149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0193 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0193  GerA spore germination protein  100 
 
 
487 aa  979    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2069  GerA spore germination protein  51.75 
 
 
505 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0159495  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0629  GerA spore germination protein  53.18 
 
 
500 aa  534  1e-150  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3436  GerA spore germination protein  51.46 
 
 
497 aa  530  1e-149  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1373  GerA spore germination protein  53.18 
 
 
528 aa  516  1.0000000000000001e-145  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0381  GerA spore germination protein  49.9 
 
 
492 aa  483  1e-135  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1245  GerA spore germination protein  53.29 
 
 
496 aa  479  1e-134  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2243  GerA spore germination protein  48.67 
 
 
490 aa  462  1e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1110  GerA spore germination protein  48.36 
 
 
509 aa  464  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4085  stage V sporulation protein AF  45.93 
 
 
490 aa  449  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000209358 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4134  stage V sporulation protein AF  45.93 
 
 
490 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3975  stage V sporulation protein AF  45.93 
 
 
490 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3805  stage V sporulation protein AF  45.93 
 
 
490 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3820  stage V sporulation protein AF  45.93 
 
 
490 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4286  stage V sporulation protein AF  45.93 
 
 
490 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.41401  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2763  GerA spore germination protein  45.7 
 
 
490 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3894  GerA spore germination protein  46.14 
 
 
490 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.422224  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4196  stage V sporulation protein AF  45.93 
 
 
490 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00517617  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4173  stage V sporulation protein AF  46.34 
 
 
490 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271517  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1065  stage V sporulation protein AF  46.14 
 
 
490 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.396265  normal  0.413408 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07080  GerA spore germination protein  44.28 
 
 
501 aa  443  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1611  GerA spore germination protein  47.17 
 
 
493 aa  436  1e-121  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000599872  unclonable  8.60289e-23 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1241  spore germination protein AF  39.78 
 
 
473 aa  385  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0376224  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1053  GerA spore germination protein  39.35 
 
 
473 aa  384  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.273737  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1562  GerA spore germination protein  38.89 
 
 
499 aa  355  1e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.791927  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0751  GerA spore germination protein  35.38 
 
 
473 aa  320  3.9999999999999996e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2042  GerA spore germination protein  37.05 
 
 
560 aa  280  5e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.480991 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00100  GerA spore germination protein  37.41 
 
 
531 aa  273  7e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2663  GerA spore germination protein  31.88 
 
 
517 aa  268  2e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2464  GerA spore germination protein  32.05 
 
 
541 aa  262  1e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0139  spore germination protein KA  32.89 
 
 
523 aa  261  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1014  GerA spore germination protein  31.22 
 
 
533 aa  258  2e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000120979 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2765  GerA spore germination protein  33.91 
 
 
490 aa  256  6e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000513551  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3160  spore germination protein GerAA  30.51 
 
 
524 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.275074 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2904  GerA family spore germination protein  33.01 
 
 
437 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0141963  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2928  spore germination protein GerAA  32.77 
 
 
437 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3150  spore germination protein GerAA  32.77 
 
 
437 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0803  GerA spore germination protein  30.66 
 
 
511 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.905177  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0297  GerA spore germination protein  33.4 
 
 
512 aa  251  2e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2853  spore germination protein  32.77 
 
 
524 aa  250  4e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0927787  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0603  GerA spore germination protein  34.01 
 
 
534 aa  250  4e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3138  spore germination protein GerAA  32.77 
 
 
524 aa  250  4e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3167  spore germination protein GerAA  32.77 
 
 
524 aa  249  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.580414  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2101  spore germination protein GerAA  30.51 
 
 
524 aa  248  1e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0675  spore germination protein GerLA  30.27 
 
 
478 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0619  spore germination protein  30.27 
 
 
492 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0709  spore germination protein GerLA  30.27 
 
 
478 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0548  GerA spore germination protein  31.33 
 
 
500 aa  244  3e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0763  spore germination protein GerLA  30.27 
 
 
489 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000217603 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1194  grkA; spore germination protein, GrkA  32.22 
 
