149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1194 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1194  grkA; spore germination protein, GrkA  100 
 
 		 537 aa  1079    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.616884  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0846  GerA spore germination protein  47.34 
 
 		 540 aa  489  1e-137  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2765  GerA spore germination protein  47.17 
 
 		 490 aa  480  1e-134  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000513551  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3282  GerA spore germination protein  45.86 
 
 		 499 aa  455  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000691632  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0803  GerA spore germination protein  45.53 
 
 		 511 aa  457  1e-127  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.905177  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3202  spore germination protein KA  44.78 
 
 		 530 aa  456  1e-127  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2464  GerA spore germination protein  42.32 
 
 		 541 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0876  GerA spore germination protein  41.55 
 
 		 530 aa  435  1e-121  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0139  spore germination protein KA  40.95 
 
 		 523 aa  403  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0654  GerA spore germination protein  41.58 
 
 		 530 aa  404  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0054  GerA spore germination protein  39.72 
 
 		 544 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2042  GerA spore germination protein  41.43 
 
 		 560 aa  394  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.480991 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2167  GerA spore germination protein  45.62 
 
 		 541 aa  392  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.087983  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2278  GerA spore germination protein  39.07 
 
 		 537 aa  390  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3014  GerA spore germination protein  37.55 
 
 		 519 aa  389  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3160  spore germination protein GerAA  39.34 
 
 		 524 aa  391  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.275074 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1014  GerA spore germination protein  40.04 
 
 		 533 aa  387  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000120979 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3659  GerA spore germination protein  39.92 
 
 		 510 aa  387  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0297  GerA spore germination protein  41.41 
 
 		 512 aa  383  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0603  GerA spore germination protein  42.09 
 
 		 534 aa  385  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3167  spore germination protein GerAA  38.18 
 
 		 524 aa  383  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.580414  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3138  spore germination protein GerAA  38.57 
 
 		 524 aa  384  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0585  GerA spore germination protein  43.03 
 
 		 552 aa  385  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.70288  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2853  spore germination protein  38.18 
 
 		 524 aa  381  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0927787  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2101  spore germination protein GerAA  37.69 
 
 		 524 aa  379  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1461  GerA spore germination protein  40.65 
 
 		 558 aa  376  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00100  GerA spore germination protein  38.6 
 
 		 531 aa  378  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2438  GerA spore germination protein  39.65 
 
 		 587 aa  367  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0078  germination protein  40 
 
 		 517 aa  368  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0667  GerA spore germination protein  36.19 
 
 		 589 aa  361  2e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2663  GerA spore germination protein  38.3 
 
 		 517 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2456  GerA spore germination protein  37.65 
 
 		 520 aa  357  2.9999999999999997e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0604  GerA spore germination protein  40.55 
 
 		 534 aa  353  5e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2904  GerA family spore germination protein  42.34 
 
 		 437 aa  350  3e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0141963  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2928  spore germination protein GerAA  42.58 
 
 		 437 aa  350  5e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3150  spore germination protein GerAA  42.58 
 
 		 437 aa  350  5e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0057  GerA spore germination protein  41.67 
 
 		 523 aa  350  5e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1732  GerA spore germination protein  37.53 
 
 		 633 aa  348  2e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1971  GerA spore germination protein  35.63 
 
 		 592 aa  346  7e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0597  GerA spore germination protein  38.16 
 
 		 488 aa  345  8.999999999999999e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0763  spore germination protein GerLA  37.7 
 
 		 489 aa  345  8.999999999999999e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000217603 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0438  GerA spore germination protein  36.11 
 
 		 599 aa  345  8.999999999999999e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.561382  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2062  GerA spore germination protein  34.31 
 
 		 511 aa  343  5e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0619  spore germination protein  37.3 
 
 		 492 aa  343  5.999999999999999e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0778  spore germination protein GerLA  37.91 
 
 		 492 aa  342  1e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0837  spore germination protein GerLA  37.7 
 
 		 489 aa  342  1e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0675  spore germination protein GerLA  37.66 
 
 		 478 aa  341  2e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0709  spore germination protein GerLA  37.66 
 
 		 478 aa  341  2e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0619  spore germination protein  37.09 
 
