149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0654 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0654  GerA spore germination protein  100 
 
 
530 aa  1064    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2765  GerA spore germination protein  44.87 
 
 
490 aa  429  1e-119  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000513551  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3282  GerA spore germination protein  44.59 
 
 
499 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000691632  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0876  GerA spore germination protein  42.16 
 
 
530 aa  410  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1194  grkA; spore germination protein, GrkA  39.24 
 
 
537 aa  392  1e-108  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.616884  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0803  GerA spore germination protein  40.59 
 
 
511 aa  394  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.905177  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3202  spore germination protein KA  39.51 
 
 
530 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0846  GerA spore germination protein  40.77 
 
 
540 aa  392  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2464  GerA spore germination protein  37.57 
 
 
541 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3014  GerA spore germination protein  38.51 
 
 
519 aa  380  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0139  spore germination protein KA  38.01 
 
 
523 aa  380  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3659  GerA spore germination protein  40.39 
 
 
510 aa  378  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2042  GerA spore germination protein  38.51 
 
 
560 aa  374  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.480991 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2278  GerA spore germination protein  39.22 
 
 
537 aa  366  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2663  GerA spore germination protein  35.28 
 
 
517 aa  356  6.999999999999999e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2438  GerA spore germination protein  37.63 
 
 
587 aa  355  7.999999999999999e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0585  GerA spore germination protein  38.49 
 
 
552 aa  355  2e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.70288  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00100  GerA spore germination protein  38.25 
 
 
531 aa  354  2.9999999999999997e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2167  GerA spore germination protein  41.83 
 
 
541 aa  352  1e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.087983  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0054  GerA spore germination protein  37.25 
 
 
544 aa  350  4e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0078  germination protein  39.51 
 
 
517 aa  347  4e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2101  spore germination protein GerAA  35.73 
 
 
524 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1461  GerA spore germination protein  38.66 
 
 
558 aa  342  1e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3167  spore germination protein GerAA  35.73 
 
 
524 aa  342  1e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.580414  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2853  spore germination protein  35.54 
 
 
524 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0927787  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3160  spore germination protein GerAA  34.99 
 
 
524 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.275074 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3138  spore germination protein GerAA  35.54 
 
 
524 aa  340  4e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2062  GerA spore germination protein  34.76 
 
 
511 aa  338  1.9999999999999998e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0603  GerA spore germination protein  37.74 
 
 
534 aa  335  1e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0546  spore germination protein KA  34.75 
 
 
500 aa  335  2e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0548  GerA spore germination protein  35.55 
 
 
500 aa  335  2e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0765  spore germination protein GerKA  36.29 
 
 
500 aa  334  2e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0602  spore germination protein GerKA  34.75 
 
 
500 aa  334  3e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0635  spore germination protein GerKA  34.75 
 
 
500 aa  334  3e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0057  GerA spore germination protein  36.94 
 
 
523 aa  333  3e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4666  spore germination protein GerKA  36.64 
 
 
500 aa  333  4e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.5266399999999997e-20 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0546  spore germination protein KA  34.49 
 
 
500 aa  332  9e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0691  spore germination protein GerKA  34.49 
 
 
500 aa  332  9e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0671  spore germination protein GerKA  35.54 
 
 
500 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2456  GerA spore germination protein  35.78 
 
 
520 aa  327  2.0000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0297  GerA spore germination protein  37.5 
 
 
512 aa  327  3e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1014  GerA spore germination protein  32.89 
 
 
533 aa  327  4.0000000000000003e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000120979 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2928  spore germination protein GerAA  39.08 
 
 
437 aa  318  1e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2904  GerA family spore germination protein  38.83 
 
 
437 aa  318  1e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0141963  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3150  spore germination protein GerAA  39.08 
 
 
437 aa  318  1e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3070  GerA spore germination protein  33.66 
 
 
496 aa  318  2e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0597  GerA spore germination protein  34.67 
 
 
488 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1558  GerA spore germination protein  36.8 
 
 
495 aa  308  2.0000000000000002e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0675  spore germination protein GerLA  33.61 
 
 
478 aa  306  8.000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0709  spore germination protein GerLA  33.61 
 
