More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01969 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01969  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  100 
 
 		 329 aa  666    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2995  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  63 
 
 		 331 aa  436  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00123098  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2214  alcohol dehydrogenase  63.5 
 
 		 331 aa  432  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0181  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  63.19 
 
 		 334 aa  426  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0771  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  63.11 
 
 		 335 aa  413  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.999993  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0163  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  61.42 
 
 		 335 aa  413  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0129955 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0877  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  60.67 
 
 		 332 aa  401  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.128187  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0695  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  59.76 
 
 		 332 aa  401  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00215673  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0804  alcohol dehydrogenase  59.82 
 
 		 334 aa  403  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1110  alcohol dehydrogenase  58.84 
 
 		 331 aa  402  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.346069  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4497  putative quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  59.45 
 
 		 332 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0178815  hitchhiker  0.00000000000130084 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0681  alcohol dehydrogenase, zinc containing  60.06 
 
 		 332 aa  397  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0947  putative quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  59.15 
 
 		 332 aa  395  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000079706  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0747  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  59.45 
 
 		 332 aa  392  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0784  alcohol dehydrogenase  59.45 
 
 		 332 aa  392  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0841407  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0879  putative quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  59.45 
 
 		 332 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.85611e-27 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0839  putative quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  59.76 
 
 		 331 aa  387  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000366963  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1356  putative NADPH:quinone reductase/ Zn-dependent oxidoreductase  56.88 
 
 		 353 aa  378  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2529  alcohol dehydrogenase  55.62 
 
 		 329 aa  377  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.180197  normal  0.304132 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3461  putative oxidoreductase  54.1 
 
 		 330 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1510  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  56.13 
 
 		 331 aa  376  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40830  putative oxidoreductase  54.41 
 
 		 330 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5875  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  56.62 
 
 		 332 aa  372  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0754792  normal  0.429902 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1307  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  50.76 
 
 		 333 aa  360  2e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1264  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  52.74 
 
 		 336 aa  358  6e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1341  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  51.82 
 
 		 330 aa  344  1e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000434756  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1784  zinc-binding alcohol dehydrogenase  50.31 
 
 		 326 aa  344  1e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0104845 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2219  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  51.06 
 
 		 588 aa  343  2e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2957  zinc-binding alcohol dehydrogenase  50 
 
 		 335 aa  339  5e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0018  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.39 
 
 		 334 aa  338  5.9999999999999996e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000105442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0011  Zinc-containing alcohol dehydrogenase  49.24 
 
 		 334 aa  332  6e-90  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000787082 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4477  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  47.55 
 
 		 327 aa  303  3.0000000000000004e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000206096 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0250  alcohol dehydrogenase  46.79 
 
 		 326 aa  297  2e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0254  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  46.18 
 
 		 326 aa  295  5e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000117637 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4779  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  46.63 
 
 		 325 aa  295  9e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.279047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2535  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.01 
 
 		 336 aa  295  9e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351283  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0252  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  46.79 
 
 		 326 aa  294  1e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0178  YhdH/YhfP family quinone oxidoreductase  48.02 
 
 		 326 aa  295  1e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000873043  normal  0.604397 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3530  alcohol dehydrogenase  47.4 
 
 		 326 aa  294  2e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0272  quinone oxidoreductase  48.93 
 
 		 326 aa  294  2e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000568585 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0255  quinone oxidoreductase  46.18 
 
 		 326 aa  293  3e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3443  quinone oxidoreductase  46.93 
 
 		 324 aa  293  4e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378871  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0454  quinone oxidoreductase  46.93 
 
 		 324 aa  293  4e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0267753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3548  quinone oxidoreductase  46.63 
 
 		 324 aa  292  5e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000395647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2154  alcohol dehydrogenase  46.79 
 
 		 326 aa  292  5e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.573953  normal  0.0933085 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03112  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  46.93 
 
 		 324 aa  292  6e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0728423  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0454  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  46.93 
 
 		 324 aa  292  6e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.749607  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2364  dehydrogenase NAD(P)-binding domain-containing protein  46.5 
 
 		 328 aa  292  6e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.214717 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03063  hypothetical protein  46.93 
 
