More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2219 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2219  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  100 
 
 		 588 aa  1214    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1341  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  81.52 
 
 		 330 aa  557  1e-157  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000434756  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3343  transposase, IS605 OrfB family  90.76 
 
 		 351 aa  457  1e-127  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2840  transposase, IS605 OrfB family  88.24 
 
 		 351 aa  451  1e-125  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2549  transposase, IS605 OrfB family  89.5 
 
 		 400 aa  451  1e-125  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1982  transposase, IS605 OrfB family  88.66 
 
 		 351 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2374  transposase, IS605 OrfB family  88.66 
 
 		 351 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2685  transposase, IS605 OrfB family  87.39 
 
 		 351 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1635  transposase, IS605 OrfB family  88.66 
 
 		 351 aa  424  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1612  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  55.62 
 
 		 331 aa  354  2.9999999999999997e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000615843  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01969  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  51.06 
 
 		 329 aa  343  4e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0178  YhdH/YhfP family quinone oxidoreductase  55.18 
 
 		 326 aa  341  2.9999999999999998e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000873043  normal  0.604397 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1202  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  52.58 
 
 		 331 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3700  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  53.87 
 
 		 327 aa  337  2.9999999999999997e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3572  alcohol dehydrogenase  51.07 
 
 		 326 aa  335  1e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0181  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  52.74 
 
 		 334 aa  332  8e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2440  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  49.56 
 
 		 348 aa  331  2e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2394  quinone oxidoreductase putative, YhdH/YhfP  49.56 
 
 		 348 aa  331  2e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1505  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase  51.07 
 
 		 330 aa  329  1.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5139  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  49.24 
 
 		 328 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0804  alcohol dehydrogenase  52.44 
 
 		 334 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2364  dehydrogenase NAD(P)-binding domain-containing protein  50.76 
 
 		 328 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.214717 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1962  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  49.09 
 
 		 330 aa  327  5e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.204015  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2214  alcohol dehydrogenase  51.53 
 
 		 331 aa  326  6e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0877  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  50.3 
 
 		 332 aa  326  7e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.128187  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2535  zinc-binding alcohol dehydrogenase  51.23 
 
 		 336 aa  326  7e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351283  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3877  quinone oxidoreductase  52.44 
 
 		 332 aa  325  2e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.161114  normal  0.0453412 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0695  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  50.91 
 
 		 332 aa  325  2e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00215673  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2154  alcohol dehydrogenase  50 
 
 		 326 aa  325  2e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.573953  normal  0.0933085 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0879  putative quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  49.39 
 
 		 332 aa  324  3e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.85611e-27 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0681  alcohol dehydrogenase, zinc containing  49.7 
 
 		 332 aa  323  4e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4337  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  51.06 
 
 		 329 aa  323  4e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270219  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3502  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  50 
 
 		 328 aa  323  4e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.990659  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0271  alcohol dehydrogenase  49.85 
 
 		 326 aa  323  5e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000478762 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0771  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  52.45 
 
 		 335 aa  323  6e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.999993  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0250  alcohol dehydrogenase  49.39 
 
 		 326 aa  323  6e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0254  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  49.08 
 
 		 326 aa  323  6e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000117637 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0272  quinone oxidoreductase  48.93 
 
 		 326 aa  323  6e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000568585 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3530  alcohol dehydrogenase  49.08 
 
 		 326 aa  323  6e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001990  alcohol dehydrogenase  50.76 
 
 		 326 aa  323  6e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2231  alcohol dehydrogenase  49.69 
 
 		 326 aa  323  8e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.499373  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4187  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  52.13 
 
 		 332 aa  322  9.000000000000001e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0747  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  49.39 
 
 		 332 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0784  alcohol dehydrogenase  49.39 
 
 		 332 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0841407  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00458  alcohol dehydrogenase  50.46 
 
 		 326 aa  320  3e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0947  putative quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  49.09 
 
 		 332 aa  320  3e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000079706  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4477  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  48.62 
 
 		 327 aa  320  3.9999999999999996e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000206096 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3941  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  49.69 
 
 		 326 aa  320  5e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0255  quinone oxidoreductase  49.39 
 
 		 326 aa  319  7e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1035  alcohol dehydrogenase  50.31 
 
 		 326 aa  319  7e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0163  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  51.69 
 
 		 335 aa  320  7e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0129955 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4334  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  50.91 
 
