More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_2440 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_2394  quinone oxidoreductase putative, YhdH/YhfP  100 
 
 
348 aa  711    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2440  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  100 
 
 
348 aa  711    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1962  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  69.88 
 
 
330 aa  493  9.999999999999999e-139  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.204015  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1341  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  50.15 
 
 
330 aa  335  9e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000434756  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2219  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  49.56 
 
 
588 aa  331  1e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1612  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  46.06 
 
 
331 aa  308  8e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000615843  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40830  putative oxidoreductase  44.24 
 
 
330 aa  292  5e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1202  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.04 
 
 
331 aa  291  1e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3461  putative oxidoreductase  44.24 
 
 
330 aa  290  3e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1419  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  43.87 
 
 
328 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2214  alcohol dehydrogenase  41.1 
 
 
331 aa  278  8e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0018  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.88 
 
 
334 aa  277  2e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000105442  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0877  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  40.37 
 
 
332 aa  271  1e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.128187  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0011  Zinc-containing alcohol dehydrogenase  38.34 
 
 
334 aa  270  2e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000787082 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0695  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  41.54 
 
 
332 aa  271  2e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00215673  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3205  alcohol dehydrogenase  42.81 
 
 
331 aa  270  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0147594 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5875  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  42.2 
 
 
332 aa  269  4e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0754792  normal  0.429902 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4497  putative quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  40.92 
 
 
332 aa  270  4e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0178815  hitchhiker  0.00000000000130084 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1307  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  40.12 
 
 
333 aa  269  5e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0879  putative quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  40.67 
 
 
332 aa  269  5e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.85611e-27 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4337  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  43.9 
 
 
329 aa  269  5e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270219  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0747  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  40.37 
 
 
332 aa  267  2e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2529  alcohol dehydrogenase  44.67 
 
 
329 aa  267  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.180197  normal  0.304132 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0784  alcohol dehydrogenase  40.37 
 
 
332 aa  267  2e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0841407  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2819  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  41.85 
 
 
327 aa  266  4e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0804  alcohol dehydrogenase  41.1 
 
 
334 aa  266  5e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2475  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  39.57 
 
 
329 aa  266  5e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0681  alcohol dehydrogenase, zinc containing  39.45 
 
 
332 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0181  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  40.24 
 
 
334 aa  265  7e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0178  YhdH/YhfP family quinone oxidoreductase  41.95 
 
 
326 aa  265  8.999999999999999e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000873043  normal  0.604397 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1505  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase  40.24 
 
 
330 aa  265  1e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1510  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  42.02 
 
 
331 aa  265  1e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2231  alcohol dehydrogenase  39.38 
 
 
326 aa  264  1e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.499373  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2753  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.08 
 
 
327 aa  264  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.700456  normal  0.0252326 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0163  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  40.48 
 
 
335 aa  263  2e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0129955 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0947  putative quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  40.31 
 
 
332 aa  263  2e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000079706  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3519  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  41.16 
 
 
330 aa  264  2e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.231356  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1108  alcohol dehydrogenase  42.2 
 
 
328 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.588532  normal  0.604429 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3502  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  42.51 
 
 
328 aa  263  3e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.990659  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1443  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.28 
 
 
331 aa  263  3e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.109309  normal  0.103295 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0467  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  40.85 
 
 
325 aa  263  3e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2154  alcohol dehydrogenase  39.08 
 
 
326 aa  263  3e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.573953  normal  0.0933085 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01969  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  39.51 
 
 
329 aa  262  6.999999999999999e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4334  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  40.98 
 
 
334 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.511675  normal  0.564887 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5139  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  40.98 
 
 
328 aa  262  8e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3034  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.39 
 
 
334 aa  261  8.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2535  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.04 
 
 
336 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351283  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2995  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  41.23 
 
 
331 aa  261  1e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00123098  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1230  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.59 
 
 
328 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.606644 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2846  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  40.98 
 
