More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0771 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0771  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  100 
 
 
335 aa  665    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.999993  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0804  alcohol dehydrogenase  83.89 
 
 
334 aa  556  1e-157  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2214  alcohol dehydrogenase  76.97 
 
 
331 aa  509  1e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2995  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  66.97 
 
 
331 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00123098  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0181  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  64.83 
 
 
334 aa  427  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01969  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  63.11 
 
 
329 aa  413  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1110  alcohol dehydrogenase  61.4 
 
 
331 aa  409  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.346069  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0163  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  62.77 
 
 
335 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0129955 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0877  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  57.93 
 
 
332 aa  381  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.128187  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0695  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  57.58 
 
 
332 aa  380  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00215673  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4497  putative quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  57.01 
 
 
332 aa  377  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0178815  hitchhiker  0.00000000000130084 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0681  alcohol dehydrogenase, zinc containing  57.62 
 
 
332 aa  376  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0747  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  56.71 
 
 
332 aa  368  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0879  putative quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  56.71 
 
 
332 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.85611e-27 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0784  alcohol dehydrogenase  56.71 
 
 
332 aa  368  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0841407  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0947  putative quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  55.49 
 
 
332 aa  368  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000079706  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1356  putative NADPH:quinone reductase/ Zn-dependent oxidoreductase  57.06 
 
 
353 aa  365  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1307  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  51.23 
 
 
333 aa  363  3e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0839  putative quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  56.1 
 
 
331 aa  352  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000366963  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3461  putative oxidoreductase  55.21 
 
 
330 aa  352  5e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1510  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  54.55 
 
 
331 aa  351  1e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2529  alcohol dehydrogenase  55.49 
 
 
329 aa  350  2e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.180197  normal  0.304132 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40830  putative oxidoreductase  55.21 
 
 
330 aa  350  3e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1264  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  55.49 
 
 
336 aa  347  1e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5875  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  53.54 
 
 
332 aa  335  7.999999999999999e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0754792  normal  0.429902 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1341  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  51.52 
 
 
330 aa  330  2e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000434756  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1784  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.69 
 
 
326 aa  328  1.0000000000000001e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0104845 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2219  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  52.45 
 
 
588 aa  323  3e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0018  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.8 
 
 
334 aa  321  9.000000000000001e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000105442  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0011  Zinc-containing alcohol dehydrogenase  48.8 
 
 
334 aa  320  3e-86  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000787082 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2957  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.27 
 
 
335 aa  301  9e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4779  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  50 
 
 
325 aa  295  6e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.279047  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0178  YhdH/YhfP family quinone oxidoreductase  50.92 
 
 
326 aa  292  6e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000873043  normal  0.604397 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4477  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  47.24 
 
 
327 aa  292  7e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000206096 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1229  zinc-binding alcohol dehydrogenase  51.83 
 
 
342 aa  289  5.0000000000000004e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.157055  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2475  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  47.87 
 
 
329 aa  286  2e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4639  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  54.75 
 
 
332 aa  286  2.9999999999999996e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.316613  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1505  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase  47.4 
 
 
330 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1612  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  46.01 
 
 
331 aa  286  4e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000615843  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0309  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.85 
 
 
328 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0556  alcohol dehydrogenase  48.93 
 
 
328 aa  285  1.0000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1675  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  48.77 
 
 
327 aa  283  4.0000000000000003e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.509844  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0105  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.09 
 
 
328 aa  283  4.0000000000000003e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227745  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2639  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.02 
 
 
345 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.718234  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6206  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  50.15 
 
 
328 aa  282  5.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.599678  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2365  quinone oxidoreductase  49.24 
 
 
328 aa  281  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2819  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  49.08 
 
 
327 aa  280  2e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2846  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  49.7 
 
 
328 aa  280  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0354021  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2229  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  48.93 
 
 
327 aa  279  4e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.979693 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4991  alcohol dehydrogenase  48.33 
 
 
328 aa  279  5e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1586  alcohol dehydrogenase  46.79 
 
 
330 aa  279  5e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1434  putative Zn-dependent oxidoreductase  48.46 
 
 
326 aa  278  9e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3205  alcohol dehydrogenase  48.93 
 
 
331 aa  277  1e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0147594 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0082  alcohol dehydrogenase  48.46 
 
 
326 aa  278  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0838693  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0752  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  48.68 
 
 
330 aa  278  1e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534368  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0766  alcohol dehydrogenase  48.63 
 
 
327 aa  277  2e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1073  alcohol dehydrogenase  50.66 
 
 
334 aa  275  5e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3408  alcohol dehydrogenase  46.93 
 
 
327 aa  275  5e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3346  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  47.11 
 
 
328 aa  275  1.0000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.584462  normal  0.149022 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1962  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  42.2 
 
 
330 aa  274  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.204015  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2535  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48 
 
 
336 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351283  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5139  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  47.24 
 
 
328 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3519  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  47.09 
 
 
330 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.231356  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2319  putative quinone oxidoreductase  46.32 
 
 
328 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.721374  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4334  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  49.08 
 
 
334 aa  273  3e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.511675  normal  0.564887 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4748  oxidoreductase, zinc-binding  45.73 
 
 
327 aa  272  5.000000000000001e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3877  quinone oxidoreductase  49.39 
 
 
332 aa  271  8.000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.161114  normal  0.0453412 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1416  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  48.31 
 
 
336 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5289  quinone oxidoreductase  46.34 
 
 
327 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.574483  normal  0.60541 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4187  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  49.39 
 
 
332 aa  271  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0467  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  48.47 
 
 
325 aa  270  2e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0808  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  47.85 
 
 
327 aa  270  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0250  alcohol dehydrogenase  47.4 
 
 
326 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0065  alcohol dehydrogenase  46.95 
 
 
326 aa  270  2e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1314  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  47.69 
 
 
336 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0952218  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1643  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.04 
 
 
327 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.561484  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0254  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  47.09 
 
 
326 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000117637 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1202  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  46.79 
 
 
331 aa  269  4e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1474  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  45.59 
 
 
331 aa  269  4e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2962  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  48.16 
 
 
327 aa  269  5e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.372073  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1108  alcohol dehydrogenase  46.63 
 
 
328 aa  269  5e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.588532  normal  0.604429 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4744  alcohol dehydrogenase  46.04 
 
 
327 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5324  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4337  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  47.55 
 
 
329 aa  268  7e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270219  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2364  dehydrogenase NAD(P)-binding domain-containing protein  46.93 
 
 
328 aa  268  8e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.214717 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0250  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  46.04 
 
 
327 aa  268  8e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.68401  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1567  alcohol dehydrogenase  48.02 
 
 
332 aa  268  8.999999999999999e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3133  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  49.83 
 
 
338 aa  268  1e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.87638 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1621  alcohol dehydrogenase  49.09 
 
 
332 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2933  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  47.89 
 
 
332 aa  268  1e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0318941 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2634  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.93 
 
 
325 aa  268  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.341992  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1597  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.09 
 
 
332 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.212535  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0359  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  47.24 
 
 
327 aa  267  2e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000624901 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3835  quinone oxidoreductase  47.55 
 
 
328 aa  267  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2767  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  49.5 
 
 
338 aa  267  2e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.372024 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2363  alcohol dehydrogenase  46.06 
 
 
329 aa  267  2e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.949479  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1210  alcohol dehydrogenase  47.87 
 
 
328 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.783737  normal  0.219465 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0255  quinone oxidoreductase  46.79 
 
 
326 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2046  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  45.87 
 
 
333 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3679  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  44.07 
 
 
329 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0252  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  47.09 
 
 
326 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>