More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2046 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2046  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  100 
 
 		 333 aa  667    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1202  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  55.93 
 
 		 331 aa  348  6e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2606  alcohol dehydrogenase  54.88 
 
 		 328 aa  345  8e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.836492  hitchhiker  0.00218108 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1612  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  55.45 
 
 		 331 aa  341  9e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000615843  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3061  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  56.84 
 
 		 335 aa  333  2e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.122526  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1341  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  51.06 
 
 		 330 aa  332  4e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000434756  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1073  alcohol dehydrogenase  52.27 
 
 		 334 aa  326  3e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2504  alcohol dehydrogenase  52.13 
 
 		 326 aa  325  7e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0137334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1723  quinone oxidoreductase  52.76 
 
 		 334 aa  323  2e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1788  hypothetical protein  52.45 
 
 		 334 aa  322  4e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3017  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  52 
 
 		 331 aa  320  3e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.295678 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2219  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  50.46 
 
 		 588 aa  309  5e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5139  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  48.17 
 
 		 328 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3877  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  48.79 
 
 		 339 aa  296  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2364  dehydrogenase NAD(P)-binding domain-containing protein  46.95 
 
 		 328 aa  289  4e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.214717 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1419  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  49.09 
 
 		 328 aa  287  2e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4337  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  46.93 
 
 		 329 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270219  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1586  alcohol dehydrogenase  46.34 
 
 		 330 aa  281  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0181  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  46.5 
 
 		 334 aa  279  5e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3502  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  45.43 
 
 		 328 aa  279  5e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.990659  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01969  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  44.85 
 
 		 329 aa  279  6e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18460  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  46.63 
 
 		 327 aa  278  7e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0178  YhdH/YhfP family quinone oxidoreductase  48.17 
 
 		 326 aa  278  1e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000873043  normal  0.604397 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1108  alcohol dehydrogenase  46.34 
 
 		 328 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.588532  normal  0.604429 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3572  alcohol dehydrogenase  47.24 
 
 		 326 aa  277  2e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5289  quinone oxidoreductase  47.08 
 
 		 327 aa  276  3e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.574483  normal  0.60541 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2995  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  46.04 
 
 		 331 aa  276  4e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00123098  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1229  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.01 
 
 		 342 aa  276  5e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.157055  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1962  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  42.81 
 
 		 330 aa  275  8e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.204015  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0250  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  46.01 
 
 		 327 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.68401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0804  alcohol dehydrogenase  45.9 
 
 		 334 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4744  alcohol dehydrogenase  47.08 
 
 		 327 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4779  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  45.23 
 
 		 325 aa  273  3e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.279047  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0163  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  45.05 
 
 		 335 aa  273  3e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0129955 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3205  alcohol dehydrogenase  45.87 
 
 		 331 aa  273  4.0000000000000004e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147594 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2365  quinone oxidoreductase  44.82 
 
 		 328 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3530  alcohol dehydrogenase  45.57 
 
 		 326 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0752  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  44.82 
 
 		 330 aa  272  5.000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3519  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  46.79 
 
 		 330 aa  271  8.000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.231356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0271  alcohol dehydrogenase  45.09 
 
 		 326 aa  271  1e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000478762 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0359  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.17 
 
 		 327 aa  270  2e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000624901 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3461  putative oxidoreductase  45.65 
 
 		 330 aa  270  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0695  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  45.9 
 
 		 332 aa  270  2e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00215673  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0272  quinone oxidoreductase  45.57 
 
 		 326 aa  270  2e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000568585 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0877  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  45.76 
 
 		 332 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.128187  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0808  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  44 
 
 		 327 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2535  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.11 
 
 		 336 aa  269  4e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351283  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4413  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  45.71 
 
 		 325 aa  269  4e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00493012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4497  putative quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  45.59 
 
 		 332 aa  269  4e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0178815  hitchhiker  0.00000000000130084 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4991  alcohol dehydrogenase  46.48 
 
 		 328 aa  269  4e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0681  alcohol dehydrogenase, zinc containing  44.98 
 
 		 332 aa  269  5e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0947  putative quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  44.98 
 
