149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0615 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0629  spore germination protein  98.31 
 
 		 473 aa  942    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.572288  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0615  GerABKA family spore germination protein  100 
 
 		 473 aa  955    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2765  GerA spore germination protein  37.7 
 
 		 490 aa  319  7e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000513551  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0846  GerA spore germination protein  36.85 
 
 		 540 aa  318  1e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3282  GerA spore germination protein  35.43 
 
 		 499 aa  302  7.000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000691632  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1194  grkA; spore germination protein, GrkA  33.26 
 
 		 537 aa  303  7.000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.616884  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3014  GerA spore germination protein  34.41 
 
 		 519 aa  298  2e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0654  GerA spore germination protein  38.18 
 
 		 530 aa  286  5.999999999999999e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2464  GerA spore germination protein  35.23 
 
 		 541 aa  281  2e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0876  GerA spore germination protein  32.97 
 
 		 530 aa  280  3e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3167  spore germination protein GerAA  35.32 
 
 		 524 aa  279  8e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.580414  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2042  GerA spore germination protein  35.36 
 
 		 560 aa  277  4e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.480991 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3160  spore germination protein GerAA  34.98 
 
 		 524 aa  276  5e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.275074 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3202  spore germination protein KA  35.51 
 
 		 530 aa  276  5e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2101  spore germination protein GerAA  34.33 
 
 		 524 aa  276  9e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0078  germination protein  35.33 
 
 		 517 aa  275  1.0000000000000001e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3138  spore germination protein GerAA  34.68 
 
 		 524 aa  274  3e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2853  spore germination protein  34.68 
 
 		 524 aa  273  6e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0927787  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00100  GerA spore germination protein  36.03 
 
 		 531 aa  272  8.000000000000001e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1014  GerA spore germination protein  34.98 
 
 		 533 aa  272  1e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000120979 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3659  GerA spore germination protein  33.19 
 
 		 510 aa  272  1e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0054  GerA spore germination protein  35.81 
 
 		 544 aa  268  1e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0803  GerA spore germination protein  32.76 
 
 		 511 aa  268  1e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.905177  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0603  GerA spore germination protein  35.44 
 
 		 534 aa  265  2e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2438  GerA spore germination protein  34.86 
 
 		 587 aa  264  3e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2928  spore germination protein GerAA  36.41 
 
 		 437 aa  263  4e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3150  spore germination protein GerAA  36.41 
 
 		 437 aa  263  4e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2904  GerA family spore germination protein  36.41 
 
 		 437 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0141963  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2663  GerA spore germination protein  35.62 
 
 		 517 aa  263  6e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0139  spore germination protein KA  32.24 
 
 		 523 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0667  GerA spore germination protein  33.69 
 
 		 589 aa  259  5.0000000000000005e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0297  GerA spore germination protein  33.48 
 
 		 512 aa  259  8e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0604  GerA spore germination protein  36.21 
 
 		 534 aa  255  1.0000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0585  GerA spore germination protein  35.81 
 
 		 552 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.70288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0521  GerA spore germination protein  33.33 
 
 		 578 aa  254  3e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2278  GerA spore germination protein  31.33 
 
 		 537 aa  253  6e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2456  GerA spore germination protein  31.06 
 
 		 520 aa  250  3e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2167  GerA spore germination protein  33.62 
 
 		 541 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.087983  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0619  spore germination protein  31.47 
 
 		 492 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1461  GerA spore germination protein  31.88 
 
 		 558 aa  244  1.9999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0765  spore germination protein GerKA  32.46 
 
 		 500 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0763  spore germination protein GerLA  31.06 
 
 		 489 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000217603 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0675  spore germination protein GerLA  31.06 
 
 		 478 aa  243  5e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0619  spore germination protein  30.85 
 
 		 492 aa  243  5e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0709  spore germination protein GerLA  31.06 
 
 		 478 aa  243  5e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1732  GerA spore germination protein  33.03 
 
 		 633 aa  243  5e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0837  spore germination protein GerLA  31.24 
 
 		 489 aa  243  7e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1971  GerA spore germination protein  31.5 
 
 		 592 aa  239  5.999999999999999e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0778  spore germination protein GerLA  31.47 
 
