149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2167 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2167  GerA spore germination protein  100 
 
 
541 aa  1105    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.087983  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0139  spore germination protein KA  63.23 
 
 
523 aa  711    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3659  GerA spore germination protein  62.43 
 
 
510 aa  682    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2042  GerA spore germination protein  49.35 
 
 
560 aa  512  1e-144  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.480991 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3202  spore germination protein KA  49.81 
 
 
530 aa  514  1e-144  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0585  GerA spore germination protein  51.9 
 
 
552 aa  497  1e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.70288  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0803  GerA spore germination protein  47.82 
 
 
511 aa  481  1e-134  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.905177  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2438  GerA spore germination protein  45.97 
 
 
587 aa  470  1.0000000000000001e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2464  GerA spore germination protein  46.02 
 
 
541 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0846  GerA spore germination protein  44.8 
 
 
540 aa  449  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0297  GerA spore germination protein  45.4 
 
 
512 aa  451  1e-125  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2278  GerA spore germination protein  43.96 
 
 
537 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1014  GerA spore germination protein  44.03 
 
 
533 aa  448  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000120979 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00100  GerA spore germination protein  44.64 
 
 
531 aa  444  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3160  spore germination protein GerAA  43.22 
 
 
524 aa  436  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.275074 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3138  spore germination protein GerAA  42.37 
 
 
524 aa  437  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2101  spore germination protein GerAA  42.37 
 
 
524 aa  437  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2853  spore germination protein  42.18 
 
 
524 aa  433  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0927787  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0054  GerA spore germination protein  42.2 
 
 
544 aa  433  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1461  GerA spore germination protein  45.7 
 
 
558 aa  431  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3167  spore germination protein GerAA  41.98 
 
 
524 aa  432  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.580414  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2456  GerA spore germination protein  40.55 
 
 
520 aa  421  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0078  germination protein  43.16 
 
 
517 aa  413  1e-114  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0876  GerA spore germination protein  40.15 
 
 
530 aa  414  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1194  grkA; spore germination protein, GrkA  44.11 
 
 
537 aa  410  1e-113  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.616884  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2663  GerA spore germination protein  41.72 
 
 
517 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0057  GerA spore germination protein  42.22 
 
 
523 aa  402  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2765  GerA spore germination protein  43.07 
 
 
490 aa  402  1e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000513551  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0603  GerA spore germination protein  42.8 
 
 
534 aa  402  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3014  GerA spore germination protein  40.08 
 
 
519 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2928  spore germination protein GerAA  48.01 
 
 
437 aa  396  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2904  GerA family spore germination protein  47.76 
 
 
437 aa  396  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0141963  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3150  spore germination protein GerAA  48.01 
 
 
437 aa  396  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3282  GerA spore germination protein  40.84 
 
 
499 aa  396  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000691632  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0765  spore germination protein GerKA  41.78 
 
 
500 aa  386  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0691  spore germination protein GerKA  41.22 
 
 
500 aa  383  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0546  spore germination protein KA  41.22 
 
 
500 aa  383  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1732  GerA spore germination protein  38.34 
 
 
633 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0671  spore germination protein GerKA  40.7 
 
 
500 aa  383  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4666  spore germination protein GerKA  39.46 
 
 
500 aa  381  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.5266399999999997e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0602  spore germination protein GerKA  41.02 
 
 
500 aa  382  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0546  spore germination protein KA  40.82 
 
 
500 aa  380  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0635  spore germination protein GerKA  41.02 
 
 
500 aa  382  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0548  GerA spore germination protein  41.43 
 
 
500 aa  380  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0654  GerA spore germination protein  39.56 
 
 
530 aa  382  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1971  GerA spore germination protein  36.19 
 
 
592 aa  376  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0438  GerA spore germination protein  38.83 
 
 
599 aa  374  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.561382  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0667  GerA spore germination protein  38.54 
 
 
589 aa  374  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5573  GerA spore germination protein  38.74 
 
 
515 aa  374  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.32214 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1936  GerA spore germination protein  41.44 
 
