More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3017 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3017  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  100 
 
 
331 aa  654    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.295678 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1788  hypothetical protein  67.69 
 
 
334 aa  451  1.0000000000000001e-126  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1723  quinone oxidoreductase  67.69 
 
 
334 aa  449  1e-125  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2046  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  52 
 
 
333 aa  320  3e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2606  alcohol dehydrogenase  50.77 
 
 
328 aa  317  2e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.836492  hitchhiker  0.00218108 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1073  alcohol dehydrogenase  52.92 
 
 
334 aa  303  4.0000000000000003e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1612  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  48.33 
 
 
331 aa  290  3e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000615843  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3061  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  51.23 
 
 
335 aa  286  4e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.122526  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1202  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  48.16 
 
 
331 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3877  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  46.34 
 
 
339 aa  282  6.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2219  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  46.01 
 
 
588 aa  276  4e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1264  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  45.9 
 
 
336 aa  271  8.000000000000001e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2364  dehydrogenase NAD(P)-binding domain-containing protein  44.62 
 
 
328 aa  268  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.214717 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1510  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  42.12 
 
 
331 aa  267  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1341  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  42.33 
 
 
330 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000434756  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0808  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  45.4 
 
 
327 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4337  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  44 
 
 
329 aa  264  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270219  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2995  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  46.27 
 
 
331 aa  264  2e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00123098  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5139  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  43.69 
 
 
328 aa  263  4e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3502  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  43.08 
 
 
328 aa  260  2e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.990659  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0804  alcohol dehydrogenase  45.26 
 
 
334 aa  259  3e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1505  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase  44.34 
 
 
330 aa  259  4e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6131  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.07 
 
 
331 aa  258  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4779  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  45.83 
 
 
325 aa  256  3e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.279047  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2535  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.84 
 
 
336 aa  256  5e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351283  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4639  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  45.18 
 
 
332 aa  254  2.0000000000000002e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.316613  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1108  alcohol dehydrogenase  42.77 
 
 
328 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.588532  normal  0.604429 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0105  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.48 
 
 
328 aa  253  3e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227745  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01969  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  41.34 
 
 
329 aa  252  6e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3632  alcohol dehydrogenase  45.09 
 
 
337 aa  251  8.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.118104  normal  0.722964 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0771  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  44.91 
 
 
335 aa  251  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.999993  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3877  quinone oxidoreductase  44.92 
 
 
332 aa  250  2e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.161114  normal  0.0453412 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1230  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.15 
 
 
328 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.606644 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1784  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.54 
 
 
326 aa  249  5e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0104845 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18460  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.33 
 
 
327 aa  249  6e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1314  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  44.14 
 
 
336 aa  248  8e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0952218  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2214  alcohol dehydrogenase  43.9 
 
 
331 aa  248  9e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6206  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  43.59 
 
 
328 aa  247  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.599678  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1526  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.33 
 
 
327 aa  246  3e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1416  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  43.84 
 
 
336 aa  246  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4991  alcohol dehydrogenase  44.31 
 
 
328 aa  246  4.9999999999999997e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4187  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  44.62 
 
 
332 aa  245  6.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1107  alcohol dehydrogenase  44.98 
 
 
331 aa  245  8e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0178  YhdH/YhfP family quinone oxidoreductase  42.94 
 
 
326 aa  244  9.999999999999999e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000873043  normal  0.604397 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0249  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  43.08 
 
 
325 aa  244  9.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0608751  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0181  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  42.99 
 
 
334 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3346  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  45.06 
 
 
328 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.584462  normal  0.149022 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1643  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.15 
 
 
327 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.561484  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2229  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  43.87 
 
 
327 aa  243  3e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.979693 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3205  alcohol dehydrogenase  42.33 
 
 
331 aa  243  3.9999999999999997e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0147594 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2819  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  43.56 
 
 
327 aa  242  5e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0309  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.89 
 
