149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0846 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0846  GerA spore germination protein  100 
 
 
540 aa  1090    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1194  grkA; spore germination protein, GrkA  47.34 
 
 
537 aa  480  1e-134  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.616884  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3282  GerA spore germination protein  47.49 
 
 
499 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000691632  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0876  GerA spore germination protein  42.45 
 
 
530 aa  454  1.0000000000000001e-126  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2464  GerA spore germination protein  43.46 
 
 
541 aa  451  1e-125  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2765  GerA spore germination protein  45.53 
 
 
490 aa  448  1.0000000000000001e-124  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000513551  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2042  GerA spore germination protein  43.34 
 
 
560 aa  430  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.480991 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0803  GerA spore germination protein  42.6 
 
 
511 aa  431  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.905177  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3659  GerA spore germination protein  43.27 
 
 
510 aa  425  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0139  spore germination protein KA  42.15 
 
 
523 aa  422  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2167  GerA spore germination protein  45.78 
 
 
541 aa  415  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.087983  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3014  GerA spore germination protein  41.07 
 
 
519 aa  413  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0585  GerA spore germination protein  45.35 
 
 
552 aa  413  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.70288  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0054  GerA spore germination protein  42.74 
 
 
544 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0297  GerA spore germination protein  41.83 
 
 
512 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2278  GerA spore germination protein  40.04 
 
 
537 aa  396  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3202  spore germination protein KA  44.56 
 
 
530 aa  397  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0654  GerA spore germination protein  41.96 
 
 
530 aa  390  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00100  GerA spore germination protein  41.8 
 
 
531 aa  391  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2438  GerA spore germination protein  47.33 
 
 
587 aa  387  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1461  GerA spore germination protein  44.47 
 
 
558 aa  388  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3160  spore germination protein GerAA  40.88 
 
 
524 aa  382  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.275074 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3138  spore germination protein GerAA  41.14 
 
 
524 aa  377  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2853  spore germination protein  41.29 
 
 
524 aa  372  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0927787  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1014  GerA spore germination protein  37.65 
 
 
533 aa  373  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000120979 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2101  spore germination protein GerAA  41.29 
 
 
524 aa  374  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3167  spore germination protein GerAA  41.49 
 
 
524 aa  372  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.580414  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0057  GerA spore germination protein  41.36 
 
 
523 aa  356  5e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2663  GerA spore germination protein  39.68 
 
 
517 aa  356  5e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2456  GerA spore germination protein  36.92 
 
 
520 aa  356  5e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0604  GerA spore germination protein  40.58 
 
 
534 aa  355  8.999999999999999e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2928  spore germination protein GerAA  43.2 
 
 
437 aa  350  4e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2904  GerA family spore germination protein  42.96 
 
 
437 aa  350  4e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0141963  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3150  spore germination protein GerAA  43.2 
 
 
437 aa  350  4e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0619  spore germination protein  38.02 
 
 
492 aa  348  2e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0619  spore germination protein  37.81 
 
 
492 aa  346  5e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0837  spore germination protein GerLA  37.4 
 
 
489 aa  346  7e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1971  GerA spore germination protein  36.86 
 
 
592 aa  345  1e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0763  spore germination protein GerLA  37.4 
 
 
489 aa  344  2e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000217603 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0603  GerA spore germination protein  39.79 
 
 
534 aa  345  2e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0765  spore germination protein GerKA  39.3 
 
 
500 aa  343  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0078  germination protein  37.55 
 
 
517 aa  342  1e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0675  spore germination protein GerLA  37.61 
 
 
478 aa  341  2e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0709  spore germination protein GerLA  37.61 
 
 
478 aa  341  2e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0548  GerA spore germination protein  38.54 
 
 
500 aa  339  8e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0546  spore germination protein KA  38.68 
 
 
500 aa  339  9e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0602  spore germination protein GerKA  38.48 
 
 
500 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0546  spore germination protein KA  38.48 
 
 
500 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0635  spore germination protein GerKA  38.48 
 
 
500 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0691  spore germination protein GerKA  38.48 
 
 
500 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4666  spore germination protein GerKA  38.48 
 
