More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3189 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3189  zinc-binding alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 333 aa  665    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.246614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3034  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  86.79 
 
 		 334 aa  585  1e-166  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3133  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  74.27 
 
 		 338 aa  497  1e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.87638 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2767  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  73.68 
 
 		 338 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.372024 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2891  putative oxidoreductase protein  73.39 
 
 		 338 aa  488  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.874963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2517  putative zinc-binding dehydrogenase  69.39 
 
 		 326 aa  449  1e-125  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.145021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2634  zinc-binding alcohol dehydrogenase  67.78 
 
 		 325 aa  441  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.341992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1643  zinc-binding alcohol dehydrogenase  64.05 
 
 		 327 aa  428  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.561484  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2819  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  66.16 
 
 		 327 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0359  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  64.05 
 
 		 327 aa  412  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000624901 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4477  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  60.61 
 
 		 327 aa  411  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000206096 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3700  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  64.35 
 
 		 327 aa  408  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5289  quinone oxidoreductase  62.12 
 
 		 327 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.574483  normal  0.60541 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2939  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  63.75 
 
 		 327 aa  404  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.533119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1204  quinone oxidoreductase  61.63 
 
 		 326 aa  403  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.740135  normal  0.265781 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0808  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  61.93 
 
 		 327 aa  401  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5461  zinc-binding alcohol dehydrogenase  62.12 
 
 		 327 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4744  alcohol dehydrogenase  61.82 
 
 		 327 aa  401  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5401  alcohol dehydrogenase  62.12 
 
 		 327 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00910947 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3356  quinone oxidoreductase  62.12 
 
 		 327 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0638936 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0250  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  60.61 
 
 		 327 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.68401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1185  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  63.14 
 
 		 327 aa  398  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2753  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  60.98 
 
 		 327 aa  396  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.700456  normal  0.0252326 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1526  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  61.33 
 
 		 327 aa  396  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5139  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  60.42 
 
 		 328 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0901  alcohol dehydrogenase  60.12 
 
 		 327 aa  395  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.149382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4869  quinone oxidoreductase  60.91 
 
 		 327 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.578327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1108  alcohol dehydrogenase  62.12 
 
 		 328 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.588532  normal  0.604429 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2968  alcohol dehydrogenase, zinc-containing protein  60.12 
 
 		 327 aa  391  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0338214  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1984  alcohol dehydrogenase  59.21 
 
 		 327 aa  391  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1893  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  63.03 
 
 		 327 aa  394  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.695142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1230  zinc-binding alcohol dehydrogenase  60.3 
 
 		 328 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.606644 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4337  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  59.7 
 
 		 329 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270219  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24770  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  64.16 
 
 		 328 aa  389  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3408  alcohol dehydrogenase  58.05 
 
 		 327 aa  388  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0752  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  58.61 
 
 		 330 aa  387  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1223  quinone oxidoreductase  60.24 
 
 		 328 aa  385  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2962  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  60 
 
 		 327 aa  387  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.372073  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3502  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  59.7 
 
 		 328 aa  387  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.990659  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2639  zinc-binding alcohol dehydrogenase  59.09 
 
 		 345 aa  386  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.718234  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1210  alcohol dehydrogenase  62.12 
 
 		 328 aa  387  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.783737  normal  0.219465 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2364  dehydrogenase NAD(P)-binding domain-containing protein  58.31 
 
 		 328 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.214717 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0766  alcohol dehydrogenase  58.91 
 
 		 327 aa  379  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1602  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  59.21 
 
 		 327 aa  381  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4779  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  58.48 
 
 		 325 aa  376  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.279047  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18460  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  56.97 
 
 		 327 aa  374  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0065  alcohol dehydrogenase  58.97 
 
 		 326 aa  375  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0309  zinc-binding alcohol dehydrogenase  57.83 
 
 		 328 aa  371  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2477  acyl-CoA dehydrogenase-like  62.5 
 
 		 738 aa  372  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.193974  normal  0.0198771 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1052  quinone oxidoreductase  58.73 
 
 		 327 aa  372  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4748  oxidoreductase, zinc-binding  54.08 
 
 		 327 aa  369  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6206  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  59.04 
 
