More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1341 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1341  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  100 
 
 
330 aa  665    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000434756  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2219  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  81.52 
 
 
588 aa  557  1e-158  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1202  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  54.52 
 
 
331 aa  358  7e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1612  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  53.03 
 
 
331 aa  350  2e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000615843  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0178  YhdH/YhfP family quinone oxidoreductase  54.41 
 
 
326 aa  346  3e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000873043  normal  0.604397 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01969  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  51.82 
 
 
329 aa  344  1e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1962  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  49.24 
 
 
330 aa  342  4e-93  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.204015  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5139  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  50.61 
 
 
328 aa  341  1e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0877  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  51.99 
 
 
332 aa  338  5.9999999999999996e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.128187  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3572  alcohol dehydrogenase  50.76 
 
 
326 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0271  alcohol dehydrogenase  49.85 
 
 
326 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000478762 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4413  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  51.53 
 
 
325 aa  336  2.9999999999999997e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00493012  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0272  quinone oxidoreductase  49.24 
 
 
326 aa  335  3.9999999999999995e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000568585 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0181  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  50.76 
 
 
334 aa  335  7e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2440  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  50.15 
 
 
348 aa  335  7.999999999999999e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2394  quinone oxidoreductase putative, YhdH/YhfP  50.15 
 
 
348 aa  335  7.999999999999999e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0947  putative quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  50.15 
 
 
332 aa  335  9e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000079706  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0681  alcohol dehydrogenase, zinc containing  50.76 
 
 
332 aa  334  1e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3502  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  50.15 
 
 
328 aa  334  1e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.990659  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0879  putative quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  50.15 
 
 
332 aa  333  2e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.85611e-27 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00458  alcohol dehydrogenase  51.68 
 
 
326 aa  333  3e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2046  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  51.06 
 
 
333 aa  332  4e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0695  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  51.38 
 
 
332 aa  332  4e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00215673  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2364  dehydrogenase NAD(P)-binding domain-containing protein  50.3 
 
 
328 aa  331  8e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.214717 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0747  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  49.85 
 
 
332 aa  331  1e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0784  alcohol dehydrogenase  49.85 
 
 
332 aa  331  1e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0841407  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0771  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  51.52 
 
 
335 aa  330  2e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.999993  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001990  alcohol dehydrogenase  50.76 
 
 
326 aa  330  2e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4497  putative quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  50.46 
 
 
332 aa  330  2e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0178815  hitchhiker  0.00000000000130084 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0804  alcohol dehydrogenase  51.07 
 
 
334 aa  329  3e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18460  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  48.62 
 
 
327 aa  329  3e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1035  alcohol dehydrogenase  50.76 
 
 
326 aa  330  3e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2214  alcohol dehydrogenase  50.3 
 
 
331 aa  330  3e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4569  quinone oxidoreductase, YhdH family  48.32 
 
 
324 aa  328  9e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000284525  normal  0.204185 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3737  quinone oxidoreductase  48.32 
 
 
324 aa  328  9e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000296751  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3689  alcohol dehydrogenase  48.01 
 
 
324 aa  328  1.0000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0316802  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03112  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  48.01 
 
 
324 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0728423  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0454  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  48.01 
 
 
324 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.749607  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3443  quinone oxidoreductase  48.01 
 
 
324 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378871  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4337  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  49.39 
 
 
329 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270219  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0254  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  47.4 
 
 
326 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000117637 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0454  quinone oxidoreductase  48.01 
 
 
324 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0267753  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0250  alcohol dehydrogenase  47.71 
 
 
326 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03063  hypothetical protein  48.01 
 
 
324 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0710671  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0556  alcohol dehydrogenase  50.61 
 
 
328 aa  327  2.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2365  quinone oxidoreductase  49.7 
 
 
328 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2995  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  48.48 
 
 
331 aa  326  3e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00123098  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2154  alcohol dehydrogenase  47.4 
 
 
326 aa  326  3e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.573953  normal  0.0933085 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2535  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.17 
 
 
336 aa  326  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351283  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3941  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  48.93 
 