 		 492 aa  340  5e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0743  spore germination protein GerLA  35.86 
 
 		 492 aa  339  8e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.702364  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4594  spore germination protein GerLA  37.3 
 
 		 492 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0624  GerA spore germination protein  37.5 
 
 		 492 aa  333  3e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1936  GerA spore germination protein  37.98 
 
 		 596 aa  329  8e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3070  GerA spore germination protein  37.86 
 
 		 496 aa  328  2.0000000000000001e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0521  GerA spore germination protein  34.95 
 
 		 578 aa  327  5e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0671  spore germination protein GerKA  37.37 
 
 		 500 aa  325  9e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2953  GerA spore germination protein  35.28 
 
 		 622 aa  324  2e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0765  spore germination protein GerKA  36.65 
 
 		 500 aa  324  2e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4666  spore germination protein GerKA  37.58 
 
 		 500 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.5266399999999997e-20 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0548  GerA spore germination protein  36.77 
 
 		 500 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0691  spore germination protein GerKA  36.96 
 
 		 500 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0546  spore germination protein KA  36.96 
 
 		 500 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0546  spore germination protein KA  36.76 
 
 		 500 aa  319  9e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0602  spore germination protein GerKA  36.76 
 
 		 500 aa  318  1e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0635  spore germination protein GerKA  36.76 
 
 		 500 aa  318  1e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0629  spore germination protein  33.26 
 
 		 473 aa  317  4e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.572288  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1558  GerA spore germination protein  36.38 
 
 		 495 aa  315  1.9999999999999998e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1956  GerA spore germination protein  37.15 
 
 		 531 aa  315  1.9999999999999998e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0615  GerABKA family spore germination protein  33.26 
 
 		 473 aa  315  1.9999999999999998e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5573  GerA spore germination protein  34.89 
 
 		 515 aa  311  2e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.32214 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0829  GerA spore germination protein  34.76 
 
 		 492 aa  308  2.0000000000000002e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2341  GerA spore germination protein  34.21 
 
 		 502 aa  293  5e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532317  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2753  spore germination protein XA  33.55 
 
 		 454 aa  288  1e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.32378  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1709  GerZA  33.8 
 
 		 497 aa  288  1e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000504866 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1634  spore germination protein  35.59 
 
 		 512 aa  288  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3599  spore germination protein  36.33 
 
 		 512 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3369  spore germination protein  37.5 
 
 		 512 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0478776  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3633  spore germination protein  37.5 
 
 		 512 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3682  spore germination protein  37.36 
 
 		 512 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3282  spore germination protein  37.28 
 
 		 512 aa  282  9e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3582  spore germination protein  37.28 
 
 		 512 aa  282  9e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3332  spore germination protein  37.06 
 
 		 512 aa  281  2e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0157  spore germination protein xa  31.98 
 
 		 492 aa  281  2e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0892  GerA spore germination protein  35.7 
 
 		 504 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1962  GerA spore germination protein  31.36 
 
 		 525 aa  267  4e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.346602  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1767  GerA spore germination protein  33.4 
 
 		 504 aa  258  2e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0225  spore germination protein XA  28.82 
 
 		 511 aa  256  7e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000185218 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2458  GerA spore germination protein  33.77 
 
 		 512 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0193  GerA spore germination protein  32.22 
 
 		 487 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07080  GerA spore germination protein  30.89 
 
 		 501 aa  246  9.999999999999999e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0629  GerA spore germination protein  30.65 
 
 		 500 aa  246  9.999999999999999e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2888  GerA family spore germination protein  34.59 
 
 		 499 aa  241  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0644485  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2116  spore germination protein, GerA family  34.46 
 
 		 499 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0199  spore germination protein, gerabka family  33.06 
 
 		 511 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2069  GerA spore germination protein  31.1 
 
 		 505 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0159495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0236  spore germination protein, gerabka family  33.06 
 
 		 511 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0643  GerA spore germination protein  33.48 
 
 		 503 aa  240  5e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3436  GerA spore germination protein  29.88 
 
 		 497 aa  240  5.999999999999999e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3142  spore germination protein, GerA family  34.87 
 
 		 481 aa  238  3e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.401489 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3121  spore germination protein QA  34.93 
 
 		 499 aa  237  4e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>