149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2458 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2458  GerA spore germination protein  100 
 
 
512 aa  1042    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0157  spore germination protein xa  46.3 
 
 
492 aa  436  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2753  spore germination protein XA  48.1 
 
 
454 aa  411  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.32378  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0225  spore germination protein XA  41.91 
 
 
511 aa  404  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000185218 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2278  GerA spore germination protein  35.06 
 
 
537 aa  297  4e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3202  spore germination protein KA  34.39 
 
 
530 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0213  spore germination protein XA  44.08 
 
 
337 aa  280  3e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.76303 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2438  GerA spore germination protein  34.26 
 
 
587 aa  274  3e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0054  GerA spore germination protein  37.64 
 
 
544 aa  267  4e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0803  GerA spore germination protein  32.51 
 
 
511 aa  266  8.999999999999999e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.905177  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0675  spore germination protein GerLA  37.65 
 
 
478 aa  261  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0709  spore germination protein GerLA  37.65 
 
 
478 aa  261  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1014  GerA spore germination protein  33.13 
 
 
533 aa  261  2e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000120979 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0763  spore germination protein GerLA  37.65 
 
 
489 aa  260  4e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000217603 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3070  GerA spore germination protein  33.74 
 
 
496 aa  260  5.0000000000000005e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0619  spore germination protein  36.14 
 
 
492 aa  258  1e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2464  GerA spore germination protein  34.34 
 
 
541 aa  258  1e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2042  GerA spore germination protein  35.73 
 
 
560 aa  258  3e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.480991 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0654  GerA spore germination protein  35.41 
 
 
530 aa  256  5e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0619  spore germination protein  36.92 
 
 
492 aa  256  6e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0297  GerA spore germination protein  38.76 
 
 
512 aa  256  7e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0837  spore germination protein GerLA  36.32 
 
 
489 aa  256  9e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2062  GerA spore germination protein  35 
 
 
511 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0876  GerA spore germination protein  33.18 
 
 
530 aa  254  3e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2456  GerA spore germination protein  37.69 
 
 
520 aa  254  4.0000000000000004e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0765  spore germination protein GerKA  34.14 
 
 
500 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0778  spore germination protein GerLA  37.41 
 
 
492 aa  253  7e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0671  spore germination protein GerKA  33.33 
 
 
500 aa  253  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0546  spore germination protein KA  33.19 
 
 
500 aa  252  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0139  spore germination protein KA  32.12 
 
 
523 aa  252  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0546  spore germination protein KA  33.19 
 
 
500 aa  251  2e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3659  GerA spore germination protein  32.49 
 
 
510 aa  251  2e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0691  spore germination protein GerKA  33.19 
 
 
500 aa  251  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0548  GerA spore germination protein  33.04 
 
 
500 aa  251  3e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0585  GerA spore germination protein  36.8 
 
 
552 aa  251  3e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.70288  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0597  GerA spore germination protein  37.81 
 
 
488 aa  250  5e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0602  spore germination protein GerKA  32.96 
 
 
500 aa  249  7e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0635  spore germination protein GerKA  32.96 
 
 
500 aa  249  7e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2765  GerA spore germination protein  34.65 
 
 
490 aa  249  9e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000513551  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4666  spore germination protein GerKA  32.88 
 
 
500 aa  249  1e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.5266399999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4594  spore germination protein GerLA  35.4 
 
 
492 aa  249  1e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2853  spore germination protein  35.63 
 
 
524 aa  249  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0927787  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3167  spore germination protein GerAA  35.92 
 
 
524 aa  249  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.580414  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3138  spore germination protein GerAA  35.92 
 
 
524 aa  249  1e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0521  GerA spore germination protein  34.35 
 
 
578 aa  248  1e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0743  spore germination protein GerLA  35.4 
 
 
492 aa  248  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.702364  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2101  spore germination protein GerAA  33.95 
 
 
524 aa  248  2e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2663  GerA spore germination protein  33.1 
 
 
517 aa  247  3e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1558  GerA spore germination protein  32.27 
 
 
495 aa  247  4e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2928  spore germination protein GerAA  35.06 
 