 
328 aa  243  5e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2363  alcohol dehydrogenase  45.09 
 
 
329 aa  242  5e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.949479  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2639  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.59 
 
 
345 aa  243  5e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.718234  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0359  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.94 
 
 
327 aa  242  6e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000624901 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3519  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  42.02 
 
 
330 aa  242  6e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.231356  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1185  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  41.72 
 
 
327 aa  242  7e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0396  putative quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family protein  41.8 
 
 
325 aa  242  7e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0463  quinone oxidoreductase  41.8 
 
 
325 aa  242  7e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.152247  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3835  quinone oxidoreductase  43.08 
 
 
328 aa  241  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4334  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  44.24 
 
 
334 aa  241  1e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.511675  normal  0.564887 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0260  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  42.72 
 
 
325 aa  241  1e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.18967  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1200  putative quinone oxidoreductase  41.8 
 
 
325 aa  240  2e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0700296  normal  0.0860145 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2891  putative oxidoreductase protein  42.48 
 
 
338 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.874963  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2846  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  41.41 
 
 
328 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0354021  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3679  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  43.21 
 
 
326 aa  239  4e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0862676  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5875  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  40.31 
 
 
332 aa  239  5e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0754792  normal  0.429902 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3133  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  43.03 
 
 
338 aa  238  8e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.87638 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0018  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.44 
 
 
334 aa  238  1e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000105442  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40830  putative oxidoreductase  41.4 
 
 
330 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3461  putative oxidoreductase  41.72 
 
 
330 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4413  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  42.72 
 
 
325 aa  236  4e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00493012  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2634  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.85 
 
 
325 aa  236  5.0000000000000005e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.341992  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2365  quinone oxidoreductase  42.15 
 
 
328 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3674  hypothetical protein  41.36 
 
 
324 aa  236  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0677066  normal  0.330413 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1110  alcohol dehydrogenase  39.88 
 
 
331 aa  235  6e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.346069  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1602  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  41.41 
 
 
327 aa  235  7e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3568  protein YhdH  41.36 
 
 
324 aa  235  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.408975  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2767  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  42.73 
 
 
338 aa  235  7e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.372024 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2477  acyl-CoA dehydrogenase-like  43.22 
 
 
738 aa  235  7e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.193974  normal  0.0198771 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3567  protein YhdH  41.36 
 
 
324 aa  235  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000716793  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3639  hypothetical protein  41.36 
 
 
324 aa  235  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000530088 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03112  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  40.62 
 
 
324 aa  235  8e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0728423  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0454  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  40.62 
 
 
324 aa  235  8e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.749607  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3548  quinone oxidoreductase  40.31 
 
 
324 aa  235  8e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000395647  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03063  hypothetical protein  40.62 
 
 
324 aa  235  8e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0710671  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4569  quinone oxidoreductase, YhdH family  40.31 
 
 
324 aa  235  9e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000284525  normal  0.204185 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3737  quinone oxidoreductase  40.31 
 
 
324 aa  235  9e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000296751  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2930  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.13 
 
 
325 aa  235  9e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0254  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  42.33 
 
 
326 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000117637 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1356  putative NADPH:quinone reductase/ Zn-dependent oxidoreductase  39.57 
 
 
353 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3443  quinone oxidoreductase  40.62 
 
 
324 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378871  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0454  quinone oxidoreductase  40.62 
 
 
324 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0267753  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3736  hypothetical protein  41.61 
 
 
324 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0213449 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5289  quinone oxidoreductase  41.72 
 
 
327 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.574483  normal  0.60541 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3679  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  39.88 
 
 
329 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1675  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  42.15 
 
 
327 aa  234  2.0000000000000002e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.509844  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24770  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  45.43 
 
 
328 aa  233  3e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3689  alcohol dehydrogenase  41.61 
 
 
324 aa  233  3e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0316802  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0695  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  41.39 
 
 
332 aa  233  3e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00215673  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>