149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0078 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0078  germination protein  100 
 
 		 517 aa  1043    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0803  GerA spore germination protein  44.74 
 
 		 511 aa  448  1e-125  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.905177  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3659  GerA spore germination protein  44.47 
 
 		 510 aa  436  1e-121  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0139  spore germination protein KA  45.21 
 
 		 523 aa  429  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2042  GerA spore germination protein  45.18 
 
 		 560 aa  427  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.480991 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3202  spore germination protein KA  45 
 
 		 530 aa  420  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2464  GerA spore germination protein  41.04 
 
 		 541 aa  411  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0585  GerA spore germination protein  44.67 
 
 		 552 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.70288  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2765  GerA spore germination protein  42.17 
 
 		 490 aa  396  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000513551  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2278  GerA spore germination protein  40.16 
 
 		 537 aa  393  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2167  GerA spore germination protein  44.69 
 
 		 541 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.087983  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2456  GerA spore germination protein  38.37 
 
 		 520 aa  385  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2438  GerA spore germination protein  41.52 
 
 		 587 aa  381  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00100  GerA spore germination protein  39.52 
 
 		 531 aa  377  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0297  GerA spore germination protein  40.4 
 
 		 512 aa  377  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0054  GerA spore germination protein  36.55 
 
 		 544 aa  372  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1014  GerA spore germination protein  38.53 
 
 		 533 aa  369  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000120979 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1194  grkA; spore germination protein, GrkA  40 
 
 		 537 aa  372  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.616884  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1732  GerA spore germination protein  37.35 
 
 		 633 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0603  GerA spore germination protein  40.99 
 
 		 534 aa  367  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3282  GerA spore germination protein  39.04 
 
 		 499 aa  365  1e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000691632  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0667  GerA spore germination protein  36.09 
 
 		 589 aa  364  2e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0876  GerA spore germination protein  38.64 
 
 		 530 aa  362  1e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0654  GerA spore germination protein  39.51 
 
 		 530 aa  358  9.999999999999999e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2101  spore germination protein GerAA  38.02 
 
 		 524 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0057  GerA spore germination protein  43.46 
 
 		 523 aa  356  5e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3138  spore germination protein GerAA  37.4 
 
 		 524 aa  356  6.999999999999999e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2853  spore germination protein  37.4 
 
 		 524 aa  355  1e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0927787  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3160  spore germination protein GerAA  37.91 
 
 		 524 aa  355  1e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.275074 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3167  spore germination protein GerAA  37.19 
 
 		 524 aa  354  2e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.580414  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0846  GerA spore germination protein  37.55 
 
 		 540 aa  353  5.9999999999999994e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3014  GerA spore germination protein  35.83 
 
 		 519 aa  349  7e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0438  GerA spore germination protein  38.21 
 
 		 599 aa  345  8e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.561382  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3070  GerA spore germination protein  45.19 
 
 		 496 aa  345  8e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1461  GerA spore germination protein  39.29 
 
 		 558 aa  345  8e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0675  spore germination protein GerLA  37.5 
 
 		 478 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0709  spore germination protein GerLA  37.5 
 
 		 478 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1558  GerA spore germination protein  39.49 
 
 		 495 aa  340  2.9999999999999998e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2953  GerA spore germination protein  37.55 
 
 		 622 aa  339  5.9999999999999996e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0763  spore germination protein GerLA  37.29 
 
 		 489 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000217603 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0837  spore germination protein GerLA  37.5 
 
 		 489 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2928  spore germination protein GerAA  39.61 
 
 		 437 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2904  GerA family spore germination protein  39.61 
 
 		 437 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0141963  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3150  spore germination protein GerAA  39.61 
 
 		 437 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0604  GerA spore germination protein  39.51 
 
 		 534 aa  337  3.9999999999999995e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1971  GerA spore germination protein  35.28 
 
 		 592 aa  336  5e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0619  spore germination protein  36.75 
 
 		 492 aa  335  7.999999999999999e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0619  spore germination protein  36.82 
 
 		 492 aa  335  1e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2663  GerA spore germination protein  36.79 
 
