149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2062 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2062  GerA spore germination protein  100 
 
 		 511 aa  1035    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3138  spore germination protein GerAA  38.83 
 
 		 524 aa  403  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2101  spore germination protein GerAA  38.83 
 
 		 524 aa  403  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2853  spore germination protein  38.43 
 
 		 524 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0927787  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3160  spore germination protein GerAA  38.63 
 
 		 524 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.275074 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3167  spore germination protein GerAA  38.23 
 
 		 524 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.580414  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2464  GerA spore germination protein  37.74 
 
 		 541 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0803  GerA spore germination protein  40.3 
 
 		 511 aa  380  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.905177  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1014  GerA spore germination protein  38.07 
 
 		 533 aa  377  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000120979 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0603  GerA spore germination protein  40.28 
 
 		 534 aa  376  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2928  spore germination protein GerAA  39.87 
 
 		 437 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2904  GerA family spore germination protein  39.87 
 
 		 437 aa  370  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0141963  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3150  spore germination protein GerAA  39.87 
 
 		 437 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00100  GerA spore germination protein  36.31 
 
 		 531 aa  360  2e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0054  GerA spore germination protein  38.51 
 
 		 544 aa  360  4e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2278  GerA spore germination protein  35.1 
 
 		 537 aa  358  9e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2042  GerA spore germination protein  37.81 
 
 		 560 aa  358  9.999999999999999e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.480991 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0297  GerA spore germination protein  37.73 
 
 		 512 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0597  GerA spore germination protein  36.94 
 
 		 488 aa  354  2e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0585  GerA spore germination protein  39.16 
 
 		 552 aa  353  5e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.70288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0139  spore germination protein KA  36.58 
 
 		 523 aa  352  1e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2765  GerA spore germination protein  37.58 
 
 		 490 aa  352  1e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000513551  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2456  GerA spore germination protein  36.47 
 
 		 520 aa  349  6e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0619  spore germination protein  35.85 
 
 		 492 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0765  spore germination protein GerKA  39.83 
 
 		 500 aa  343  4e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0763  spore germination protein GerLA  35.64 
 
 		 489 aa  342  1e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000217603 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4666  spore germination protein GerKA  39.29 
 
 		 500 aa  342  1e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.5266399999999997e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0675  spore germination protein GerLA  35.64 
 
 		 478 aa  342  1e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0709  spore germination protein GerLA  35.64 
 
 		 478 aa  342  1e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3659  GerA spore germination protein  35.86 
 
 		 510 aa  341  2e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0837  spore germination protein GerLA  35.64 
 
 		 489 aa  341  2e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0671  spore germination protein GerKA  38.87 
 
 		 500 aa  341  2e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0546  spore germination protein KA  38.82 
 
 		 500 aa  340  4e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0691  spore germination protein GerKA  38.82 
 
 		 500 aa  340  4e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0619  spore germination protein  35.22 
 
 		 492 aa  340  5e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2438  GerA spore germination protein  40.94 
 
 		 587 aa  340  5e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0546  spore germination protein KA  38.62 
 
 		 500 aa  340  5e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3282  GerA spore germination protein  36.6 
 
 		 499 aa  339  5.9999999999999996e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000691632  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0602  spore germination protein GerKA  38.62 
 
 		 500 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0635  spore germination protein GerKA  38.62 
 
 		 500 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0654  GerA spore germination protein  34.85 
 
 		 530 aa  337  2.9999999999999997e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0548  GerA spore germination protein  38.48 
 
 		 500 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1461  GerA spore germination protein  37.4 
 
 		 558 aa  336  7e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0624  GerA spore germination protein  35.64 
 
 		 492 aa  336  7e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0743  spore germination protein GerLA  35.52 
 
 		 492 aa  335  9e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.702364  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0778  spore germination protein GerLA  35.43 
 
 		 492 aa  335  1e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1971  GerA spore germination protein  37.04 
 
 		 592 aa  334  2e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4594  spore germination protein GerLA  35.32 
 
 		 492 aa  335  2e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3202  spore germination protein KA  38.63 
 