 
537 aa  243  5e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.616884  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0837  spore germination protein GerLA  30.49 
 
 
489 aa  243  5e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4666  spore germination protein GerKA  30.91 
 
 
500 aa  243  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.5266399999999997e-20 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0619  spore germination protein  30.27 
 
 
492 aa  243  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3202  spore germination protein KA  34.79 
 
 
530 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3659  GerA spore germination protein  31.85 
 
 
510 aa  240  4e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0765  spore germination protein GerKA  30.29 
 
 
500 aa  240  4e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0691  spore germination protein GerKA  29.74 
 
 
500 aa  238  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0778  spore germination protein GerLA  30.27 
 
 
492 aa  238  2e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0546  spore germination protein KA  29.74 
 
 
500 aa  238  2e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0846  GerA spore germination protein  31.58 
 
 
540 aa  238  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0671  spore germination protein GerKA  30.5 
 
 
500 aa  238  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3282  GerA spore germination protein  31.52 
 
 
499 aa  238  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000691632  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0602  spore germination protein GerKA  29.54 
 
 
500 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0635  spore germination protein GerKA  29.54 
 
 
500 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2438  GerA spore germination protein  30.82 
 
 
587 aa  236  5.0000000000000005e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0546  spore germination protein KA  29.34 
 
 
500 aa  236  6e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2062  GerA spore germination protein  29.27 
 
 
511 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4594  spore germination protein GerLA  30.27 
 
 
492 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0438  GerA spore germination protein  33.11 
 
 
599 aa  234  2.0000000000000002e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.561382  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0078  germination protein  32.2 
 
 
517 aa  234  2.0000000000000002e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2278  GerA spore germination protein  32.59 
 
 
537 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1461  GerA spore germination protein  30.36 
 
 
558 aa  233  4.0000000000000004e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0743  spore germination protein GerLA  30.27 
 
 
492 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.702364  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0624  GerA spore germination protein  30.49 
 
 
492 aa  233  5e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0876  GerA spore germination protein  31.21 
 
 
530 aa  233  5e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0604  GerA spore germination protein  34.07 
 
 
534 aa  232  9e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0054  GerA spore germination protein  33.67 
 
 
544 aa  232  1e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1732  GerA spore germination protein  32.34 
 
 
633 aa  231  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0667  GerA spore germination protein  30.16 
 
 
589 aa  229  9e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2953  GerA spore germination protein  30.58 
 
 
622 aa  229  9e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2456  GerA spore germination protein  28.54 
 
 
520 aa  228  2e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1936  GerA spore germination protein  31.94 
 
 
596 aa  227  3e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1971  GerA spore germination protein  29.56 
 
 
592 aa  227  4e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0521  GerA spore germination protein  29.18 
 
 
578 aa  226  5.0000000000000005e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1956  GerA spore germination protein  32.45 
 
 
531 aa  227  5.0000000000000005e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0057  GerA spore germination protein  29.49 
 
 
523 aa  226  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2167  GerA spore germination protein  31 
 
 
541 aa  224  3e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.087983  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1767  GerA spore germination protein  30 
 
 
504 aa  223  8e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0654  GerA spore germination protein  30 
 
 
530 aa  222  9e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0597  GerA spore germination protein  29.11 
 
 
488 aa  219  7e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0585  GerA spore germination protein  30.37 
 
 
552 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.70288  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0829  GerA spore germination protein  29.65 
 
 
492 aa  214  2.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0892  GerA spore germination protein  29 
 
 
504 aa  211  3e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3014  GerA spore germination protein  27.35 
 
 
519 aa  206  5e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1558  GerA spore germination protein  32.92 
 
 
495 aa  205  2e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0199  spore germination protein, gerabka family  26.91 
 
 
511 aa  204  4e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2753  spore germination protein XA  27.42 
 
 
454 aa  204  4e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.32378  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0236  spore germination protein, gerabka family  26.91 
 
 
511 aa  204  4e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0157  spore germination protein xa  28.24 
 
 
492 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3599  spore germination protein  29.8 
 
 
512 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>