More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2846 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_2846  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  100 
 
 
328 aa  650    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0354021  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2365  quinone oxidoreductase  84.1 
 
 
328 aa  555  1e-157  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3835  quinone oxidoreductase  70.95 
 
 
328 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2364  dehydrogenase NAD(P)-binding domain-containing protein  70.43 
 
 
328 aa  461  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.214717 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3502  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  70.34 
 
 
328 aa  462  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.990659  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5139  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  69.21 
 
 
328 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3877  quinone oxidoreductase  70.03 
 
 
332 aa  457  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.161114  normal  0.0453412 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4334  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  69.82 
 
 
334 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.511675  normal  0.564887 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4187  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  70.34 
 
 
332 aa  457  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1230  zinc-binding alcohol dehydrogenase  69.42 
 
 
328 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.606644 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1108  alcohol dehydrogenase  68.81 
 
 
328 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.588532  normal  0.604429 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4337  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  67.58 
 
 
329 aa  444  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270219  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1526  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  64 
 
 
327 aa  427  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1248  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  69.51 
 
 
328 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.893092  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0752  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  64 
 
 
330 aa  422  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534368  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2962  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  66.15 
 
 
327 aa  417  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.372073  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0808  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  63.08 
 
 
327 aa  420  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1643  zinc-binding alcohol dehydrogenase  63.38 
 
 
327 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.561484  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3679  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  63.69 
 
 
329 aa  416  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0065  alcohol dehydrogenase  64.51 
 
 
326 aa  416  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5461  zinc-binding alcohol dehydrogenase  62.77 
 
 
327 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5401  alcohol dehydrogenase  62.77 
 
 
327 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00910947 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1204  quinone oxidoreductase  63.69 
 
 
326 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.740135  normal  0.265781 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5289  quinone oxidoreductase  61.85 
 
 
327 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.574483  normal  0.60541 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0250  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  61.54 
 
 
327 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.68401  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4744  alcohol dehydrogenase  62.15 
 
 
327 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5324  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4869  quinone oxidoreductase  62.15 
 
 
327 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.578327  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0359  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  61.54 
 
 
327 aa  402  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000624901 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1185  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  63.38 
 
 
327 aa  402  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18460  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  61.23 
 
 
327 aa  398  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2968  alcohol dehydrogenase, zinc-containing protein  63.04 
 
 
327 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0338214  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3356  quinone oxidoreductase  60.62 
 
 
327 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0638936 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2819  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  61.54 
 
 
327 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2939  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  61.23 
 
 
327 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.533119  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2753  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  62.11 
 
 
327 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.700456  normal  0.0252326 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0082  alcohol dehydrogenase  61.73 
 
 
326 aa  394  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0838693  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3700  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  61.23 
 
 
327 aa  395  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2363  alcohol dehydrogenase  61.85 
 
 
329 aa  395  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.949479  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2517  putative zinc-binding dehydrogenase  61.23 
 
 
326 aa  391  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.145021  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1434  putative Zn-dependent oxidoreductase  61.42 
 
 
326 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3408  alcohol dehydrogenase  58.64 
 
 
327 aa  387  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24770  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  63.5 
 
 
328 aa  384  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3133  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  58.33 
 
 
338 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.87638 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1474  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  58.46 
 
 
331 aa  383  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2639  zinc-binding alcohol dehydrogenase  57.85 
 
 
345 aa  382  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.718234  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2767  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  57.74 
 
 
338 aa  378  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.372024 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1602  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  57.23 
 
 
327 aa  380  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2891  putative oxidoreductase protein  59.52 
 
 
338 aa  380  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.874963  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1984  alcohol dehydrogenase  59.08 
 
 
327 aa  380  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0309  zinc-binding alcohol dehydrogenase  58.46 
 
 
328 aa  378  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2477  acyl-CoA dehydrogenase-like  61.51 
 
 
738 aa  380  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.193974  normal  0.0198771 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6206  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  59.38 
 
 
328 aa  376  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.599678  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0766  alcohol dehydrogenase  57.54 
 