 		 517 aa  333  6e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0521  GerA spore germination protein  34.19 
 
 		 578 aa  332  1e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0743  spore germination protein GerLA  37.4 
 
 		 492 aa  329  7e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.702364  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4594  spore germination protein GerLA  37.6 
 
 		 492 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0778  spore germination protein GerLA  36.77 
 
 		 492 aa  326  5e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1936  GerA spore germination protein  36.82 
 
 		 596 aa  325  1e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0597  GerA spore germination protein  36.99 
 
 		 488 aa  323  4e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0624  GerA spore germination protein  37.01 
 
 		 492 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2062  GerA spore germination protein  35.44 
 
 		 511 aa  317  3e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4666  spore germination protein GerKA  36.05 
 
 		 500 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.5266399999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0765  spore germination protein GerKA  35.85 
 
 		 500 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0671  spore germination protein GerKA  36.05 
 
 		 500 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0546  spore germination protein KA  36.05 
 
 		 500 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0691  spore germination protein GerKA  36.05 
 
 		 500 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0829  GerA spore germination protein  35.82 
 
 		 492 aa  313  5.999999999999999e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0602  spore germination protein GerKA  35.85 
 
 		 500 aa  312  7.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0635  spore germination protein GerKA  35.85 
 
 		 500 aa  312  7.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0546  spore germination protein KA  35.64 
 
 		 500 aa  312  1e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0548  GerA spore germination protein  35.71 
 
 		 500 aa  312  1e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2341  GerA spore germination protein  35.73 
 
 		 502 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532317  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1709  GerZA  34.7 
 
 		 497 aa  301  1e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000504866 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5573  GerA spore germination protein  34.5 
 
 		 515 aa  300  4e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.32214 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0629  spore germination protein  34.7 
 
 		 473 aa  289  8e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.572288  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3599  spore germination protein  34.56 
 
 		 512 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1956  GerA spore germination protein  35.74 
 
 		 531 aa  286  5e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0615  GerABKA family spore germination protein  35.33 
 
 		 473 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3282  spore germination protein  35.37 
 
 		 512 aa  282  1e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1634  spore germination protein  34.82 
 
 		 512 aa  281  2e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3682  spore germination protein  35.23 
 
 		 512 aa  280  4e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3369  spore germination protein  35.37 
 
 		 512 aa  280  5e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0478776  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3633  spore germination protein  35.37 
 
 		 512 aa  280  5e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3332  spore germination protein  35.16 
 
 		 512 aa  280  6e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3582  spore germination protein  35.16 
 
 		 512 aa  278  1e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4483  spore germination protein  36.27 
 
 		 735 aa  277  3e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4630  spore germination protein GerHA  36.27 
 
 		 747 aa  276  5e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4984  spore germination protein GerHA  36.27 
 
 		 747 aa  276  5e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4874  spore germination protein GerHA  36.27 
 
 		 734 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0892  GerA spore germination protein  33.97 
 
 		 504 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1767  GerA spore germination protein  33.73 
 
 		 504 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0392  spore germination protein IA  42.26 
 
 		 754 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4464  spore germination protein  36.27 
 
 		 773 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0157  spore germination protein xa  33.05 
 
 		 492 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4563  GerA spore germination protein  36.34 
 
 		 652 aa  272  1e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3121  spore germination protein QA  37.95 
 
 		 499 aa  271  1e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4844  spore germination protein gerIA  41.96 
 
 		 754 aa  272  1e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0520951  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2888  GerA family spore germination protein  36.33 
 
 		 499 aa  271  2e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0644485  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4852  spore germination protein GerHA  35.78 
 
 		 455 aa  271  2e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4869  spore germination protein GerHA  36.01 
 
 		 455 aa  271  2e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2116  spore germination protein, GerA family  37.28 
 
 		 499 aa  269  7e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3142  spore germination protein, GerA family  39.26 
 
 		 481 aa  269  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.401489 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0643  GerA spore germination protein  35.48 
 
 		 503 aa  266  8e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2753  spore germination protein XA  33.58 
 
 		 454 aa  264  3e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.32378  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>