More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3835 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3835  quinone oxidoreductase  100 
 
 
328 aa  653    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4334  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  74.31 
 
 
334 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.511675  normal  0.564887 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3877  quinone oxidoreductase  73.7 
 
 
332 aa  489  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.161114  normal  0.0453412 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4187  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  73.7 
 
 
332 aa  487  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2365  quinone oxidoreductase  72.48 
 
 
328 aa  480  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2846  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  70.95 
 
 
328 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0354021  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5139  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  68.9 
 
 
328 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2364  dehydrogenase NAD(P)-binding domain-containing protein  66.77 
 
 
328 aa  450  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.214717 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0752  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  65.23 
 
 
330 aa  434  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534368  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18460  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  65.43 
 
 
327 aa  433  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1108  alcohol dehydrogenase  65.55 
 
 
328 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.588532  normal  0.604429 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1230  zinc-binding alcohol dehydrogenase  65.24 
 
 
328 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.606644 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3502  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  65.44 
 
 
328 aa  432  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.990659  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4337  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  63.11 
 
 
329 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270219  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2939  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  61.11 
 
 
327 aa  414  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.533119  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5289  quinone oxidoreductase  63.58 
 
 
327 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.574483  normal  0.60541 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5461  zinc-binding alcohol dehydrogenase  64.81 
 
 
327 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4744  alcohol dehydrogenase  63.58 
 
 
327 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5324  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5401  alcohol dehydrogenase  64.81 
 
 
327 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00910947 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2819  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  64.51 
 
 
327 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4869  quinone oxidoreductase  63.89 
 
 
327 aa  408  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.578327  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1526  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  61.11 
 
 
327 aa  408  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0250  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  62.96 
 
 
327 aa  410  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.68401  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2962  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  63.27 
 
 
327 aa  410  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.372073  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2968  alcohol dehydrogenase, zinc-containing protein  60.31 
 
 
327 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0338214  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2753  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  60.92 
 
 
327 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.700456  normal  0.0252326 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1984  alcohol dehydrogenase  60.19 
 
 
327 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3679  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  62.15 
 
 
329 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0359  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  60.49 
 
 
327 aa  402  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000624901 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0808  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  62.04 
 
 
327 aa  404  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2363  alcohol dehydrogenase  61.54 
 
 
329 aa  402  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.949479  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3356  quinone oxidoreductase  63.27 
 
 
327 aa  403  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0638936 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1248  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  64.63 
 
 
328 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.893092  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1204  quinone oxidoreductase  62.65 
 
 
326 aa  397  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.740135  normal  0.265781 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0065  alcohol dehydrogenase  61.11 
 
 
326 aa  396  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3700  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  62.35 
 
 
327 aa  396  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1643  zinc-binding alcohol dehydrogenase  59.57 
 
 
327 aa  393  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.561484  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0105  zinc-binding alcohol dehydrogenase  59.38 
 
 
328 aa  385  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227745  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1893  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  61.11 
 
 
327 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.695142  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1185  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  61.42 
 
 
327 aa  387  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0950  quinone oxidoreductase  57.1 
 
 
327 aa  383  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.759216  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1474  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  57.28 
 
 
331 aa  379  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0082  alcohol dehydrogenase  58.02 
 
 
326 aa  378  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0838693  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1602  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  56.48 
 
 
327 aa  380  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1210  alcohol dehydrogenase  60.74 
 
 
328 aa  379  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.783737  normal  0.219465 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0766  alcohol dehydrogenase  57.1 
 
 
327 aa  379  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1434  putative Zn-dependent oxidoreductase  57.41 
 
 
326 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0309  zinc-binding alcohol dehydrogenase  57.54 
 
 
328 aa  375  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3133  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  58.21 
 
 
338 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.87638 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24770  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  61.85 
 
 
328 aa  374  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2477  acyl-CoA dehydrogenase-like  59.62 
 
 
738 aa  372  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.193974  normal  0.0198771 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1223  quinone oxidoreductase  61.24 
 
 
328 aa  368  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2767  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  57.91 
 
