More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1612 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1612  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  100 
 
 
331 aa  664    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000615843  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1202  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  69.91 
 
 
331 aa  467  9.999999999999999e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2219  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  55.62 
 
 
588 aa  354  1e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1341  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  53.03 
 
 
330 aa  350  2e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000434756  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2046  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  55.45 
 
 
333 aa  341  9e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3877  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  50.91 
 
 
339 aa  310  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2394  quinone oxidoreductase putative, YhdH/YhfP  46.06 
 
 
348 aa  308  8e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2440  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  46.06 
 
 
348 aa  308  8e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1962  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  47.22 
 
 
330 aa  305  7e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.204015  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2504  alcohol dehydrogenase  48.63 
 
 
326 aa  294  2e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0137334  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1443  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.88 
 
 
331 aa  292  4e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.109309  normal  0.103295 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0178  YhdH/YhfP family quinone oxidoreductase  48.63 
 
 
326 aa  292  6e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000873043  normal  0.604397 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2364  dehydrogenase NAD(P)-binding domain-containing protein  47.11 
 
 
328 aa  291  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.214717 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1073  alcohol dehydrogenase  49.24 
 
 
334 aa  290  2e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3017  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  48.33 
 
 
331 aa  290  3e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.295678 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0463  quinone oxidoreductase  47.55 
 
 
325 aa  288  8e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.152247  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0396  putative quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family protein  47.55 
 
 
325 aa  288  8e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0804  alcohol dehydrogenase  46.63 
 
 
334 aa  288  1e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2995  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  46.83 
 
 
331 aa  287  2e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00123098  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1200  putative quinone oxidoreductase  47.55 
 
 
325 aa  287  2e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0700296  normal  0.0860145 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5139  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  45.9 
 
 
328 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0771  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  46.01 
 
 
335 aa  286  4e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.999993  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4334  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  47.11 
 
 
334 aa  285  5e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.511675  normal  0.564887 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1419  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  47.71 
 
 
328 aa  285  9e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4413  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  46.93 
 
 
325 aa  285  1.0000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00493012  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4497  putative quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  44.48 
 
 
332 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0178815  hitchhiker  0.00000000000130084 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4337  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  46.32 
 
 
329 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270219  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1597  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.39 
 
 
332 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.212535  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1621  alcohol dehydrogenase  49.39 
 
 
332 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0877  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  43.25 
 
 
332 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.128187  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0695  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  44.48 
 
 
332 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00215673  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3737  quinone oxidoreductase  45.09 
 
 
324 aa  282  5.000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000296751  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4569  quinone oxidoreductase, YhdH family  45.09 
 
 
324 aa  282  5.000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000284525  normal  0.204185 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2606  alcohol dehydrogenase  46.67 
 
 
328 aa  282  5.000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.836492  hitchhiker  0.00218108 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03112  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  44.79 
 
 
324 aa  281  8.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0728423  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0454  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  44.79 
 
 
324 aa  281  8.000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.749607  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03063  hypothetical protein  44.79 
 
 
324 aa  281  8.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0710671  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3205  alcohol dehydrogenase  47.11 
 
 
331 aa  281  8.000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0147594 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1264  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  45.73 
 
 
336 aa  281  9e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3572  alcohol dehydrogenase  45.87 
 
 
326 aa  281  1e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3548  quinone oxidoreductase  45.09 
 
 
324 aa  281  1e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000395647  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1108  alcohol dehydrogenase  45.29 
 
 
328 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.588532  normal  0.604429 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2214  alcohol dehydrogenase  44.48 
 
 
331 aa  281  1e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3877  quinone oxidoreductase  46.06 
 
 
332 aa  280  2e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.161114  normal  0.0453412 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2535  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.93 
 
 
336 aa  280  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351283  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3443  quinone oxidoreductase  44.79 
 
 
324 aa  280  2e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378871  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0454  quinone oxidoreductase  44.79 
 
 
324 aa  280  2e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0267753  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3285  quinone oxidoreductase, YhdH family  44.79 
 