 		 334 aa  318  1e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.511675  normal  0.564887 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3443  quinone oxidoreductase  49.23 
 
 		 324 aa  319  1e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378871  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0454  quinone oxidoreductase  49.23 
 
 		 324 aa  319  1e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0267753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1108  alcohol dehydrogenase  48.94 
 
 		 328 aa  318  2e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.588532  normal  0.604429 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3679  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  49.39 
 
 		 326 aa  318  2e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0862676  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4497  putative quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  49.39 
 
 		 332 aa  317  3e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0178815  hitchhiker  0.00000000000130084 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0252  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  48.77 
 
 		 326 aa  317  3e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03112  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  48.92 
 
 		 324 aa  317  4e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0728423  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0454  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  48.92 
 
 		 324 aa  317  4e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.749607  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3737  quinone oxidoreductase  48.62 
 
 		 324 aa  317  4e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000296751  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4569  quinone oxidoreductase, YhdH family  48.62 
 
 		 324 aa  317  4e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000284525  normal  0.204185 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2634  zinc-binding alcohol dehydrogenase  50.46 
 
 		 325 aa  317  4e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.341992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3548  quinone oxidoreductase  48.92 
 
 		 324 aa  317  4e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000395647  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18460  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  49.85 
 
 		 327 aa  317  4e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03063  hypothetical protein  48.92 
 
 		 324 aa  317  4e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0710671  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2846  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  51.22 
 
 		 328 aa  316  9e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0354021  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2639  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.32 
 
 		 345 aa  316  9e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.718234  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1314  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  50.92 
 
 		 336 aa  316  9e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0952218  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2504  alcohol dehydrogenase  50.3 
 
 		 326 aa  316  9e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0137334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3835  quinone oxidoreductase  50.76 
 
 		 328 aa  316  9.999999999999999e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3285  quinone oxidoreductase, YhdH family  48.31 
 
 		 324 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00682496  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1443  zinc-binding alcohol dehydrogenase  51.22 
 
 		 331 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.109309  normal  0.103295 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2995  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  49.85 
 
 		 331 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00123098  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1416  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  50.92 
 
 		 336 aa  315  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40830  putative oxidoreductase  50.45 
 
 		 330 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4413  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  50.61 
 
 		 325 aa  314  2.9999999999999996e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00493012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1419  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  52.16 
 
 		 328 aa  314  3.9999999999999997e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2529  alcohol dehydrogenase  48.78 
 
 		 329 aa  314  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.180197  normal  0.304132 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2319  putative quinone oxidoreductase  51.23 
 
 		 328 aa  314  3.9999999999999997e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.721374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2365  quinone oxidoreductase  50.61 
 
 		 328 aa  313  6.999999999999999e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0808  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  50.46 
 
 		 327 aa  312  9e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1230  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.33 
 
 		 328 aa  312  9e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.606644 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0839  putative quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  50 
 
 		 331 aa  311  1e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000366963  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3408  alcohol dehydrogenase  48.16 
 
 		 327 aa  312  1e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1210  alcohol dehydrogenase  50.15 
 
 		 328 aa  312  1e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.783737  normal  0.219465 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4991  alcohol dehydrogenase  50.46 
 
 		 328 aa  311  2e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3461  putative oxidoreductase  50.15 
 
 		 330 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2477  acyl-CoA dehydrogenase-like  51.6 
 
 		 738 aa  311  2.9999999999999997e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.193974  normal  0.0198771 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3679  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  48.18 
 
 		 329 aa  310  5e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1264  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  49.85 
 
 		 336 aa  310  5.9999999999999995e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2493  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.24 
 
 		 326 aa  310  6.999999999999999e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3689  alcohol dehydrogenase  48.16 
 
 		 324 aa  309  6.999999999999999e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0316802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1526  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  49.23 
 
 		 327 aa  309  6.999999999999999e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1643  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.61 
 
 		 327 aa  309  8e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.561484  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3205  alcohol dehydrogenase  52.32 
 
 		 331 aa  309  9e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147594 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0359  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  48.92 
 
 		 327 aa  309  9e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000624901 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4779  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  50.46 
 
 		 325 aa  309  9e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.279047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2819  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  51.08 
 
 		 327 aa  309  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2046  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  50.46 
 
 		 333 aa  309  1.0000000000000001e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>