 		 324 aa  292  6e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0710671  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4569  quinone oxidoreductase, YhdH family  46.63 
 
 		 324 aa  291  8e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000284525  normal  0.204185 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3737  quinone oxidoreductase  46.63 
 
 		 324 aa  291  8e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000296751  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2231  alcohol dehydrogenase  46.48 
 
 		 326 aa  290  2e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.499373  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3285  quinone oxidoreductase, YhdH family  46.32 
 
 		 324 aa  290  3e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00682496  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1586  alcohol dehydrogenase  45.57 
 
 		 330 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2475  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  45.87 
 
 		 329 aa  288  7e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1229  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.24 
 
 		 342 aa  287  1e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.157055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5139  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  44.98 
 
 		 328 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1505  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase  43.08 
 
 		 330 aa  286  4e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2493  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.48 
 
 		 326 aa  286  4e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3941  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  46.48 
 
 		 326 aa  286  5e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3700  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  46.32 
 
 		 327 aa  285  5e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00458  alcohol dehydrogenase  46.48 
 
 		 326 aa  286  5e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3674  hypothetical protein  45.4 
 
 		 324 aa  285  5.999999999999999e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0677066  normal  0.330413 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4413  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  45.4 
 
 		 325 aa  285  9e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00493012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3567  protein YhdH  45.09 
 
 		 324 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000716793  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3568  protein YhdH  45.09 
 
 		 324 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.408975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3639  hypothetical protein  45.09 
 
 		 324 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000530088 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001990  alcohol dehydrogenase  45.87 
 
 		 326 aa  285  1.0000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3736  hypothetical protein  45.09 
 
 		 324 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0213449 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4991  alcohol dehydrogenase  45.71 
 
 		 328 aa  284  2.0000000000000002e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2639  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.73 
 
 		 345 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.718234  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1035  alcohol dehydrogenase  46.48 
 
 		 326 aa  283  3.0000000000000004e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0271  alcohol dehydrogenase  47.59 
 
 		 326 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000478762 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3205  alcohol dehydrogenase  46.18 
 
 		 331 aa  282  6.000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147594 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0766  alcohol dehydrogenase  44.79 
 
 		 327 aa  281  8.000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1230  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.68 
 
 		 328 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.606644 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1108  alcohol dehydrogenase  44.38 
 
 		 328 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.588532  normal  0.604429 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3408  alcohol dehydrogenase  44.82 
 
 		 327 aa  280  2e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0556  alcohol dehydrogenase  45.57 
 
 		 328 aa  279  4e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2046  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.85 
 
 		 333 aa  279  6e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2319  putative quinone oxidoreductase  43.25 
 
 		 328 aa  278  6e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.721374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3572  alcohol dehydrogenase  46.18 
 
 		 326 aa  278  6e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1416  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  45.4 
 
 		 336 aa  279  6e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1314  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  45.09 
 
 		 336 aa  279  6e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0952218  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1419  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  46.23 
 
 		 328 aa  276  3e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1443  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.38 
 
 		 331 aa  276  4e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.109309  normal  0.103295 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1202  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.77 
 
 		 331 aa  275  9e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3346  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  45.4 
 
 		 328 aa  275  9e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.584462  normal  0.149022 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2378  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.31 
 
 		 334 aa  274  1.0000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.648384 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1223  quinone oxidoreductase  43.52 
 
 		 328 aa  273  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3502  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  43.47 
 
 		 328 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.990659  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0082  alcohol dehydrogenase  45.09 
 
 		 326 aa  273  3e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0838693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4187  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  45.02 
 
 		 332 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4748  oxidoreductase, zinc-binding  44.14 
 
 		 327 aa  272  5.000000000000001e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3877  quinone oxidoreductase  45.02 
 
 		 332 aa  272  6e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.161114  normal  0.0453412 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1474  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  44.17 
 
 		 331 aa  272  6e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3519  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  44.82 
 
 		 330 aa  272  7e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.231356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2477  acyl-CoA dehydrogenase-like  45.13 
 
 		 738 aa  272  7e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.193974  normal  0.0198771 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1567  alcohol dehydrogenase  47.58 
 
 		 332 aa  271  8.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1612  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  40.73 
 
 		 331 aa  271  8.000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000615843  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>