 		 332 aa  268  7e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000079706  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5461  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.85 
 
 		 327 aa  268  8e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5401  alcohol dehydrogenase  45.85 
 
 		 327 aa  268  8e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00910947 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2846  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  44.07 
 
 		 328 aa  268  8.999999999999999e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0354021  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1230  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.21 
 
 		 328 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.606644 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0771  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  45.87 
 
 		 335 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.999993  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2933  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  45.57 
 
 		 332 aa  266  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0318941 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0250  alcohol dehydrogenase  44.79 
 
 		 326 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0254  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  44.48 
 
 		 326 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000117637 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0879  putative quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  44.68 
 
 		 332 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.85611e-27 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40830  putative oxidoreductase  44.74 
 
 		 330 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0463  quinone oxidoreductase  44.79 
 
 		 325 aa  266  4e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.152247  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0396  putative quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family protein  44.79 
 
 		 325 aa  266  4e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3346  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  45.4 
 
 		 328 aa  266  4e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.584462  normal  0.149022 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001990  alcohol dehydrogenase  46.32 
 
 		 326 aa  266  4e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00458  alcohol dehydrogenase  46.01 
 
 		 326 aa  266  4e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1505  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase  44.79 
 
 		 330 aa  266  4e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0747  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  44.38 
 
 		 332 aa  266  5e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0784  alcohol dehydrogenase  44.38 
 
 		 332 aa  266  5e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0841407  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0252  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  44.79 
 
 		 326 aa  266  5e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2363  alcohol dehydrogenase  45.12 
 
 		 329 aa  265  5.999999999999999e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.949479  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2154  alcohol dehydrogenase  44.48 
 
 		 326 aa  265  8e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.573953  normal  0.0933085 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0260  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  45.54 
 
 		 325 aa  265  8.999999999999999e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.18967  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1675  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  44.62 
 
 		 327 aa  265  8.999999999999999e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.509844  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0249  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  46.79 
 
 		 325 aa  265  8.999999999999999e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0608751  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1200  putative quinone oxidoreductase  44.79 
 
 		 325 aa  265  1e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0700296  normal  0.0860145 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0255  quinone oxidoreductase  44.79 
 
 		 326 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3548  quinone oxidoreductase  45.09 
 
 		 324 aa  264  1e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000395647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3737  quinone oxidoreductase  45.09 
 
 		 324 aa  265  1e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000296751  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1443  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.18 
 
 		 331 aa  265  1e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.109309  normal  0.103295 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4569  quinone oxidoreductase, YhdH family  45.09 
 
 		 324 aa  265  1e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000284525  normal  0.204185 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03112  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  44.79 
 
 		 324 aa  264  2e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0728423  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0454  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  44.79 
 
 		 324 aa  264  2e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.749607  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4869  quinone oxidoreductase  45.23 
 
 		 327 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.578327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03063  hypothetical protein  44.79 
 
 		 324 aa  264  2e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0710671  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3443  quinone oxidoreductase  44.79 
 
 		 324 aa  264  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378871  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1643  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.56 
 
 		 327 aa  264  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.561484  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0454  quinone oxidoreductase  44.79 
 
 		 324 aa  264  2e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0267753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3356  quinone oxidoreductase  45.23 
 
 		 327 aa  263  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0638936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2231  alcohol dehydrogenase  44.17 
 
 		 326 aa  264  2e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.499373  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1035  alcohol dehydrogenase  44.48 
 
 		 326 aa  263  2e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1474  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  43.25 
 
 		 331 aa  263  3e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3285  quinone oxidoreductase, YhdH family  44.79 
 
 		 324 aa  263  4e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00682496  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0839  putative quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  46.5 
 
 		 331 aa  263  4e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000366963  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1526  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.64 
 
 		 327 aa  262  4.999999999999999e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2229  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  45.4 
 
 		 327 aa  262  6e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.979693 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2493  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.79 
 
 		 326 aa  262  6.999999999999999e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2214  alcohol dehydrogenase  44.68 
 
 		 331 aa  262  6.999999999999999e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3835  quinone oxidoreductase  44.51 
 
 		 328 aa  261  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.453794 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>