 
478 aa  306  8.000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0763  spore germination protein GerLA  33.54 
 
 
489 aa  306  9.000000000000001e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000217603 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0837  spore germination protein GerLA  33.82 
 
 
489 aa  306  9.000000000000001e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0778  spore germination protein GerLA  33.54 
 
 
492 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0619  spore germination protein  33.54 
 
 
492 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0619  spore germination protein  33.4 
 
 
492 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0624  GerA spore germination protein  33.2 
 
 
492 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0667  GerA spore germination protein  31.61 
 
 
589 aa  304  3.0000000000000004e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0743  spore germination protein GerLA  34.03 
 
 
492 aa  301  1e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.702364  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1971  GerA spore germination protein  33.2 
 
 
592 aa  301  2e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1732  GerA spore germination protein  34.6 
 
 
633 aa  301  2e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4594  spore germination protein GerLA  33.82 
 
 
492 aa  301  3e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0604  GerA spore germination protein  36.79 
 
 
534 aa  300  4e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0438  GerA spore germination protein  33.15 
 
 
599 aa  296  7e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.561382  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3682  spore germination protein  38.55 
 
 
512 aa  293  7e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2953  GerA spore germination protein  33.47 
 
 
622 aa  291  2e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3599  spore germination protein  39 
 
 
512 aa  291  3e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3369  spore germination protein  38.69 
 
 
512 aa  290  4e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0478776  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3282  spore germination protein  38.69 
 
 
512 aa  290  4e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3633  spore germination protein  38.69 
 
 
512 aa  290  4e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1634  spore germination protein  38.01 
 
 
512 aa  290  6e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1709  GerZA  34.44 
 
 
497 aa  289  7e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000504866 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3582  spore germination protein  38.46 
 
 
512 aa  288  1e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3332  spore germination protein  38.46 
 
 
512 aa  288  2e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2341  GerA spore germination protein  34.5 
 
 
502 aa  286  4e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532317  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0629  spore germination protein  41.76 
 
 
473 aa  286  5.999999999999999e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.572288  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0615  GerABKA family spore germination protein  41.69 
 
 
473 aa  286  5.999999999999999e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0521  GerA spore germination protein  32.99 
 
 
578 aa  283  8.000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5573  GerA spore germination protein  33.27 
 
 
515 aa  281  3e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.32214 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1956  GerA spore germination protein  34 
 
 
531 aa  277  3e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0225  spore germination protein XA  33.92 
 
 
511 aa  276  7e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000185218 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0829  GerA spore germination protein  33.75 
 
 
492 aa  273  6e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2753  spore germination protein XA  35.97 
 
 
454 aa  270  7e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.32378  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1936  GerA spore germination protein  30.35 
 
 
596 aa  264  3e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1962  GerA spore germination protein  32.32 
 
 
525 aa  263  6e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.346602  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0157  spore germination protein xa  34.16 
 
 
492 aa  259  8e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2458  GerA spore germination protein  35.41 
 
 
512 aa  258  2e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3121  spore germination protein QA  35.85 
 
 
499 aa  257  3e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2888  GerA family spore germination protein  35.01 
 
 
499 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0644485  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2116  spore germination protein, GerA family  34.75 
 
 
499 aa  253  7e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3142  spore germination protein, GerA family  34.74 
 
 
481 aa  252  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.401489 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0199  spore germination protein, gerabka family  31.4 
 
 
511 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0236  spore germination protein, gerabka family  31.4 
 
 
511 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0892  GerA spore germination protein  31.52 
 
 
504 aa  226  7e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1373  GerA spore germination protein  30.81 
 
 
528 aa  226  9e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4483  spore germination protein  30.61 
 
 
735 aa  225  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4852  spore germination protein GerHA  33.73 
 
 
455 aa  225  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4630  spore germination protein GerHA  34.86 
 
 
747 aa  223  8e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1767  GerA spore germination protein  30.87 
 
 
504 aa  223  8e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4984  spore germination protein GerHA  34.86 
 
 
747 aa  223  8e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0193  GerA spore germination protein  30 
 
 
487 aa  223  9e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>