More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1229 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1229  zinc-binding alcohol dehydrogenase  100 
 
 
342 aa  673    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.157055  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3205  alcohol dehydrogenase  62.77 
 
 
331 aa  382  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0147594 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2933  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  63.61 
 
 
332 aa  380  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0318941 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0467  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  60.25 
 
 
325 aa  366  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0178  YhdH/YhfP family quinone oxidoreductase  59.82 
 
 
326 aa  360  2e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000873043  normal  0.604397 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2819  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  59.2 
 
 
327 aa  359  5e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3519  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  57.01 
 
 
330 aa  358  6e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.231356  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0752  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  55.05 
 
 
330 aa  355  5e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534368  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3835  quinone oxidoreductase  59.88 
 
 
328 aa  355  7.999999999999999e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2364  dehydrogenase NAD(P)-binding domain-containing protein  57.54 
 
 
328 aa  352  5e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.214717 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3346  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  58.64 
 
 
328 aa  352  5e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.584462  normal  0.149022 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1643  zinc-binding alcohol dehydrogenase  55.21 
 
 
327 aa  351  8e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.561484  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5139  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  56.31 
 
 
328 aa  349  4e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0250  alcohol dehydrogenase  54.77 
 
 
326 aa  345  8e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1419  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  55.52 
 
 
328 aa  344  1e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0254  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  54.15 
 
 
326 aa  343  2e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000117637 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2365  quinone oxidoreductase  58.28 
 
 
328 aa  344  2e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1505  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase  57.54 
 
 
330 aa  342  5e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3941  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  55.08 
 
 
326 aa  342  7e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4334  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  57.1 
 
 
334 aa  341  1e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.511675  normal  0.564887 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1526  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  53.68 
 
 
327 aa  341  1e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0255  quinone oxidoreductase  54.77 
 
 
326 aa  340  1e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2535  zinc-binding alcohol dehydrogenase  57.14 
 
 
336 aa  340  2e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351283  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0252  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  54.46 
 
 
326 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0556  alcohol dehydrogenase  56.48 
 
 
328 aa  339  5e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0808  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  55.21 
 
 
327 aa  338  8e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1984  alcohol dehydrogenase  53.07 
 
 
327 aa  338  9e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1314  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  57.74 
 
 
336 aa  337  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0952218  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2846  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  57.1 
 
 
328 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0354021  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3530  alcohol dehydrogenase  52.92 
 
 
326 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2939  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  54.29 
 
 
327 aa  335  5e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.533119  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3572  alcohol dehydrogenase  53.54 
 
 
326 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0065  alcohol dehydrogenase  55.25 
 
 
326 aa  335  5.999999999999999e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1416  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  57.44 
 
 
336 aa  335  7e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3356  quinone oxidoreductase  54.77 
 
 
327 aa  334  1e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0638936 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0250  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  54.46 
 
 
327 aa  335  1e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.68401  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3502  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  54.94 
 
 
328 aa  334  1e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.990659  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0272  quinone oxidoreductase  54.15 
 
 
326 aa  334  1e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000568585 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1108  alcohol dehydrogenase  54.63 
 
 
328 aa  333  2e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.588532  normal  0.604429 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1443  zinc-binding alcohol dehydrogenase  58.66 
 
 
331 aa  333  2e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.109309  normal  0.103295 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2154  alcohol dehydrogenase  53.87 
 
 
326 aa  333  2e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.573953  normal  0.0933085 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6131  zinc-binding alcohol dehydrogenase  54.98 
 
 
331 aa  333  3e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2231  alcohol dehydrogenase  53.87 
 
 
326 aa  333  3e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.499373  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18460  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  54.46 
 
 
327 aa  332  4e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5289  quinone oxidoreductase  53.85 
 
 
327 aa  331  1e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.574483  normal  0.60541 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2363  alcohol dehydrogenase  55.66 
 
 
329 aa  330  2e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.949479  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1210  alcohol dehydrogenase  55.69 
 
 
328 aa  330  2e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.783737  normal  0.219465 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3877  quinone oxidoreductase  56.17 
 
 
332 aa  330  3e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.161114  normal  0.0453412 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0359  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  51.53 
 
 
327 aa  329  4e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000624901 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5461  zinc-binding alcohol dehydrogenase  54.46 
 