 
596 aa  374  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0837  spore germination protein GerLA  38.62 
 
 
489 aa  360  5e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0675  spore germination protein GerLA  38.64 
 
 
478 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0709  spore germination protein GerLA  38.64 
 
 
478 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0604  GerA spore germination protein  39.54 
 
 
534 aa  358  1.9999999999999998e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0619  spore germination protein  38.41 
 
 
492 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2953  GerA spore germination protein  38.75 
 
 
622 aa  357  3.9999999999999996e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0763  spore germination protein GerLA  38.21 
 
 
489 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000217603 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0619  spore germination protein  38.01 
 
 
492 aa  355  2e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3070  GerA spore germination protein  39.96 
 
 
496 aa  355  2e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3599  spore germination protein  38.95 
 
 
512 aa  353  5e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1558  GerA spore germination protein  38.7 
 
 
495 aa  350  3e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0778  spore germination protein GerLA  38.82 
 
 
492 aa  350  5e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0597  GerA spore germination protein  37.65 
 
 
488 aa  346  5e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0743  spore germination protein GerLA  38.41 
 
 
492 aa  345  1e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.702364  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4594  spore germination protein GerLA  38.41 
 
 
492 aa  345  2e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0521  GerA spore germination protein  37.78 
 
 
578 aa  344  2e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0624  GerA spore germination protein  38.29 
 
 
492 aa  341  2e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1634  spore germination protein  37.63 
 
 
512 aa  339  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3369  spore germination protein  39.87 
 
 
512 aa  336  7e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0478776  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3633  spore germination protein  39.87 
 
 
512 aa  336  7e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3582  spore germination protein  39.65 
 
 
512 aa  336  7.999999999999999e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3332  spore germination protein  39.65 
 
 
512 aa  335  1e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3282  spore germination protein  39.22 
 
 
512 aa  332  1e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2062  GerA spore germination protein  34.96 
 
 
511 aa  332  1e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3682  spore germination protein  39.22 
 
 
512 aa  331  2e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2341  GerA spore germination protein  35.85 
 
 
502 aa  329  6e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532317  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1709  GerZA  36.31 
 
 
497 aa  327  3e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000504866 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0829  GerA spore germination protein  36.76 
 
 
492 aa  326  5e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1956  GerA spore germination protein  34.7 
 
 
531 aa  310  5e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0892  GerA spore germination protein  36.06 
 
 
504 aa  300  4e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4483  spore germination protein  40.57 
 
 
735 aa  293  5e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4874  spore germination protein GerHA  40.31 
 
 
734 aa  293  6e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4630  spore germination protein GerHA  40.57 
 
 
747 aa  293  7e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4984  spore germination protein GerHA  40.57 
 
 
747 aa  293  7e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0392  spore germination protein IA  40.31 
 
 
754 aa  291  2e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4464  spore germination protein  40.05 
 
 
773 aa  290  4e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1767  GerA spore germination protein  34.23 
 
 
504 aa  290  4e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4844  spore germination protein gerIA  40.31 
 
 
754 aa  289  9e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0520951  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0199  spore germination protein, gerabka family  35.43 
 
 
511 aa  289  1e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0236  spore germination protein, gerabka family  35.43 
 
 
511 aa  289  1e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3142  spore germination protein, GerA family  40.84 
 
 
481 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.401489 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4563  GerA spore germination protein  40.31 
 
 
652 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4852  spore germination protein GerHA  39.04 
 
 
455 aa  287  4e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2888  GerA family spore germination protein  37.74 
 
 
499 aa  286  5e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0644485  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4869  spore germination protein GerHA  39.04 
 
 
455 aa  286  7e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3121  spore germination protein QA  38.17 
 
 
499 aa  286  7e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2116  spore germination protein, GerA family  37.74 
 
 
499 aa  282  1e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0225  spore germination protein XA  32.23 
 
 
511 aa  281  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000185218 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2753  spore germination protein XA  34.31 
 
 
454 aa  280  5e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.32378  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0643  GerA spore germination protein  37.25 
 
 
503 aa  280  5e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>