 
328 aa  260  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0354021  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3877  quinone oxidoreductase  40.61 
 
 
332 aa  261  2e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.161114  normal  0.0453412 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2517  putative zinc-binding dehydrogenase  40.43 
 
 
326 aa  260  3e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.145021  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3679  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  38.58 
 
 
326 aa  260  3e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0862676  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3189  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.09 
 
 
333 aa  260  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.246614  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3877  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.16 
 
 
339 aa  259  4e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0771  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  40.8 
 
 
335 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.999993  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4477  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  40.18 
 
 
327 aa  259  5.0000000000000005e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000206096 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1643  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.69 
 
 
327 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.561484  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0839  putative quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  40.62 
 
 
331 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000366963  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4187  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  40.3 
 
 
332 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2364  dehydrogenase NAD(P)-binding domain-containing protein  42.77 
 
 
328 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.214717 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0728  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  39.2 
 
 
325 aa  259  5.0000000000000005e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.43463 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2639  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.41 
 
 
345 aa  258  9e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.718234  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1474  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  39.88 
 
 
331 aa  258  1e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1264  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  40.18 
 
 
336 aa  258  1e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2968  alcohol dehydrogenase, zinc-containing protein  41.85 
 
 
327 aa  256  3e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0338214  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0271  alcohol dehydrogenase  38.41 
 
 
326 aa  256  3e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000478762 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3941  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  38.23 
 
 
326 aa  256  3e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3408  alcohol dehydrogenase  40.74 
 
 
327 aa  256  3e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3572  alcohol dehydrogenase  40.8 
 
 
326 aa  256  4e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3700  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  40.62 
 
 
327 aa  256  4e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2933  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  40.06 
 
 
332 aa  256  6e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0318941 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2046  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.63 
 
 
333 aa  255  8e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0272  quinone oxidoreductase  38.11 
 
 
326 aa  255  9e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000568585 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2751  quinone oxidoreductase putative, YhdH/YhfP  42.02 
 
 
323 aa  255  9e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.186347  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2829  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  42.02 
 
 
323 aa  255  9e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.350559  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03112  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  38.46 
 
 
324 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0728423  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0454  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  38.46 
 
 
324 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.749607  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0454  quinone oxidoreductase  38.46 
 
 
324 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0267753  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03063  hypothetical protein  38.46 
 
 
324 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0710671  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3443  quinone oxidoreductase  38.46 
 
 
324 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378871  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4991  alcohol dehydrogenase  40.31 
 
 
328 aa  254  1.0000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2504  alcohol dehydrogenase  41.34 
 
 
326 aa  253  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0137334  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3548  quinone oxidoreductase  38.15 
 
 
324 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000395647  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3737  quinone oxidoreductase  38.15 
 
 
324 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000296751  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0752  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  39.51 
 
 
330 aa  254  2.0000000000000002e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534368  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4569  quinone oxidoreductase, YhdH family  38.15 
 
 
324 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000284525  normal  0.204185 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2365  quinone oxidoreductase  39.76 
 
 
328 aa  253  3e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3679  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  39.26 
 
 
329 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6206  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  39.57 
 
 
328 aa  253  5.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.599678  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3530  alcohol dehydrogenase  38.23 
 
 
326 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4779  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  40.12 
 
 
325 aa  252  6e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.279047  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3285  quinone oxidoreductase, YhdH family  37.85 
 
 
324 aa  252  7e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00682496  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1526  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40.31 
 
 
327 aa  252  8.000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0309  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.26 
 
 
328 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1356  putative NADPH:quinone reductase/ Zn-dependent oxidoreductase  38.99 
 
 
353 aa  251  1e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0950  quinone oxidoreductase  40.37 
 
 
327 aa  251  1e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.759216  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0835  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  40.84 
 
 
332 aa  251  1e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1984  alcohol dehydrogenase  40 
 
 
327 aa  251  1e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2767  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  39.63 
 
 
338 aa  250  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.372024 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>