 
500 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.5266399999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0671  spore germination protein GerKA  38.27 
 
 
500 aa  335  1e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0778  spore germination protein GerLA  37.4 
 
 
492 aa  334  3e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0743  spore germination protein GerLA  38.02 
 
 
492 aa  333  4e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.702364  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0624  GerA spore germination protein  38.14 
 
 
492 aa  332  9e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1732  GerA spore germination protein  36.74 
 
 
633 aa  332  1e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4594  spore germination protein GerLA  37.81 
 
 
492 aa  331  2e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0667  GerA spore germination protein  35.15 
 
 
589 aa  329  8e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3070  GerA spore germination protein  38.95 
 
 
496 aa  328  1.0000000000000001e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0597  GerA spore germination protein  37.5 
 
 
488 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0438  GerA spore germination protein  37.21 
 
 
599 aa  321  1.9999999999999998e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.561382  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2062  GerA spore germination protein  36.48 
 
 
511 aa  321  1.9999999999999998e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0629  spore germination protein  37.07 
 
 
473 aa  318  1e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.572288  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0615  GerABKA family spore germination protein  36.85 
 
 
473 aa  318  2e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2953  GerA spore germination protein  36.36 
 
 
622 aa  318  2e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1558  GerA spore germination protein  41.26 
 
 
495 aa  314  1.9999999999999998e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1936  GerA spore germination protein  37.45 
 
 
596 aa  312  1e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0521  GerA spore germination protein  34.88 
 
 
578 aa  310  5e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3682  spore germination protein  36.5 
 
 
512 aa  296  9e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1634  spore germination protein  35.17 
 
 
512 aa  295  2e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3369  spore germination protein  35.98 
 
 
512 aa  292  9e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0478776  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3633  spore germination protein  35.98 
 
 
512 aa  292  9e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3582  spore germination protein  35.98 
 
 
512 aa  292  1e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3332  spore germination protein  35.98 
 
 
512 aa  292  1e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3282  spore germination protein  35.98 
 
 
512 aa  292  1e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3599  spore germination protein  34.22 
 
 
512 aa  291  2e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5573  GerA spore germination protein  34.72 
 
 
515 aa  290  7e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.32214 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2341  GerA spore germination protein  36.29 
 
 
502 aa  281  2e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532317  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1709  GerZA  35.17 
 
 
497 aa  276  5e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000504866 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0892  GerA spore germination protein  34.53 
 
 
504 aa  271  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0829  GerA spore germination protein  32.02 
 
 
492 aa  268  1e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1962  GerA spore germination protein  32.77 
 
 
525 aa  265  1e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.346602  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1956  GerA spore germination protein  33.27 
 
 
531 aa  261  2e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0199  spore germination protein, gerabka family  33.86 
 
 
511 aa  260  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0236  spore germination protein, gerabka family  33.86 
 
 
511 aa  260  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0643  GerA spore germination protein  33.04 
 
 
503 aa  259  1e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2753  spore germination protein XA  35.07 
 
 
454 aa  258  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.32378  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0157  spore germination protein xa  33.77 
 
 
492 aa  256  5e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1767  GerA spore germination protein  32.6 
 
 
504 aa  256  7e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4515  spore germination protein, GerA family  33.47 
 
 
505 aa  253  6e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00860223 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0819  spore germination protein, GerA family  33.26 
 
 
505 aa  251  3e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3142  spore germination protein, GerA family  34.93 
 
 
481 aa  250  5e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.401489 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3121  spore germination protein QA  35.81 
 
 
499 aa  249  7e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2888  GerA family spore germination protein  35.43 
 
 
499 aa  249  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0644485  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2116  spore germination protein, GerA family  35.55 
 
 
499 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0926  spore germination protein A  33.05 
 
 
505 aa  246  9e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0677  GerA spore germination protein  33 
 
 
501 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0829  spore germination protein GerYA  32.7 
 
 
505 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000722012  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0225  spore germination protein XA  28.34 
 
 
511 aa  243  9e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000185218 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0727  spore germination protein GerYA  32.63 
 
 
501 aa  238  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>