More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1962 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1962  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  100 
 
 
330 aa  668    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.204015  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2394  quinone oxidoreductase putative, YhdH/YhfP  69.88 
 
 
348 aa  493  9.999999999999999e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2440  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  69.88 
 
 
348 aa  493  9.999999999999999e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1341  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  49.24 
 
 
330 aa  342  4e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000434756  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2219  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  49.09 
 
 
588 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1612  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  47.22 
 
 
331 aa  305  6e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000615843  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1419  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  44.51 
 
 
328 aa  289  4e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40830  putative oxidoreductase  43.43 
 
 
330 aa  289  4e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3519  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  43.9 
 
 
330 aa  288  7e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.231356  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3205  alcohol dehydrogenase  44.82 
 
 
331 aa  288  1e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0147594 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2535  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.55 
 
 
336 aa  285  8e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351283  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3461  putative oxidoreductase  43.12 
 
 
330 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1202  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.43 
 
 
331 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0178  YhdH/YhfP family quinone oxidoreductase  43.77 
 
 
326 aa  282  5.000000000000001e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000873043  normal  0.604397 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2819  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  43.25 
 
 
327 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2214  alcohol dehydrogenase  40.98 
 
 
331 aa  281  1e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3877  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.67 
 
 
339 aa  278  7e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2529  alcohol dehydrogenase  41.46 
 
 
329 aa  278  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.180197  normal  0.304132 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0011  Zinc-containing alcohol dehydrogenase  42.46 
 
 
334 aa  277  2e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000787082 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0467  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  42.33 
 
 
325 aa  277  2e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0454  quinone oxidoreductase  41.23 
 
 
324 aa  276  4e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0267753  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3443  quinone oxidoreductase  41.23 
 
 
324 aa  276  4e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378871  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4337  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  43.03 
 
 
329 aa  275  6e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270219  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3548  quinone oxidoreductase  40.92 
 
 
324 aa  275  6e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000395647  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2046  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.81 
 
 
333 aa  275  8e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2933  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  42.38 
 
 
332 aa  275  9e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0318941 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03112  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  40.92 
 
 
324 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0728423  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0454  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  40.92 
 
 
324 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.749607  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03063  hypothetical protein  40.92 
 
 
324 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0710671  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0771  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  42.2 
 
 
335 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.999993  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0835  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  45.45 
 
 
332 aa  273  2.0000000000000002e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3737  quinone oxidoreductase  40.62 
 
 
324 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000296751  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2231  alcohol dehydrogenase  40.43 
 
 
326 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.499373  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4569  quinone oxidoreductase, YhdH family  40.62 
 
 
324 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000284525  normal  0.204185 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0804  alcohol dehydrogenase  41.59 
 
 
334 aa  273  3e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0271  alcohol dehydrogenase  39.57 
 
 
326 aa  273  3e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000478762 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2995  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  43.38 
 
 
331 aa  273  3e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00123098  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2154  alcohol dehydrogenase  40.12 
 
 
326 aa  273  3e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.573953  normal  0.0933085 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0252  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  40.18 
 
 
326 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0255  quinone oxidoreductase  40.18 
 
 
326 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2639  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.21 
 
 
345 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.718234  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3679  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  40.87 
 
 
326 aa  272  5.000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0862676  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2939  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.64 
 
 
327 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.533119  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3285  quinone oxidoreductase, YhdH family  40.31 
 
 
324 aa  272  6e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00682496  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0018  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.23 
 
 
334 aa  271  1e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000105442  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0250  alcohol dehydrogenase  39.88 
 
 
326 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01969  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  41.1 
 
 
329 aa  270  2e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0249  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  40.49 
 
 
325 aa  270  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0608751  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1416  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  39.94 
 
 
336 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1314  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  39.94 
 
 
336 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0952218  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5139  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  41.41 
 
 
328 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3408  alcohol dehydrogenase  42.72 
 
 
327 aa  270  2.9999999999999997e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2962  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.72 
 
 
327 aa  269  4e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.372073  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0254  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  39.57 
 
 
326 aa  269  4e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000117637 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1474  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  40.8 
 
 
331 aa  269  5e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2504  alcohol dehydrogenase  44.66 
 
 
326 aa  269  5.9999999999999995e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0137334  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3639  hypothetical protein  40.99 
 
 
324 aa  268  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000530088 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2753  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.14 
 
 
327 aa  268  7e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.700456  normal  0.0252326 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3568  protein YhdH  40.99 
 
 
324 aa  268  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.408975  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3567  protein YhdH  40.99 
 
 
324 aa  268  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000716793  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3502  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  41.18 
 
 
328 aa  268  8e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.990659  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1984  alcohol dehydrogenase  42.64 
 
 
327 aa  268  8e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3679  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  40.12 
 
 
329 aa  268  8e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1505  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase  41.46 
 
 
330 aa  268  8.999999999999999e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3736  hypothetical protein  40.99 
 
 
324 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0213449 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3674  hypothetical protein  40.68 
 
 
324 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0677066  normal  0.330413 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1675  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  41.1 
 
 
327 aa  268  1e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.509844  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2365  quinone oxidoreductase  39.88 
 
 
328 aa  267  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3530  alcohol dehydrogenase  39.57 
 
 
326 aa  267  2e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1643  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.38 
 
 
327 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.561484  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1567  alcohol dehydrogenase  42.38 
 
 
332 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0181  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  40.55 
 
 
334 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18460  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.41 
 
 
327 aa  266  4e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2846  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  40.31 
 
 
328 aa  266  4e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0354021  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1307  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  39.7 
 
 
333 aa  266  5e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6206  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  38.96 
 
 
328 aa  266  5e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.599678  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0808  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  40.18 
 
 
327 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0877  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  40.18 
 
 
332 aa  265  7e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.128187  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0260  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  40.18 
 
 
325 aa  265  8e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.18967  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3941  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  39.88 
 
 
326 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4748  oxidoreductase, zinc-binding  40.8 
 
 
327 aa  265  1e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0272  quinone oxidoreductase  38.65 
 
 
326 aa  264  1e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000568585 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3877  quinone oxidoreductase  39.88 
 
 
332 aa  265  1e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.161114  normal  0.0453412 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4187  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  39.88 
 
 
332 aa  264  1e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1621  alcohol dehydrogenase  42.38 
 
 
332 aa  264  1e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4497  putative quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  41.23 
 
 
332 aa  264  1e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0178815  hitchhiker  0.00000000000130084 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1597  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.38 
 
 
332 aa  264  1e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.212535  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0695  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  40.8 
 
 
332 aa  264  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00215673  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2493  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.88 
 
 
326 aa  264  1e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0728  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  39.63 
 
 
325 aa  264  2e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.43463 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2606  alcohol dehydrogenase  41.99 
 
 
328 aa  264  2e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.836492  hitchhiker  0.00218108 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1526  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.88 
 
 
327 aa  263  3e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0396  putative quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family protein  39.63 
 
 
325 aa  263  3e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0463  quinone oxidoreductase  39.63 
 
 
325 aa  263  3e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.152247  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0309  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.34 
 
 
328 aa  263  4e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1510  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  42.25 
 
 
331 aa  263  4e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2751  quinone oxidoreductase putative, YhdH/YhfP  42.59 
 
 
323 aa  262  4.999999999999999e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.186347  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00458  alcohol dehydrogenase  40.8 
 
 
326 aa  262  4.999999999999999e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0105  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.84 
 
 
328 aa  262  4.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227745  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3572  alcohol dehydrogenase  40.74 
 
 
326 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>