More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1264 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1264  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  100 
 
 
336 aa  687    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1510  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  69.91 
 
 
331 aa  483  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1356  putative NADPH:quinone reductase/ Zn-dependent oxidoreductase  60.92 
 
 
353 aa  412  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0695  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  54.98 
 
 
332 aa  375  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00215673  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4497  putative quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  54.08 
 
 
332 aa  367  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0178815  hitchhiker  0.00000000000130084 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01969  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  52.74 
 
 
329 aa  358  6e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0877  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  52.71 
 
 
332 aa  358  7e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.128187  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0681  alcohol dehydrogenase, zinc containing  52.41 
 
 
332 aa  358  9e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5875  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  54.15 
 
 
332 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0754792  normal  0.429902 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0839  putative quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  53.47 
 
 
331 aa  355  5.999999999999999e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000366963  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0879  putative quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  51.96 
 
 
332 aa  354  2e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.85611e-27 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0947  putative quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  51.51 
 
 
332 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000079706  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0747  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  51.96 
 
 
332 aa  352  4e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0784  alcohol dehydrogenase  51.96 
 
 
332 aa  352  4e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0841407  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2214  alcohol dehydrogenase  55.96 
 
 
331 aa  352  4e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1307  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  50.76 
 
 
333 aa  352  7e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2529  alcohol dehydrogenase  54.41 
 
 
329 aa  352  7e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.180197  normal  0.304132 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0804  alcohol dehydrogenase  55.05 
 
 
334 aa  349  3e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40830  putative oxidoreductase  53.68 
 
 
330 aa  348  5e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0771  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  55.49 
 
 
335 aa  347  1e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.999993  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0181  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  53.99 
 
 
334 aa  347  2e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2995  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  54.08 
 
 
331 aa  346  4e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00123098  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3461  putative oxidoreductase  53.37 
 
 
330 aa  346  4e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1110  alcohol dehydrogenase  53.52 
 
 
331 aa  344  1e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.346069  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0163  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  53.96 
 
 
335 aa  340  2e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0129955 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1784  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.08 
 
 
326 aa  323  2e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0104845 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0018  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.43 
 
 
334 aa  316  4e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000105442  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0011  Zinc-containing alcohol dehydrogenase  48.16 
 
 
334 aa  312  5.999999999999999e-84  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000787082 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1341  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  47.87 
 
 
330 aa  311  7.999999999999999e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000434756  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2219  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  49.85 
 
 
588 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2957  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.06 
 
 
335 aa  301  1e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1612  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  45.73 
 
 
331 aa  281  9e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000615843  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3877  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  45.74 
 
 
339 aa  277  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1202  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  45.4 
 
 
331 aa  275  8e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3017  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  45.9 
 
 
331 aa  271  8.000000000000001e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.295678 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3346  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  44.41 
 
 
328 aa  262  4.999999999999999e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.584462  normal  0.149022 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3205  alcohol dehydrogenase  41.09 
 
 
331 aa  262  4.999999999999999e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0147594 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2475  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  42.81 
 
 
329 aa  261  1e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2046  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.64 
 
 
333 aa  261  1e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1419  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  44.65 
 
 
328 aa  259  4e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2440  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  40.18 
 
 
348 aa  258  1e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1962  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  40.85 
 
 
330 aa  258  1e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.204015  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2394  quinone oxidoreductase putative, YhdH/YhfP  40.18 
 
 
348 aa  258  1e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5139  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  42.64 
 
 
328 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2535  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.38 
 
 
336 aa  257  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351283  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1505  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase  42.02 
 
 
330 aa  257  2e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2504  alcohol dehydrogenase  42.51 
 
 
326 aa  256  4e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0137334  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4991  alcohol dehydrogenase  44.17 
 
 
328 aa  256  4e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2751  quinone oxidoreductase putative, YhdH/YhfP  41.21 
 
 
323 aa  254  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.186347  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0178  YhdH/YhfP family quinone oxidoreductase  43.25 
 