 
437 aa  246  6e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2904  GerA family spore germination protein  35.06 
 
 
437 aa  246  6e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0141963  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3150  spore germination protein GerAA  35.06 
 
 
437 aa  246  6e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3160  spore germination protein GerAA  35.06 
 
 
524 aa  246  9e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.275074 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0624  GerA spore germination protein  35.7 
 
 
492 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1194  grkA; spore germination protein, GrkA  33.77 
 
 
537 aa  244  3.9999999999999997e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.616884  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0078  germination protein  32.91 
 
 
517 aa  236  7e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0667  GerA spore germination protein  32.08 
 
 
589 aa  236  7e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1461  GerA spore germination protein  40.24 
 
 
558 aa  234  2.0000000000000002e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3282  GerA spore germination protein  32.86 
 
 
499 aa  234  4.0000000000000004e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000691632  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5573  GerA spore germination protein  30.27 
 
 
515 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.32214 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00100  GerA spore germination protein  32.08 
 
 
531 aa  233  7.000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3014  GerA spore germination protein  29.57 
 
 
519 aa  232  9e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0892  GerA spore germination protein  31.17 
 
 
504 aa  228  2e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1709  GerZA  31.28 
 
 
497 aa  228  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000504866 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0057  GerA spore germination protein  34.56 
 
 
523 aa  228  3e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2341  GerA spore germination protein  32.45 
 
 
502 aa  227  5.0000000000000005e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532317  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3682  spore germination protein  31.4 
 
 
512 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2167  GerA spore germination protein  31.82 
 
 
541 aa  226  1e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.087983  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0829  GerA spore germination protein  31.99 
 
 
492 aa  226  1e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0603  GerA spore germination protein  30.64 
 
 
534 aa  225  1e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1634  spore germination protein  31.26 
 
 
512 aa  225  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0629  spore germination protein  34.18 
 
 
473 aa  225  2e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.572288  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3282  spore germination protein  32.64 
 
 
512 aa  223  6e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1936  GerA spore germination protein  39.38 
 
 
596 aa  223  6e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3332  spore germination protein  31.03 
 
 
512 aa  223  7e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0615  GerABKA family spore germination protein  35.16 
 
 
473 aa  223  7e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3582  spore germination protein  31.03 
 
 
512 aa  223  7e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3599  spore germination protein  30.98 
 
 
512 aa  223  9e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1971  GerA spore germination protein  29.57 
 
 
592 aa  222  9.999999999999999e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0604  GerA spore germination protein  37.72 
 
 
534 aa  221  1.9999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3369  spore germination protein  31.19 
 
 
512 aa  221  3e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0478776  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2953  GerA spore germination protein  28.33 
 
 
622 aa  221  3e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3633  spore germination protein  31.19 
 
 
512 aa  221  3e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1767  GerA spore germination protein  30.68 
 
 
504 aa  220  5e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0643  GerA spore germination protein  31.37 
 
 
503 aa  219  1e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1962  GerA spore germination protein  33.33 
 
 
525 aa  219  1e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.346602  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4563  GerA spore germination protein  31.82 
 
 
652 aa  218  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1732  GerA spore germination protein  34.36 
 
 
633 aa  218  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0846  GerA spore germination protein  31.37 
 
 
540 aa  216  8e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4852  spore germination protein GerHA  30.75 
 
 
455 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0438  GerA spore germination protein  33.8 
 
 
599 aa  215  1.9999999999999998e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.561382  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0392  spore germination protein IA  30.72 
 
 
754 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4869  spore germination protein GerHA  30.75 
 
 
455 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4483  spore germination protein  31.15 
 
 
735 aa  212  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4630  spore germination protein GerHA  34.36 
 
 
747 aa  210  5e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4984  spore germination protein GerHA  34.36 
 
 
747 aa  210  5e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1956  GerA spore germination protein  37.04 
 
 
531 aa  209  1e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4844  spore germination protein gerIA  32.82 
 
 
754 aa  207  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0520951  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4874  spore germination protein GerHA  34.08 
 
 
734 aa  207  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4464  spore germination protein  34.08 
 
 
773 aa  207  5e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>