More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0804 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_0804  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
334 aa  671    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0771  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  83.89 
 
 
335 aa  556  1e-157  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.999993  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2214  alcohol dehydrogenase  77.2 
 
 
331 aa  518  1e-146  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2995  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  66.26 
 
 
331 aa  436  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00123098  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0181  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  64.35 
 
 
334 aa  432  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1110  alcohol dehydrogenase  62.01 
 
 
331 aa  424  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.346069  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0163  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  62.61 
 
 
335 aa  412  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0129955 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01969  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  59.82 
 
 
329 aa  403  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0877  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  56.63 
 
 
332 aa  378  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.128187  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4497  putative quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  56.33 
 
 
332 aa  378  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0178815  hitchhiker  0.00000000000130084 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0695  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  56.93 
 
 
332 aa  376  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00215673  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0681  alcohol dehydrogenase, zinc containing  55.72 
 
 
332 aa  372  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0947  putative quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  54.82 
 
 
332 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000079706  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3461  putative oxidoreductase  55.79 
 
 
330 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0747  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  54.82 
 
 
332 aa  365  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0879  putative quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  55.12 
 
 
332 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.85611e-27 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1356  putative NADPH:quinone reductase/ Zn-dependent oxidoreductase  55.86 
 
 
353 aa  367  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0784  alcohol dehydrogenase  54.82 
 
 
332 aa  365  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0841407  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1510  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  54.74 
 
 
331 aa  362  4e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40830  putative oxidoreductase  55.49 
 
 
330 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1307  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  50.75 
 
 
333 aa  360  2e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0839  putative quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  56.19 
 
 
331 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000366963  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1264  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  55.05 
 
 
336 aa  349  3e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2529  alcohol dehydrogenase  54.29 
 
 
329 aa  345  5e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.180197  normal  0.304132 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5875  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  51.52 
 
 
332 aa  337  2.9999999999999997e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0754792  normal  0.429902 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0011  Zinc-containing alcohol dehydrogenase  51.99 
 
 
334 aa  332  4e-90  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000787082 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0018  zinc-binding alcohol dehydrogenase  50.91 
 
 
334 aa  332  4e-90  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000105442  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1341  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  51.07 
 
 
330 aa  329  3e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000434756  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2219  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  52.44 
 
 
588 aa  328  9e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1784  zinc-binding alcohol dehydrogenase  50 
 
 
326 aa  326  4.0000000000000003e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0104845 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2957  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.43 
 
 
335 aa  311  1e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4991  alcohol dehydrogenase  51.67 
 
 
328 aa  306  3e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1505  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase  48.62 
 
 
330 aa  294  1e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3346  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  50.46 
 
 
328 aa  293  2e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.584462  normal  0.149022 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4779  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  47.71 
 
 
325 aa  293  3e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.279047  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2475  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  48.01 
 
 
329 aa  290  2e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0178  YhdH/YhfP family quinone oxidoreductase  49.39 
 
 
326 aa  288  8e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000873043  normal  0.604397 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1612  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  46.63 
 
 
331 aa  288  1e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000615843  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4477  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  45.43 
 
 
327 aa  286  4e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000206096 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5139  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  46.5 
 
 
328 aa  286  5e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1586  alcohol dehydrogenase  46.79 
 
 
330 aa  285  8e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5289  quinone oxidoreductase  46.67 
 
 
327 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.574483  normal  0.60541 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2535  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.17 
 
 
336 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351283  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0752  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  45.76 
 
 
330 aa  284  2.0000000000000002e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534368  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1073  alcohol dehydrogenase  50.99 
 
 
334 aa  283  3.0000000000000004e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2229  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  48.01 
 
 
327 aa  282  6.000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.979693 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1675  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  47.85 
 
 
327 aa  282  7.000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.509844  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4744  alcohol dehydrogenase  46.36 
 
 
327 aa  281  9e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5324  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0250  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  46.06 
 
