149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0629 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0629  GerA spore germination protein  100 
 
 		 500 aa  1014    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2069  GerA spore germination protein  53.37 
 
 		 505 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0159495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1373  GerA spore germination protein  52.77 
 
 		 528 aa  552  1e-156  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3436  GerA spore germination protein  50.41 
 
 		 497 aa  538  9.999999999999999e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1245  GerA spore germination protein  58.09 
 
 		 496 aa  536  1e-151  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0193  GerA spore germination protein  53.18 
 
 		 487 aa  534  1e-150  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1110  GerA spore germination protein  49.69 
 
 		 509 aa  495  1e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1611  GerA spore germination protein  47.82 
 
 		 493 aa  475  1e-133  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000599872  unclonable  8.60289e-23 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0381  GerA spore germination protein  46.89 
 
 		 492 aa  473  1e-132  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2243  GerA spore germination protein  48.13 
 
 		 490 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2763  GerA spore germination protein  46.09 
 
 		 490 aa  449  1e-125  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07080  GerA spore germination protein  43.7 
 
 		 501 aa  449  1e-125  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3975  stage V sporulation protein AF  45.45 
 
 		 490 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3805  stage V sporulation protein AF  45.45 
 
 		 490 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4085  stage V sporulation protein AF  45.45 
 
 		 490 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000209358 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3820  stage V sporulation protein AF  45.45 
 
 		 490 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4286  stage V sporulation protein AF  45.45 
 
 		 490 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.41401  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4196  stage V sporulation protein AF  45.45 
 
 		 490 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00517617  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4173  stage V sporulation protein AF  45.24 
 
 		 490 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271517  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1065  stage V sporulation protein AF  45.24 
 
 		 490 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.396265  normal  0.413408 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4134  stage V sporulation protein AF  45.24 
 
 		 490 aa  443  1e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3894  GerA spore germination protein  44.82 
 
 		 490 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.422224  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1241  spore germination protein AF  43.17 
 
 		 473 aa  404  1e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0376224  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1053  GerA spore germination protein  43.17 
 
 		 473 aa  404  1e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.273737  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0751  GerA spore germination protein  38.28 
 
 		 473 aa  341  2e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1562  GerA spore germination protein  36.89 
 
 		 499 aa  322  9.000000000000001e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.791927  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00100  GerA spore germination protein  32.81 
 
 		 531 aa  265  2e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3160  spore germination protein GerAA  32 
 
 		 524 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.275074 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1014  GerA spore germination protein  32.11 
 
 		 533 aa  260  4e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000120979 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2101  spore germination protein GerAA  31.65 
 
 		 524 aa  258  1e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3138  spore germination protein GerAA  31.6 
 
 		 524 aa  258  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3167  spore germination protein GerAA  31.8 
 
 		 524 aa  256  6e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.580414  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2853  spore germination protein  31.4 
 
 		 524 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0927787  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0803  GerA spore germination protein  29.9 
 
 		 511 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.905177  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0139  spore germination protein KA  30.1 
 
 		 523 aa  253  6e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3659  GerA spore germination protein  29.78 
 
 		 510 aa  250  5e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0297  GerA spore germination protein  32.42 
 
 		 512 aa  248  2e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2042  GerA spore germination protein  30.34 
 
 		 560 aa  244  3e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.480991 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2167  GerA spore germination protein  31.34 
 
 		 541 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.087983  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0603  GerA spore germination protein  31.39 
 
 		 534 aa  243  5e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1194  grkA; spore germination protein, GrkA  30.65 
 
 		 537 aa  243  7e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.616884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2904  GerA family spore germination protein  33.83 
 
 		 437 aa  243  7.999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0141963  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2928  spore germination protein GerAA  33.83 
 
 		 437 aa  242  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3150  spore germination protein GerAA  33.83 
 
 		 437 aa  242  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2278  GerA spore germination protein  29.77 
 
 		 537 aa  236  9e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0876  GerA spore germination protein  28.34 
 
 		 530 aa  234  2.0000000000000002e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3202  spore germination protein KA  29.59 
 
 		 530 aa  233  6e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2663  GerA spore germination protein  29.62 
 