 
338 aa  371  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.372024 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2891  putative oxidoreductase protein  58.51 
 
 
338 aa  369  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.874963  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4748  oxidoreductase, zinc-binding  55.25 
 
 
327 aa  370  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1586  alcohol dehydrogenase  58.15 
 
 
330 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2639  zinc-binding alcohol dehydrogenase  54.46 
 
 
345 aa  369  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.718234  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4477  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  56.48 
 
 
327 aa  366  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000206096 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1675  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  59.13 
 
 
327 aa  365  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.509844  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3408  alcohol dehydrogenase  54.77 
 
 
327 aa  367  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6206  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  57.54 
 
 
328 aa  367  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.599678  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2229  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  59.75 
 
 
327 aa  365  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.979693 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2634  zinc-binding alcohol dehydrogenase  57.1 
 
 
325 aa  363  2e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.341992  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4991  alcohol dehydrogenase  58.02 
 
 
328 aa  361  9e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0612  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  58.02 
 
 
329 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00543509 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3346  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  57.28 
 
 
328 aa  355  6.999999999999999e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.584462  normal  0.149022 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0728  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  54.32 
 
 
325 aa  353  2.9999999999999997e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.43463 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2517  putative zinc-binding dehydrogenase  57.45 
 
 
326 aa  351  8e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.145021  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3034  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  55.76 
 
 
334 aa  350  3e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1505  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase  57.36 
 
 
330 aa  350  3e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0178  YhdH/YhfP family quinone oxidoreductase  58.1 
 
 
326 aa  349  5e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000873043  normal  0.604397 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4779  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  55.86 
 
 
325 aa  349  5e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.279047  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2535  zinc-binding alcohol dehydrogenase  55.83 
 
 
336 aa  348  8e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351283  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1052  quinone oxidoreductase  55.52 
 
 
327 aa  347  2e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2475  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  54.91 
 
 
329 aa  347  2e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3189  zinc-binding alcohol dehydrogenase  55.76 
 
 
333 aa  345  8e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.246614  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3205  alcohol dehydrogenase  56.92 
 
 
331 aa  343  2e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0147594 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0467  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  56.57 
 
 
325 aa  343  2e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1314  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  56.13 
 
 
336 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0952218  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1416  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  55.83 
 
 
336 aa  335  5.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2933  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  56.62 
 
 
332 aa  332  6e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0318941 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1229  zinc-binding alcohol dehydrogenase  59.88 
 
 
342 aa  332  7.000000000000001e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.157055  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0901  alcohol dehydrogenase  53.7 
 
 
327 aa  330  3e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.149382  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3572  alcohol dehydrogenase  50.46 
 
 
326 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00458  alcohol dehydrogenase  50.46 
 
 
326 aa  326  4.0000000000000003e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0260  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  51.38 
 
 
325 aa  325  5e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.18967  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0249  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  51.08 
 
 
325 aa  325  6e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0608751  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1035  alcohol dehydrogenase  50.15 
 
 
326 aa  325  6e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1341  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  50.3 
 
 
330 aa  325  6e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000434756  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0271  alcohol dehydrogenase  50.15 
 
 
326 aa  325  7e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000478762 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2493  zinc-binding alcohol dehydrogenase  51.08 
 
 
326 aa  325  9e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3679  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  50.15 
 
 
326 aa  325  9e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0862676  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0454  quinone oxidoreductase  49.38 
 
 
324 aa  324  1e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0267753  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3443  quinone oxidoreductase  49.38 
 
 
324 aa  324  1e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378871  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3567  protein YhdH  50.31 
 
 
324 aa  324  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000716793  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4569  quinone oxidoreductase, YhdH family  49.69 
 
 
324 aa  325  1e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000284525  normal  0.204185 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3737  quinone oxidoreductase  49.69 
 
 
324 aa  325  1e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000296751  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3736  hypothetical protein  50.31 
 
 
324 aa  324  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0213449 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3568  protein YhdH  50.31 
 
 
324 aa  324  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.408975  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3674  hypothetical protein  50 
 
 
324 aa  324  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0677066  normal  0.330413 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>