 
327 aa  281  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.68401  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1643  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.57 
 
 
327 aa  278  7e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.561484  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3205  alcohol dehydrogenase  47.15 
 
 
331 aa  278  1e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0147594 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2639  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.9 
 
 
345 aa  278  1e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.718234  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3679  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  45.09 
 
 
326 aa  277  2e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0862676  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0467  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  47.11 
 
 
325 aa  277  2e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2767  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  46.88 
 
 
338 aa  277  2e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.372024 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3133  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  46.88 
 
 
338 aa  276  3e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.87638 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0359  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  46.53 
 
 
327 aa  276  3e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000624901 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2517  putative zinc-binding dehydrogenase  46.95 
 
 
326 aa  276  3e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.145021  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2933  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  48.05 
 
 
332 aa  276  4e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0318941 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3356  quinone oxidoreductase  46.06 
 
 
327 aa  275  9e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0638936 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5461  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.76 
 
 
327 aa  275  9e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5401  alcohol dehydrogenase  45.76 
 
 
327 aa  275  9e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00910947 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1434  putative Zn-dependent oxidoreductase  45.06 
 
 
326 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0309  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.65 
 
 
328 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1229  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.85 
 
 
342 aa  275  1.0000000000000001e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.157055  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1443  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.67 
 
 
331 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.109309  normal  0.103295 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4413  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  46.79 
 
 
325 aa  274  1.0000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00493012  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1416  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  47.87 
 
 
336 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0082  alcohol dehydrogenase  45.06 
 
 
326 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0838693  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2046  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  45.9 
 
 
333 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2819  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  46.81 
 
 
327 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3189  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.9 
 
 
333 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.246614  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1962  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  41.59 
 
 
330 aa  273  3e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.204015  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1314  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  47.56 
 
 
336 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0952218  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1526  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  46.2 
 
 
327 aa  272  5.000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3877  quinone oxidoreductase  47.87 
 
 
332 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.161114  normal  0.0453412 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2634  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.87 
 
 
325 aa  272  7e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.341992  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0105  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.34 
 
 
328 aa  271  8.000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227745  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6206  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  46.95 
 
 
328 aa  271  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.599678  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0728  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  45.57 
 
 
325 aa  271  1e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.43463 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4748  oxidoreductase, zinc-binding  44.98 
 
 
327 aa  270  2e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1202  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  46.5 
 
 
331 aa  270  2e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4869  quinone oxidoreductase  45.15 
 
 
327 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.578327  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3519  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  45.78 
 
 
330 aa  271  2e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.231356  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3502  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  45.73 
 
 
328 aa  271  2e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.990659  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2319  putative quinone oxidoreductase  46.18 
 
 
328 aa  270  2e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.721374  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0808  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  46.2 
 
 
327 aa  270  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0556  alcohol dehydrogenase  46.81 
 
 
328 aa  271  2e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3408  alcohol dehydrogenase  45.26 
 
 
327 aa  270  2.9999999999999997e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3034  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  48.2 
 
 
334 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4187  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  47.56 
 
 
332 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2891  putative oxidoreductase protein  45.99 
 
 
338 aa  269  4e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.874963  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2846  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  47.09 
 
 
328 aa  270  4e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0354021  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4639  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  49.38 
 
 
332 aa  269  5e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.316613  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0260  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  45.4 
 
 
325 aa  268  7e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.18967  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3674  hypothetical protein  44.65 
 
 
324 aa  268  8.999999999999999e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0677066  normal  0.330413 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2364  dehydrogenase NAD(P)-binding domain-containing protein  44.34 
 
 
328 aa  268  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.214717 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3639  hypothetical protein  44.34 
 
 
324 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000530088 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3567  protein YhdH  44.34 
 
 
324 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000716793  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1204  quinone oxidoreductase  45.76 
 
 
326 aa  268  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.740135  normal  0.265781 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>