 
326 aa  254  1.0000000000000001e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000873043  normal  0.604397 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2829  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  41.21 
 
 
323 aa  254  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.350559  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0250  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.12 
 
 
327 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.68401  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4413  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  42.77 
 
 
325 aa  253  3e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00493012  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2229  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  44.04 
 
 
327 aa  253  3e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.979693 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03112  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  41.72 
 
 
324 aa  252  5.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0728423  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0454  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  41.72 
 
 
324 aa  252  5.000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.749607  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3548  quinone oxidoreductase  41.41 
 
 
324 aa  252  5.000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000395647  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03063  hypothetical protein  41.72 
 
 
324 aa  252  5.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0710671  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3737  quinone oxidoreductase  41.41 
 
 
324 aa  252  7e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000296751  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4569  quinone oxidoreductase, YhdH family  41.41 
 
 
324 aa  252  7e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000284525  normal  0.204185 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1073  alcohol dehydrogenase  43.73 
 
 
334 aa  251  9.000000000000001e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0454  quinone oxidoreductase  41.41 
 
 
324 aa  251  2e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0267753  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1314  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  43.69 
 
 
336 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0952218  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3285  quinone oxidoreductase, YhdH family  41.1 
 
 
324 aa  250  2e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00682496  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3443  quinone oxidoreductase  41.41 
 
 
324 aa  251  2e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378871  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5289  quinone oxidoreductase  41.59 
 
 
327 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.574483  normal  0.60541 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0808  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  42.94 
 
 
327 aa  250  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3356  quinone oxidoreductase  42.2 
 
 
327 aa  250  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0638936 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4744  alcohol dehydrogenase  41.9 
 
 
327 aa  249  5e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5324  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0359  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.02 
 
 
327 aa  249  6e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000624901 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0260  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  42.02 
 
 
325 aa  249  7e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.18967  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1675  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  43.25 
 
 
327 aa  248  9e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.509844  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1788  hypothetical protein  42.38 
 
 
334 aa  248  1e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1416  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  43.38 
 
 
336 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2933  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  40.06 
 
 
332 aa  248  1e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0318941 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3408  alcohol dehydrogenase  40.87 
 
 
327 aa  247  2e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2819  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  42.33 
 
 
327 aa  247  2e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1229  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.96 
 
 
342 aa  247  2e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.157055  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0249  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  41.41 
 
 
325 aa  247  2e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0608751  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3530  alcohol dehydrogenase  41.41 
 
 
326 aa  247  2e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3877  quinone oxidoreductase  43.25 
 
 
332 aa  247  2e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.161114  normal  0.0453412 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3679  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  41.72 
 
 
326 aa  246  3e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0862676  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4334  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  42.33 
 
 
334 aa  246  4e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.511675  normal  0.564887 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3674  hypothetical protein  40.62 
 
 
324 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0677066  normal  0.330413 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1230  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.54 
 
 
328 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.606644 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3567  protein YhdH  40.18 
 
 
324 aa  245  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000716793  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3568  protein YhdH  40.18 
 
 
324 aa  245  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.408975  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4477  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  40.37 
 
 
327 aa  245  6e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000206096 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5461  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.28 
 
 
327 aa  246  6e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3639  hypothetical protein  40.18 
 
 
324 aa  245  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000530088 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5401  alcohol dehydrogenase  41.28 
 
 
327 aa  246  6e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00910947 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1567  alcohol dehydrogenase  43.25 
 
 
332 aa  245  6.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4187  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  42.94 
 
 
332 aa  245  6.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2493  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.72 
 
 
326 aa  244  9.999999999999999e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0463  quinone oxidoreductase  40 
 
 
325 aa  244  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.152247  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6206  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  40.98 
 
 
328 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.599678  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2639  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.73 
 
 
345 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.718234  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0396  putative quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family protein  40 
 
 
325 aa  244  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3736  hypothetical protein  40.18 
 
 
324 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0213449 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1108  alcohol dehydrogenase  41.54 
 
 
328 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.588532  normal  0.604429 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>