 
326 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2231  alcohol dehydrogenase  47.09 
 
 
326 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.499373  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3285  quinone oxidoreductase, YhdH family  48.01 
 
 
324 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00682496  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1505  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase  49.38 
 
 
330 aa  325  5e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3548  quinone oxidoreductase  48.01 
 
 
324 aa  325  5e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000395647  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3835  quinone oxidoreductase  50.3 
 
 
328 aa  325  6e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3530  alcohol dehydrogenase  47.4 
 
 
326 aa  325  7e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2639  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.77 
 
 
345 aa  325  7e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.718234  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3408  alcohol dehydrogenase  49.24 
 
 
327 aa  325  8.000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3205  alcohol dehydrogenase  51.07 
 
 
331 aa  325  1e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0147594 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5875  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  48 
 
 
332 aa  324  1e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0754792  normal  0.429902 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4187  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  50.46 
 
 
332 aa  324  2e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3679  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  47.4 
 
 
326 aa  324  2e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0862676  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2504  alcohol dehydrogenase  49.24 
 
 
326 aa  323  2e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0137334  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3877  quinone oxidoreductase  50.46 
 
 
332 aa  323  2e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.161114  normal  0.0453412 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0163  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  49.69 
 
 
335 aa  323  3e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0129955 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0255  quinone oxidoreductase  47.71 
 
 
326 aa  323  3e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3700  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  49.54 
 
 
327 aa  323  4e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2846  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  49.85 
 
 
328 aa  322  5e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0354021  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40830  putative oxidoreductase  51.2 
 
 
330 aa  322  6e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1108  alcohol dehydrogenase  48.18 
 
 
328 aa  322  7e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.588532  normal  0.604429 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3461  putative oxidoreductase  51.2 
 
 
330 aa  321  9.000000000000001e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0252  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  47.09 
 
 
326 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1230  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.18 
 
 
328 aa  320  3e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.606644 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0249  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  46.79 
 
 
325 aa  320  3e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0608751  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4334  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  49.54 
 
 
334 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.511675  normal  0.564887 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1419  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  49.7 
 
 
328 aa  318  6e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3639  hypothetical protein  48.16 
 
 
324 aa  318  6e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000530088 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2319  putative quinone oxidoreductase  51.07 
 
 
328 aa  318  6e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.721374  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3567  protein YhdH  48.16 
 
 
324 aa  318  6e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000716793  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3568  protein YhdH  48.16 
 
 
324 aa  318  6e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.408975  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3674  hypothetical protein  47.85 
 
 
324 aa  318  7e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0677066  normal  0.330413 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2634  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.47 
 
 
325 aa  318  1e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.341992  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2493  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.01 
 
 
326 aa  317  2e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4779  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  49.69 
 
 
325 aa  317  2e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.279047  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2819  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  47.71 
 
 
327 aa  316  3e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1586  alcohol dehydrogenase  46.48 
 
 
330 aa  316  4e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3736  hypothetical protein  47.85 
 
 
324 aa  316  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0213449 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4477  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  47.24 
 
 
327 aa  315  5e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000206096 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0260  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  46.48 
 
 
325 aa  315  5e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.18967  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3679  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  48.78 
 
 
329 aa  315  5e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1474  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  47.56 
 
 
331 aa  315  6e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0839  putative quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  50.15 
 
 
331 aa  315  7e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000366963  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3133  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  46.15 
 
 
338 aa  315  7e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.87638 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0463  quinone oxidoreductase  45.71 
 
 
325 aa  314  9.999999999999999e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.152247  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6206  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  48.01 
 
 
328 aa  314  9.999999999999999e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.599678  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2939  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  47.09 
 
 
327 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.533119  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0396  putative quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family protein  45.71 
 
 
325 aa  314  9.999999999999999e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2753  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  48.77 
 
 
327 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.700456  normal  0.0252326 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2363  alcohol dehydrogenase  48.17 
 
 
329 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.949479  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2972  putative zinc-binding alcohol dehydrogenase  50.46 
 
 
326 aa  314  1.9999999999999998e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>