 
327 aa  329  4e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4744  alcohol dehydrogenase  53.85 
 
 
327 aa  329  4e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5324  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5401  alcohol dehydrogenase  54.46 
 
 
327 aa  329  4e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00910947 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1230  zinc-binding alcohol dehydrogenase  54.94 
 
 
328 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.606644 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1107  alcohol dehydrogenase  56.53 
 
 
331 aa  328  6e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4337  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  53.85 
 
 
329 aa  328  9e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270219  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4187  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  55.86 
 
 
332 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1223  quinone oxidoreductase  56.23 
 
 
328 aa  327  1.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0271  alcohol dehydrogenase  53.23 
 
 
326 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000478762 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2634  zinc-binding alcohol dehydrogenase  51.85 
 
 
325 aa  327  2.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.341992  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1341  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  51.52 
 
 
330 aa  325  8.000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000434756  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2891  putative oxidoreductase protein  54.46 
 
 
338 aa  324  1e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.874963  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2753  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  53.25 
 
 
327 aa  325  1e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.700456  normal  0.0252326 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4869  quinone oxidoreductase  53.85 
 
 
327 aa  324  1e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.578327  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4477  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  51.23 
 
 
327 aa  324  1e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000206096 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1586  alcohol dehydrogenase  53.4 
 
 
330 aa  323  2e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4748  oxidoreductase, zinc-binding  49.39 
 
 
327 aa  323  3e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0082  alcohol dehydrogenase  53.54 
 
 
326 aa  323  3e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0838693  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4639  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  58.39 
 
 
332 aa  323  3e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.316613  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3700  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  53.37 
 
 
327 aa  322  6e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1434  putative Zn-dependent oxidoreductase  55.81 
 
 
326 aa  321  9.000000000000001e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1893  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  53.23 
 
 
327 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.695142  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2219  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  53.56 
 
 
588 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2968  alcohol dehydrogenase, zinc-containing protein  51.23 
 
 
327 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0338214  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1185  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  55.52 
 
 
327 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3632  alcohol dehydrogenase  54.29 
 
 
337 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.118104  normal  0.722964 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0396  putative quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family protein  51.54 
 
 
325 aa  320  3e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0463  quinone oxidoreductase  51.54 
 
 
325 aa  320  3e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.152247  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0766  alcohol dehydrogenase  51.23 
 
 
327 aa  320  3e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001990  alcohol dehydrogenase  52.31 
 
 
326 aa  318  7e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0309  zinc-binding alcohol dehydrogenase  51.69 
 
 
328 aa  318  7.999999999999999e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0249  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  54.15 
 
 
325 aa  318  1e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0608751  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1200  putative quinone oxidoreductase  51.23 
 
 
325 aa  317  1e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0700296  normal  0.0860145 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2477  acyl-CoA dehydrogenase-like  55.73 
 
 
738 aa  318  1e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.193974  normal  0.0198771 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2639  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.69 
 
 
345 aa  318  1e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.718234  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0260  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  54.15 
 
 
325 aa  317  1e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.18967  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00458  alcohol dehydrogenase  51.7 
 
 
326 aa  317  2e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1474  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  51.53 
 
 
331 aa  317  2e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0105  zinc-binding alcohol dehydrogenase  52 
 
 
328 aa  317  2e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227745  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1035  alcohol dehydrogenase  52.31 
 
 
326 aa  317  2e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2962  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  53.85 
 
 
327 aa  317  3e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.372073  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0950  quinone oxidoreductase  53.25 
 
 
327 aa  317  3e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.759216  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1602  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  50.31 
 
 
327 aa  316  4e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24770  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  56.57 
 
 
328 aa  315  5e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2493  zinc-binding alcohol dehydrogenase  51.08 
 
 
326 aa  315  8e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03112  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  53.57 
 
 
324 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0728423  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0454  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  53.57 
 
 
324 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.749607  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2319  putative quinone oxidoreductase  58.44 
 
 
328 aa  315  9.999999999999999e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.721374  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4569  quinone oxidoreductase, YhdH family  53.9 
 
 
324 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000284525  normal  0.204185 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3737  quinone oxidoreductase  53.9 
 
 
324 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000296751  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03063  hypothetical protein  53.57 
 
 
324 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0710671  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>