 
324 aa  280  2e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00682496  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2365  quinone oxidoreductase  45.9 
 
 
328 aa  280  3e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1505  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase  45.71 
 
 
330 aa  280  3e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4187  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  46.06 
 
 
332 aa  280  3e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0249  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  46.93 
 
 
325 aa  280  3e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0608751  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0556  alcohol dehydrogenase  47.53 
 
 
328 aa  280  3e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0747  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  43.25 
 
 
332 aa  279  4e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0784  alcohol dehydrogenase  43.25 
 
 
332 aa  279  4e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0841407  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1210  alcohol dehydrogenase  45.43 
 
 
328 aa  279  4e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.783737  normal  0.219465 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0947  putative quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  42.94 
 
 
332 aa  279  4e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000079706  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1314  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  47.55 
 
 
336 aa  279  5e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0952218  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0250  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  47.42 
 
 
327 aa  279  5e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.68401  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1567  alcohol dehydrogenase  48.48 
 
 
332 aa  279  5e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0681  alcohol dehydrogenase, zinc containing  43.56 
 
 
332 aa  278  6e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0879  putative quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  43.25 
 
 
332 aa  278  7e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.85611e-27 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2319  putative quinone oxidoreductase  46.34 
 
 
328 aa  278  8e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.721374  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1035  alcohol dehydrogenase  44.34 
 
 
326 aa  278  1e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0839  putative quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  44.17 
 
 
331 aa  277  2e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000366963  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0271  alcohol dehydrogenase  45.87 
 
 
326 aa  276  2e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000478762 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0260  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  46.93 
 
 
325 aa  277  2e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.18967  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1416  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  47.24 
 
 
336 aa  276  3e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1510  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  42.94 
 
 
331 aa  276  3e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0272  quinone oxidoreductase  44.95 
 
 
326 aa  276  3e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000568585 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2846  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  45.29 
 
 
328 aa  276  4e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0354021  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0181  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  43.56 
 
 
334 aa  276  4e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0254  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  45.87 
 
 
326 aa  276  5e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000117637 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3530  alcohol dehydrogenase  45.57 
 
 
326 aa  275  5e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3941  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  45.87 
 
 
326 aa  275  6e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3061  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  47.72 
 
 
335 aa  275  7e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.122526  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0250  alcohol dehydrogenase  45.57 
 
 
326 aa  275  8e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3461  putative oxidoreductase  46.69 
 
 
330 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1110  alcohol dehydrogenase  42.99 
 
 
331 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.346069  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00458  alcohol dehydrogenase  45.12 
 
 
326 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3519  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  45.26 
 
 
330 aa  273  3e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.231356  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1788  hypothetical protein  45.87 
 
 
334 aa  273  3e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3568  protein YhdH  46.63 
 
 
324 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.408975  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3736  hypothetical protein  46.63 
 
 
324 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0213449 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3567  protein YhdH  46.63 
 
 
324 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000716793  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3639  hypothetical protein  46.63 
 
 
324 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000530088 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2363  alcohol dehydrogenase  45.29 
 
 
329 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.949479  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3674  hypothetical protein  46.32 
 
 
324 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0677066  normal  0.330413 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0065  alcohol dehydrogenase  45.12 
 
 
326 aa  273  4.0000000000000004e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3679  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  45.09 
 
 
326 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0862676  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5289  quinone oxidoreductase  47.11 
 
 
327 aa  272  7e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.574483  normal  0.60541 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01969  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  40.73 
 
 
329 aa  271  8.000000000000001e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0082  alcohol dehydrogenase  45.09 
 
 
326 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0838693  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0163  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  43.6 
 
 
335 aa  271  9e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0129955 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001990  alcohol dehydrogenase  44.68 
 
 
326 aa  271  9e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1723  quinone oxidoreductase  45.87 
 
 
334 aa  271  1e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40830  putative oxidoreductase  46.36 
 
 
330 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0252  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  45.26 
 
 
326 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0255  quinone oxidoreductase  45.26 
 
 
326 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3502  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  44.38 
 
 
328 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.990659  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>