 		 328 aa  370  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.599678  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1248  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  60.42 
 
 		 328 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.893092  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1474  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  57.32 
 
 		 331 aa  370  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4991  alcohol dehydrogenase  56.97 
 
 		 328 aa  370  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0105  zinc-binding alcohol dehydrogenase  57.53 
 
 		 328 aa  365  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227745  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0950  quinone oxidoreductase  55.32 
 
 		 327 aa  367  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.759216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2846  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  57.27 
 
 		 328 aa  362  6e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0354021  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0612  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  57.75 
 
 		 329 aa  360  2e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00543509 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1675  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  58.36 
 
 		 327 aa  359  3e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.509844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0082  alcohol dehydrogenase  55.76 
 
 		 326 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0838693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1434  putative Zn-dependent oxidoreductase  55.76 
 
 		 326 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0728  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  56.27 
 
 		 325 aa  355  5.999999999999999e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.43463 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3679  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  54.55 
 
 		 329 aa  355  5.999999999999999e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2475  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  54.35 
 
 		 329 aa  351  1e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2229  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  57.58 
 
 		 327 aa  351  1e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.979693 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2365  quinone oxidoreductase  56.67 
 
 		 328 aa  351  1e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1586  alcohol dehydrogenase  53.15 
 
 		 330 aa  350  2e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3835  quinone oxidoreductase  55.76 
 
 		 328 aa  345  8e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2493  zinc-binding alcohol dehydrogenase  52.73 
 
 		 326 aa  342  4e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2363  alcohol dehydrogenase  54.55 
 
 		 329 aa  342  5.999999999999999e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.949479  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1035  alcohol dehydrogenase  52.73 
 
 		 326 aa  337  9.999999999999999e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0255  quinone oxidoreductase  52.42 
 
 		 326 aa  335  7e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0252  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  52.12 
 
 		 326 aa  334  1e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4334  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  53.78 
 
 		 334 aa  334  1e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.511675  normal  0.564887 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001990  alcohol dehydrogenase  51.21 
 
 		 326 aa  333  3e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0254  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  51.52 
 
 		 326 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000117637 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0271  alcohol dehydrogenase  51.82 
 
 		 326 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000478762 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0250  alcohol dehydrogenase  51.52 
 
 		 326 aa  331  9e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00458  alcohol dehydrogenase  50.3 
 
 		 326 aa  331  9e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2154  alcohol dehydrogenase  52.12 
 
 		 326 aa  331  1e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.573953  normal  0.0933085 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3877  quinone oxidoreductase  53.5 
 
 		 332 aa  330  2e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.161114  normal  0.0453412 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03112  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  50.91 
 
 		 324 aa  329  3e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0728423  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0454  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  50.91 
 
 		 324 aa  329  3e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.749607  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3443  quinone oxidoreductase  51.21 
 
 		 324 aa  329  3e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378871  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03063  hypothetical protein  50.91 
 
 		 324 aa  329  3e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0710671  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0454  quinone oxidoreductase  51.21 
 
 		 324 aa  329  3e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0267753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4187  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  53.33 
 
 		 332 aa  329  4e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4569  quinone oxidoreductase, YhdH family  50.61 
 
 		 324 aa  329  4e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000284525  normal  0.204185 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3737  quinone oxidoreductase  50.61 
 
 		 324 aa  329  4e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000296751  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2231  alcohol dehydrogenase  51.82 
 
 		 326 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.499373  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3548  quinone oxidoreductase  50.91 
 
 		 324 aa  329  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000395647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3285  quinone oxidoreductase, YhdH family  50.3 
 
 		 324 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00682496  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4413  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  51.98 
 
 		 325 aa  325  5e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00493012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3941  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  50.91 
 
 		 326 aa  325  5e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0249  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  49.7 
 
 		 325 aa  325  8.000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0608751  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3736  hypothetical protein  50.61 
 
 		 324 aa  323  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0213449 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3572  alcohol dehydrogenase  52.12 
 
 		 326 aa  323  2e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3530  alcohol dehydrogenase  50 
 
 		 326 aa  323  2e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3639  hypothetical protein  50.61 
 
 		 324 aa  323  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000530088 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>