More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3679 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3679  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  100 
 
 
329 aa  657    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1108  alcohol dehydrogenase  66.15 
 
 
328 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.588532  normal  0.604429 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3502  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  66.77 
 
 
328 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.990659  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0752  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  63.22 
 
 
330 aa  436  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534368  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4337  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  65.35 
 
 
329 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270219  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2364  dehydrogenase NAD(P)-binding domain-containing protein  65.54 
 
 
328 aa  436  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.214717 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1230  zinc-binding alcohol dehydrogenase  65.85 
 
 
328 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.606644 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5139  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  65.23 
 
 
328 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2365  quinone oxidoreductase  63.8 
 
 
328 aa  423  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2846  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  63.69 
 
 
328 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0354021  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5289  quinone oxidoreductase  59.69 
 
 
327 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.574483  normal  0.60541 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3835  quinone oxidoreductase  62.15 
 
 
328 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18460  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  60.92 
 
 
327 aa  404  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2363  alcohol dehydrogenase  62.73 
 
 
329 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.949479  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1248  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  65.85 
 
 
328 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.893092  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1204  quinone oxidoreductase  61.04 
 
 
326 aa  404  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.740135  normal  0.265781 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1434  putative Zn-dependent oxidoreductase  62.54 
 
 
326 aa  401  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2962  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  60.62 
 
 
327 aa  403  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.372073  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0082  alcohol dehydrogenase  63.47 
 
 
326 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0838693  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0808  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  60 
 
 
327 aa  403  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0250  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  59.08 
 
 
327 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.68401  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1643  zinc-binding alcohol dehydrogenase  60.62 
 
 
327 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.561484  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4744  alcohol dehydrogenase  58.77 
 
 
327 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5324  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3700  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  59.08 
 
 
327 aa  396  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5461  zinc-binding alcohol dehydrogenase  59.08 
 
 
327 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0065  alcohol dehydrogenase  61.23 
 
 
326 aa  394  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5401  alcohol dehydrogenase  59.08 
 
 
327 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00910947 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2819  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  59.69 
 
 
327 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1586  alcohol dehydrogenase  59.38 
 
 
330 aa  388  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4869  quinone oxidoreductase  58.15 
 
 
327 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.578327  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1526  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  58.15 
 
 
327 aa  390  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2939  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  58.46 
 
 
327 aa  390  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.533119  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1185  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  60.31 
 
 
327 aa  389  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4187  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  60 
 
 
332 aa  386  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1675  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  58.02 
 
 
327 aa  387  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.509844  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3356  quinone oxidoreductase  57.85 
 
 
327 aa  386  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0638936 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0359  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  55.69 
 
 
327 aa  382  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000624901 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2229  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  58.15 
 
 
327 aa  382  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.979693 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1474  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  57.54 
 
 
331 aa  384  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3877  quinone oxidoreductase  59.69 
 
 
332 aa  383  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.161114  normal  0.0453412 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6206  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  57.54 
 
 
328 aa  383  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.599678  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3408  alcohol dehydrogenase  57.28 
 
 
327 aa  384  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4748  oxidoreductase, zinc-binding  56.31 
 
 
327 aa  378  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2753  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  56.97 
 
 
327 aa  378  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.700456  normal  0.0252326 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3133  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  59.8 
 
 
338 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.87638 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0105  zinc-binding alcohol dehydrogenase  56.92 
 
 
328 aa  378  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227745  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1210  alcohol dehydrogenase  57.85 
 
 
328 aa  380  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.783737  normal  0.219465 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4477  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  57.23 
 
 
327 aa  380  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000206096 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2891  putative oxidoreductase protein  56.29 
 
 
338 aa  375  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.874963  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0309  zinc-binding alcohol dehydrogenase  56 
 
 
328 aa  377  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4334  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  58.46 
 
 
334 aa  377  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.511675  normal  0.564887 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2639  zinc-binding alcohol dehydrogenase  56.31 
 
 
345 aa  377  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.718234  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1223  quinone oxidoreductase  57.59 
 