 		 517 aa  232  9e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0054  GerA spore germination protein  30.41 
 
 		 544 aa  232  1e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2464  GerA spore germination protein  27.44 
 
 		 541 aa  228  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0438  GerA spore germination protein  29.56 
 
 		 599 aa  227  4e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.561382  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0619  spore germination protein  27.59 
 
 		 492 aa  223  8e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0675  spore germination protein GerLA  27.39 
 
 		 478 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0619  spore germination protein  27.39 
 
 		 492 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0709  spore germination protein GerLA  27.39 
 
 		 478 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0837  spore germination protein GerLA  27.8 
 
 		 489 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2765  GerA spore germination protein  29.96 
 
 		 490 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000513551  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0763  spore germination protein GerLA  27.39 
 
 		 489 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000217603 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0743  spore germination protein GerLA  26.93 
 
 		 492 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.702364  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0778  spore germination protein GerLA  27.8 
 
 		 492 aa  220  5e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0654  GerA spore germination protein  27.81 
 
 		 530 aa  219  7.999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4594  spore germination protein GerLA  26.93 
 
 		 492 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0624  GerA spore germination protein  27.56 
 
 		 492 aa  218  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1732  GerA spore germination protein  28.51 
 
 		 633 aa  218  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0585  GerA spore germination protein  31.35 
 
 		 552 aa  218  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.70288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0521  GerA spore germination protein  28.72 
 
 		 578 aa  218  2.9999999999999998e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2953  GerA spore germination protein  28.34 
 
 		 622 aa  217  4e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2456  GerA spore germination protein  31.27 
 
 		 520 aa  217  4e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1956  GerA spore germination protein  30.38 
 
 		 531 aa  216  5e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1971  GerA spore germination protein  27.45 
 
 		 592 aa  214  2.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0597  GerA spore germination protein  28.14 
 
 		 488 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3282  GerA spore germination protein  29.11 
 
 		 499 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000691632  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0604  GerA spore germination protein  29.88 
 
 		 534 aa  213  4.9999999999999996e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0078  germination protein  30.1 
 
 		 517 aa  212  1e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0057  GerA spore germination protein  29.29 
 
 		 523 aa  212  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1936  GerA spore germination protein  29.74 
 
 		 596 aa  208  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0667  GerA spore germination protein  29.08 
 
 		 589 aa  207  4e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2438  GerA spore germination protein  27.2 
 
 		 587 aa  203  6e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5573  GerA spore germination protein  27.24 
 
 		 515 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.32214 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1461  GerA spore germination protein  25.55 
 
 		 558 aa  199  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0846  GerA spore germination protein  27.56 
 
 		 540 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0548  GerA spore germination protein  29.85 
 
 		 500 aa  197  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0829  GerA spore germination protein  27.93 
 
 		 492 aa  197  5.000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0765  spore germination protein GerKA  28.06 
 
 		 500 aa  193  7e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0691  spore germination protein GerKA  28.32 
 
 		 500 aa  192  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0546  spore germination protein KA  28.32 
 
 		 500 aa  192  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0546  spore germination protein KA  28.06 
 
 		 500 aa  191  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2062  GerA spore germination protein  24.12 
 
 		 511 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4666  spore germination protein GerKA  28.05 
 
 		 500 aa  190  4e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.5266399999999997e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0602  spore germination protein GerKA  28.06 
 
 		 500 aa  191  4e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0635  spore germination protein GerKA  28.06 
 
 		 500 aa  191  4e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0671  spore germination protein GerKA  28.06 
 
 		 500 aa  190  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0236  spore germination protein, gerabka family  27.48 
 
 		 511 aa  189  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0199  spore germination protein, gerabka family  27.48 
 
 		 511 aa  189  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3369  spore germination protein  28.7 
 
 		 512 aa  188  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0478776  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3633  spore germination protein  28.7 
 
 		 512 aa  188  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1634  spore germination protein  29.14 
 
 		 512 aa  188  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3282  spore germination protein  28.48 
 
 		 512 aa  187  5e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3332  spore germination protein  28.48 
 
 		 512 aa  186  7e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3582  spore germination protein  28.48 
 
 		 512 aa  186  9e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>