembrane  34.56 
 
 		 401 aa  65.1  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1093  nitric oxide dioxygenase  30.9 
 
 		 394 aa  64.7  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284648  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29640  nitric oxide dioxygenase  29.52 
 
 		 393 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1258  oxidoreductase FAD-binding region  32.06 
 
 		 355 aa  64.3  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.514562  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1275  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.06 
 
 		 355 aa  64.3  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.382937  normal  0.699268 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1284  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.58 
 
 		 355 aa  63.5  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.487171  normal  0.0700111 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2869  putative phenylacetic acid degradation NADH oxidoreductase paaE  28.57 
 
 		 337 aa  63.5  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423535  normal  0.236927 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0536  hypothetical protein  27.67 
 
 		 244 aa  62.8  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3449  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  35.12 
 
 		 399 aa  62.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0539765  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6146  ferric reductase domain protein with transmembrane component domain  31.28 
 
 		 450 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal  0.0480291 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003800  NADH oxidoreductase Hcr  28.64 
 
 		 351 aa  62.4  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3454  ferredoxin  34.78 
 
 		 309 aa  62  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.246796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0896  iron-sulfur cluster-binding protein  28.77 
 
 		 356 aa  62  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2477  ferredoxin  29.58 
 
 		 379 aa  62  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.949989 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1367  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  33.74 
 
 		 347 aa  61.2  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0808  nitric oxide dioxygenase  33.33 
 
 		 392 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4141  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  32.88 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.482707  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3639  nitric oxide dioxygenase  25.32 
 
 		 396 aa  60.5  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5060  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  29.44 
 
 		 366 aa  60.5  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1181  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  35.33 
 
 		 676 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.169829 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1353  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.34 
 
 		 848 aa  60.1  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.155715  normal  0.293689 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3159  ferredoxin  35.57 
 
 		 322 aa  60.1  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3397  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.45 
 
 		 375 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3287  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  33.09 
 
 		 401 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.888577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0687  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  32.56 
 
 		 360 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.475559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0935  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  26.84 
 
 		 251 aa  59.7  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3608  oxidoreductase FAD-binding subunit  25.44 
 
 		 403 aa  59.7  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3609  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  33.09 
 
 		 401 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4481  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.58 
 
 		 384 aa  59.7  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0512  hypothetical protein  27.04 
 
 		 244 aa  58.9  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1003  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  25 
 
 		 232 aa  58.9  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0767171 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3045  nitric oxide dioxygenase  26.62 
 
 		 396 aa  58.9  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.55248  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4049  ferredoxin-NADP reductase  28.06 
 
 		 248 aa  58.9  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1362  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  24.79 
 
 		 430 aa  59.3  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.274375 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1627  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.78 
 
 		 346 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0724046 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2269  ferredoxin  28.88 
 
 		 360 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0847  nitric oxide dioxygenase  29.52 
 
 		 392 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2316  ferredoxin  28.88 
 
 		 360 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0832  nitric oxide dioxygenase  33.33 
 
 		 392 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2125  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.94 
 
 		 765 aa  58.5  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517485  normal  0.766307 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1726  phthalate 4,5-dioxygenase  33.33 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.53937  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22450  cytochrome P450  37.32 
 
 		 775 aa  58.5  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1163  oxidoreductase, FAD-binding  33.99 
 
 		 678 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.832333  normal  0.0131556 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4042  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  29.67 
 
 		 375 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1261  ferredoxin  27.12 
 
 		 365 aa  58.2  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.48547  hitchhiker  0.000283754 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0049  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  29.89 
 
 		 453 aa  58.2  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.19928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0982  ferredoxin I  26.96 
 
 		 362 aa  57.8  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2882  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.03 
 
 		 341 aa  57.4  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.07552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1371  oxidoreductase FAD-binding region  35.53 
 
 		 881 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.651375  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1389  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.53 
 
 		 881 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0387303  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4061  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  27.04 
 
 		 248 aa  57  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5247  ferredoxin  27.81 
 
 		 366 aa  57  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13259  oxidoreductase  28.37 
 
 		 380 aa  57  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.637455 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4155  ferredoxin-NADP reductase  27.04 
 
 		 248 aa  57  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4094  ferredoxin-NADP reductase  27.04 
 
 		 248 aa  57  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02792  phenol hydroxylase  28.57 
 
 		 235 aa  57  0.0000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00087  nitric oxide dioxygenase  24.66 
 
 		 394 aa  56.2  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2337  hypothetical protein  23.7 
 
 		 627 aa  56.6  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0368  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  29.09 
 
 		 349 aa  56.6  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000152179  unclonable  0.0000000536211 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3236  xylene monooxygenase electron transfer component  25 
 
 		 232 aa  56.2  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.150181  normal  0.120889 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6878  molybdopterin oxidoreductase  29.52 
 
 		 1148 aa  56.6  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0354139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1157  nitric oxide dioxygenase  28.26 
 
 		 396 aa  56.2  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0210523  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0289  putative iron-sulfur oxidoreductase, beta subunit  39.01 
 
 		 316 aa  56.6  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.600768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1092  globin  29.55 
 
 		 395 aa  56.6  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1264  nitric oxide dioxygenase  28.26 
 
 		 396 aa  56.2  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000151252  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3747  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.71 
 
 		 375 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.225631 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0446  nitric oxide dioxygenase  28.26 
 
 		 396 aa  56.2  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000301017  hitchhiker  0.00000364036 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1179  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  32.37 
 
 		 342 aa  56.2  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1405  oxidoreductase FAD-binding subunit  36 
 
 		 881 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4364  ferredoxin-NADP reductase  27.55 
 
 		 248 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.563754 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4330  ferredoxin-NADP reductase  28.57 
 
 		 248 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4300  ferredoxin-NADP reductase  28.57 
 
 		 248 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4406  ferredoxin-NADP reductase  31.43 
 
 		 248 aa  55.8  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1828  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  27.56 
 
 		 362 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.488384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0452  oxidoreductase FAD-binding protein  27.44 
 
 		 393 aa  55.8  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.366761  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4458  ferredoxin-NADP reductase  31.43 
 
 		 248 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>