 		 492 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0602  spore germination protein GerKA  32.02 
 
 		 500 aa  239  1e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0546  spore germination protein KA  31.8 
 
 		 500 aa  238  1e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0635  spore germination protein GerKA  32.02 
 
 		 500 aa  239  1e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0546  spore germination protein KA  31.8 
 
 		 500 aa  237  3e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0691  spore germination protein GerKA  31.8 
 
 		 500 aa  237  3e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0597  GerA spore germination protein  32.44 
 
 		 488 aa  237  4e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4666  spore germination protein GerKA  31.36 
 
 		 500 aa  236  9e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.5266399999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4594  spore germination protein GerLA  31.68 
 
 		 492 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2062  GerA spore germination protein  30.82 
 
 		 511 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0548  GerA spore germination protein  32.02 
 
 		 500 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0671  spore germination protein GerKA  31.36 
 
 		 500 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0624  GerA spore germination protein  31.06 
 
 		 492 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0743  spore germination protein GerLA  31.47 
 
 		 492 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.702364  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3070  GerA spore germination protein  34.15 
 
 		 496 aa  232  9e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0057  GerA spore germination protein  32.39 
 
 		 523 aa  231  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0829  GerA spore germination protein  33.26 
 
 		 492 aa  229  1e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1558  GerA spore germination protein  34.15 
 
 		 495 aa  225  1e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3332  spore germination protein  31.63 
 
 		 512 aa  224  3e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0438  GerA spore germination protein  31.51 
 
 		 599 aa  223  4.9999999999999996e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.561382  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3369  spore germination protein  31.4 
 
 		 512 aa  223  7e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0478776  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2953  GerA spore germination protein  33.33 
 
 		 622 aa  223  7e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3633  spore germination protein  31.4 
 
 		 512 aa  223  7e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2458  GerA spore germination protein  35.16 
 
 		 512 aa  223  7e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3582  spore germination protein  31.4 
 
 		 512 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3599  spore germination protein  32.08 
 
 		 512 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3282  spore germination protein  30.73 
 
 		 512 aa  220  5e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1936  GerA spore germination protein  34.29 
 
 		 596 aa  218  1e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3682  spore germination protein  31.62 
 
 		 512 aa  219  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1709  GerZA  28.75 
 
 		 497 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000504866 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2341  GerA spore germination protein  28.54 
 
 		 502 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532317  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1634  spore germination protein  31.69 
 
 		 512 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0225  spore germination protein XA  34.29 
 
 		 511 aa  210  5e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000185218 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2753  spore germination protein XA  32.32 
 
 		 454 aa  209  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.32378  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0157  spore germination protein xa  31.62 
 
 		 492 aa  209  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1956  GerA spore germination protein  30.5 
 
 		 531 aa  207  3e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4483  spore germination protein  31.26 
 
 		 735 aa  207  4e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5573  GerA spore germination protein  31.26 
 
 		 515 aa  207  4e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.32214 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4630  spore germination protein GerHA  31.17 
 
 		 747 aa  206  7e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4984  spore germination protein GerHA  31.17 
 
 		 747 aa  206  7e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4563  GerA spore germination protein  31.29 
 
 		 652 aa  206  7e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4852  spore germination protein GerHA  33.06 
 
 		 455 aa  206  7e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0392  spore germination protein IA  32.15 
 
 		 754 aa  204  3e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4869  spore germination protein GerHA  31.96 
 
 		 455 aa  203  5e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4874  spore germination protein GerHA  32.7 
 
 		 734 aa  203  6e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0892  GerA spore germination protein  29.26 
 
 		 504 aa  203  7e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4844  spore germination protein gerIA  32.97 
 
 		 754 aa  202  8e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0520951  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4464  spore germination protein  32.7 
 
 		 773 aa  202  9e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1962  GerA spore germination protein  33.33 
 
 		 525 aa  197  5.000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.346602  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3408  GerA spore germination protein  30.11 
 
 		 566 aa  194  4e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1767  GerA spore germination protein  27.64 
 
 		 504 aa  187  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0643  GerA spore germination protein  28.29 
 
 		 503 aa  187  4e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>