 		 530 aa  332  8e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2663  GerA spore germination protein  35.38 
 
 		 517 aa  332  9e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0604  GerA spore germination protein  36.23 
 
 		 534 aa  330  3e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1194  grkA; spore germination protein, GrkA  34.31 
 
 		 537 aa  330  4e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.616884  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0846  GerA spore germination protein  36.48 
 
 		 540 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1956  GerA spore germination protein  38.25 
 
 		 531 aa  319  6e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1732  GerA spore germination protein  36.9 
 
 		 633 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0876  GerA spore germination protein  34.46 
 
 		 530 aa  312  9e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2953  GerA spore germination protein  35.26 
 
 		 622 aa  311  2e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1558  GerA spore germination protein  37.72 
 
 		 495 aa  307  3e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0057  GerA spore germination protein  34.78 
 
 		 523 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0078  germination protein  35.44 
 
 		 517 aa  306  6e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3070  GerA spore germination protein  38.9 
 
 		 496 aa  305  9.000000000000001e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2341  GerA spore germination protein  36.14 
 
 		 502 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532317  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3014  GerA spore germination protein  31.55 
 
 		 519 aa  302  8.000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1709  GerZA  35.29 
 
 		 497 aa  302  1e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000504866 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1936  GerA spore germination protein  35.98 
 
 		 596 aa  301  2e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5573  GerA spore germination protein  33.05 
 
 		 515 aa  300  5e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.32214 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2167  GerA spore germination protein  36.07 
 
 		 541 aa  299  1e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.087983  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0438  GerA spore germination protein  32.64 
 
 		 599 aa  296  4e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.561382  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2753  spore germination protein XA  36.36 
 
 		 454 aa  296  5e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.32378  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3682  spore germination protein  37.47 
 
 		 512 aa  292  1e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3599  spore germination protein  37.25 
 
 		 512 aa  288  1e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0521  GerA spore germination protein  33.27 
 
 		 578 aa  286  9e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0667  GerA spore germination protein  31.74 
 
 		 589 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3369  spore germination protein  35.89 
 
 		 512 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0478776  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3633  spore germination protein  35.89 
 
 		 512 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3282  spore germination protein  35.67 
 
 		 512 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1634  spore germination protein  36.34 
 
 		 512 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1962  GerA spore germination protein  30.67 
 
 		 525 aa  283  7.000000000000001e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.346602  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3582  spore germination protein  35.89 
 
 		 512 aa  283  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3332  spore germination protein  35.89 
 
 		 512 aa  281  2e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0829  GerA spore germination protein  32.62 
 
 		 492 aa  281  2e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0157  spore germination protein xa  30.66 
 
 		 492 aa  279  7e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0225  spore germination protein XA  31.09 
 
 		 511 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000185218 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0892  GerA spore germination protein  34.92 
 
 		 504 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1767  GerA spore germination protein  33.33 
 
 		 504 aa  266  5e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0236  spore germination protein, gerabka family  34.26 
 
 		 511 aa  264  3e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0199  spore germination protein, gerabka family  34.26 
 
 		 511 aa  264  3e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2458  GerA spore germination protein  35 
 
 		 512 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07080  GerA spore germination protein  29.71 
 
 		 501 aa  241  2.9999999999999997e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4869  spore germination protein GerHA  34.64 
 
 		 455 aa  238  1e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0643  GerA spore germination protein  34.26 
 
 		 503 aa  238  2e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4852  spore germination protein GerHA  33.95 
 
 		 455 aa  236  6e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4630  spore germination protein GerHA  35.39 
 
 		 747 aa  236  7e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4984  spore germination protein GerHA  35.39 
 
 		 747 aa  236  7e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4874  spore germination protein GerHA  35.73 
 
 		 734 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4464  spore germination protein  35.39 
 
 		 773 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4483  spore germination protein  35.15 
 
 		 735 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0615  GerABKA family spore germination protein  30.82 
 
 		 473 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0193  GerA spore germination protein  29.27 
 
 		 487 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2116  spore germination protein, GerA family  32.35 
 
 		 499 aa  234  3e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>