 
328 aa  373  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2634  zinc-binding alcohol dehydrogenase  56.62 
 
 
325 aa  371  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.341992  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2767  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  58.5 
 
 
338 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.372024 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0766  alcohol dehydrogenase  57.06 
 
 
327 aa  374  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1984  alcohol dehydrogenase  56.31 
 
 
327 aa  374  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0950  quinone oxidoreductase  57.23 
 
 
327 aa  371  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.759216  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2968  alcohol dehydrogenase, zinc-containing protein  55.42 
 
 
327 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0338214  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24770  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  59.08 
 
 
328 aa  369  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2517  putative zinc-binding dehydrogenase  56.48 
 
 
326 aa  367  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.145021  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3034  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  56.36 
 
 
334 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2477  acyl-CoA dehydrogenase-like  58.6 
 
 
738 aa  366  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.193974  normal  0.0198771 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4991  alcohol dehydrogenase  55.69 
 
 
328 aa  362  4e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4779  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  56 
 
 
325 aa  361  1e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.279047  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1893  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  56.35 
 
 
327 aa  359  5e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.695142  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1602  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  52.62 
 
 
327 aa  356  1.9999999999999998e-97  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0728  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  54.77 
 
 
325 aa  357  1.9999999999999998e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.43463 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3189  zinc-binding alcohol dehydrogenase  54.55 
 
 
333 aa  355  5.999999999999999e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.246614  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0612  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  57.23 
 
 
329 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00543509 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2535  zinc-binding alcohol dehydrogenase  54.55 
 
 
336 aa  350  2e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351283  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0467  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  57.19 
 
 
325 aa  342  4e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1035  alcohol dehydrogenase  52.15 
 
 
326 aa  338  9e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1052  quinone oxidoreductase  51.69 
 
 
327 aa  336  2.9999999999999997e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3519  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  52.91 
 
 
330 aa  333  2e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.231356  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0556  alcohol dehydrogenase  54.24 
 
 
328 aa  333  2e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3639  hypothetical protein  52.96 
 
 
324 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000530088 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3568  protein YhdH  52.96 
 
 
324 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.408975  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3567  protein YhdH  52.96 
 
 
324 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000716793  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3674  hypothetical protein  52.65 
 
 
324 aa  332  5e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0677066  normal  0.330413 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2493  zinc-binding alcohol dehydrogenase  50.92 
 
 
326 aa  332  5e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3736  hypothetical protein  52.96 
 
 
324 aa  332  6e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0213449 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1314  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  53.64 
 
 
336 aa  332  7.000000000000001e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0952218  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1416  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  53.64 
 
 
336 aa  331  9e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3346  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  52.74 
 
 
328 aa  331  1e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.584462  normal  0.149022 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0901  alcohol dehydrogenase  50.46 
 
 
327 aa  331  1e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.149382  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3941  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  51.53 
 
 
326 aa  330  2e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2475  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  50.61 
 
 
329 aa  329  3e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001990  alcohol dehydrogenase  51.24 
 
 
326 aa  328  5.0000000000000004e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0178  YhdH/YhfP family quinone oxidoreductase  57.28 
 
 
326 aa  328  1.0000000000000001e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000873043  normal  0.604397 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00458  alcohol dehydrogenase  51.24 
 
 
326 aa  328  1.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3205  alcohol dehydrogenase  54.88 
 
 
331 aa  327  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0147594 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3548  quinone oxidoreductase  51.09 
 
 
324 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000395647  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3632  alcohol dehydrogenase  52.78 
 
 
337 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.118104  normal  0.722964 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0249  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  51.96 
 
 
325 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0608751  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0396  putative quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family protein  49.84 
 
 
325 aa  325  6e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0463  quinone oxidoreductase  49.84 
 
 
325 aa  325  6e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.152247  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0271  alcohol dehydrogenase  50.92 
 
 
326 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000478762 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1107  alcohol dehydrogenase  53.64 
 
 
331 aa  325  8.000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0255  quinone oxidoreductase  50.61 
 
 
326 aa  325  9e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>