 
327 aa  375  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1586  alcohol dehydrogenase  58.33 
 
 
330 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0105  zinc-binding alcohol dehydrogenase  58.28 
 
 
328 aa  373  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227745  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2634  zinc-binding alcohol dehydrogenase  58.33 
 
 
325 aa  371  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.341992  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1893  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  59.08 
 
 
327 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.695142  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1675  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  60.37 
 
 
327 aa  373  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.509844  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0728  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  57.41 
 
 
325 aa  373  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.43463 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2229  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  60.31 
 
 
327 aa  370  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.979693 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4748  oxidoreductase, zinc-binding  54.46 
 
 
327 aa  365  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4477  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  56.62 
 
 
327 aa  364  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000206096 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3034  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  56.97 
 
 
334 aa  365  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0612  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  58.95 
 
 
329 aa  366  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00543509 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4779  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  57.72 
 
 
325 aa  365  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.279047  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0950  quinone oxidoreductase  57.1 
 
 
327 aa  364  1e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.759216  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1210  alcohol dehydrogenase  60.06 
 
 
328 aa  364  1e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.783737  normal  0.219465 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3189  zinc-binding alcohol dehydrogenase  57.27 
 
 
333 aa  362  6e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.246614  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1223  quinone oxidoreductase  57.89 
 
 
328 aa  362  7.0000000000000005e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4991  alcohol dehydrogenase  56 
 
 
328 aa  360  2e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2475  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  54.43 
 
 
329 aa  354  8.999999999999999e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0901  alcohol dehydrogenase  56.62 
 
 
327 aa  351  8e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.149382  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0467  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  57.32 
 
 
325 aa  347  2e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3519  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  56.62 
 
 
330 aa  346  3e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.231356  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0178  YhdH/YhfP family quinone oxidoreductase  57.32 
 
 
326 aa  345  6e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000873043  normal  0.604397 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3346  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  55.59 
 
 
328 aa  344  1e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.584462  normal  0.149022 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1052  quinone oxidoreductase  54.15 
 
 
327 aa  343  2.9999999999999997e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3632  alcohol dehydrogenase  56.92 
 
 
337 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.118104  normal  0.722964 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1505  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase  56.13 
 
 
330 aa  341  8e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6131  zinc-binding alcohol dehydrogenase  54.15 
 
 
331 aa  331  8e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2535  zinc-binding alcohol dehydrogenase  53.54 
 
 
336 aa  331  9e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351283  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3205  alcohol dehydrogenase  55.08 
 
 
331 aa  322  4e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0147594 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1341  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  49.85 
 
 
330 aa  322  5e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000434756  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2231  alcohol dehydrogenase  51.7 
 
 
326 aa  322  6e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.499373  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3572  alcohol dehydrogenase  50.15 
 
 
326 aa  322  7e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2154  alcohol dehydrogenase  51.39 
 
 
326 aa  321  9.000000000000001e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.573953  normal  0.0933085 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1314  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  52.92 
 
 
336 aa  318  6e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0952218  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1416  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  52.62 
 
 
336 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0255  quinone oxidoreductase  50.46 
 
 
326 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1229  zinc-binding alcohol dehydrogenase  57.1 
 
 
342 aa  316  3e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.157055  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0271  alcohol dehydrogenase  49.85 
 
 
326 aa  316  4e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000478762 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2219  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  51.22 
 
 
588 aa  316  4e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06860  putative quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  54.71 
 
 
328 aa  315  5e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0708364  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0250  alcohol dehydrogenase  50.15 
 
 
326 aa  315  8e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2933  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  53.85 
 
 
332 aa  315  8e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0318941 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0252  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  49.85 
 
 
326 aa  315  9e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1107  alcohol dehydrogenase  53.68 
 
 
331 aa  315  9e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0249  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  49.38 
 
 
325 aa  314  9.999999999999999e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0608751  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0556  alcohol dehydrogenase  54.66 
 
 
328 aa  314  9.999999999999999e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0254  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  49.54 
 
 
326 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000117637 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>