149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3436 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3436  GerA spore germination protein  100 
 
 
497 aa  1006    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0629  GerA spore germination protein  50.41 
 
 
500 aa  538  9.999999999999999e-153  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2069  GerA spore germination protein  52.07 
 
 
505 aa  537  1e-151  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0159495  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0193  GerA spore germination protein  51.46 
 
 
487 aa  530  1e-149  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1110  GerA spore germination protein  55.3 
 
 
509 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1373  GerA spore germination protein  50.93 
 
 
528 aa  494  9.999999999999999e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1611  GerA spore germination protein  50 
 
 
493 aa  478  1e-134  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000599872  unclonable  8.60289e-23 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1245  GerA spore germination protein  50.41 
 
 
496 aa  475  1e-133  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2763  GerA spore germination protein  48.48 
 
 
490 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4134  stage V sporulation protein AF  47.96 
 
 
490 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3975  stage V sporulation protein AF  47.96 
 
 
490 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3805  stage V sporulation protein AF  47.96 
 
 
490 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3820  stage V sporulation protein AF  47.96 
 
 
490 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4286  stage V sporulation protein AF  47.96 
 
 
490 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.41401  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4196  stage V sporulation protein AF  47.96 
 
 
490 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00517617  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4085  stage V sporulation protein AF  47.96 
 
 
490 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000209358 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0381  GerA spore germination protein  46.33 
 
 
492 aa  464  1e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3894  GerA spore germination protein  47.14 
 
 
490 aa  463  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.422224  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4173  stage V sporulation protein AF  47.35 
 
 
490 aa  464  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271517  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1065  stage V sporulation protein AF  47.35 
 
 
490 aa  463  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.396265  normal  0.413408 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2243  GerA spore germination protein  46.63 
 
 
490 aa  449  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07080  GerA spore germination protein  42.54 
 
 
501 aa  430  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1241  spore germination protein AF  37.66 
 
 
473 aa  354  2e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0376224  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1053  GerA spore germination protein  37.66 
 
 
473 aa  355  2e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.273737  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1562  GerA spore germination protein  38 
 
 
499 aa  333  3e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.791927  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0751  GerA spore germination protein  33.69 
 
 
473 aa  301  3e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3202  spore germination protein KA  31.8 
 
 
530 aa  263  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00100  GerA spore germination protein  34.25 
 
 
531 aa  257  3e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0603  GerA spore germination protein  32.8 
 
 
534 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1014  GerA spore germination protein  33.26 
 
 
533 aa  249  1e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000120979 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0803  GerA spore germination protein  31.1 
 
 
511 aa  246  6e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.905177  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2464  GerA spore germination protein  30.26 
 
 
541 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3160  spore germination protein GerAA  30.14 
 
 
524 aa  240  5e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.275074 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0139  spore germination protein KA  29.61 
 
 
523 aa  239  1e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1194  grkA; spore germination protein, GrkA  29.88 
 
 
537 aa  238  2e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.616884  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2953  GerA spore germination protein  30.16 
 
 
622 aa  238  2e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2853  spore germination protein  29.94 
 
 
524 aa  237  3e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0927787  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3167  spore germination protein GerAA  29.94 
 
 
524 aa  237  3e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.580414  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3138  spore germination protein GerAA  29.74 
 
 
524 aa  237  3e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0667  GerA spore germination protein  30.42 
 
 
589 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2042  GerA spore germination protein  31 
 
 
560 aa  234  2.0000000000000002e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.480991 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0054  GerA spore germination protein  30.49 
 
 
544 aa  234  3e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0438  GerA spore germination protein  32.5 
 
 
599 aa  233  5e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.561382  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0057  GerA spore germination protein  30.57 
 
 
523 aa  233  5e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3659  GerA spore germination protein  30.63 
 
 
510 aa  233  8.000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2101  spore germination protein GerAA  29.14 
 
 
524 aa  231  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0297  GerA spore germination protein  32.03 
 
 
512 aa  231  3e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1732  GerA spore germination protein  28.8 
 
 
633 aa  228  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0765  spore germination protein GerKA  29.78 
 
 
500 aa  227  3e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4666  spore germination protein GerKA  30.35 
 
 
500 aa  227  4e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.5266399999999997e-20 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0585  GerA spore germination protein  30.1 
 
 
552 aa  226  8e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.70288  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0671  spore germination protein GerKA  29.92 
 
 
500 aa  226  9e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0691  spore germination protein GerKA  29.69 
 
 
500 aa  225  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0546  spore germination protein KA  29.69 
 
 
500 aa  225  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2904  GerA family spore germination protein  32.12 
 
 
437 aa  224  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0141963  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2928  spore germination protein GerAA  32.12 
 
 
437 aa  224  3e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0546  spore germination protein KA  29.48 
 
 
500 aa  224  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3150  spore germination protein GerAA  32.12 
 
 
437 aa  224  3e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0602  spore germination protein GerKA  29.48 
 
 
500 aa  224  4e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0635  spore germination protein GerKA  29.48 
 
 
500 aa  224  4e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0876  GerA spore germination protein  29.13 
 
 
530 aa  223  6e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2765  GerA spore germination protein  31.02 
 
 
490 aa  223  9e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000513551  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2167  GerA spore germination protein  29.84 
 
 
541 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.087983  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0548  GerA spore germination protein  29.18 
 
 
500 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2663  GerA spore germination protein  29.44 
 
 
517 aa  221  3e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3282  GerA spore germination protein  29.76 
 
 
499 aa  219  7.999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000691632  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1971  GerA spore germination protein  30.56 
 
 
592 aa  219  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0521  GerA spore germination protein  29.9 
 
 
578 aa  218  2e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2278  GerA spore germination protein  32.25 
 
 
537 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2456  GerA spore germination protein  29.25 
 
 
520 aa  214  1.9999999999999998e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3369  spore germination protein  31.21 
 
 
512 aa  213  9e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0478776  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3633  spore germination protein  31.21 
 
 
512 aa  213  9e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3582  spore germination protein  30.99 
 
 
512 aa  211  3e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3282  spore germination protein  31.21 
 
 
512 aa  211  3e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2062  GerA spore germination protein  26.38 
 
 
511 aa  211  3e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3332  spore germination protein  30.99 
 
 
512 aa  210  5e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0654  GerA spore germination protein  27.38 
 
 
530 aa  209  7e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0829  GerA spore germination protein  28.6 
 
 
492 aa  208  1e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3599  spore germination protein  29.65 
 
 
512 aa  209  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1936  GerA spore germination protein  30.62 
 
 
596 aa  208  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1634  spore germination protein  30.06 
 
 
512 aa  207  3e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0078  germination protein  30.38 
 
 
517 aa  207  4e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3682  spore germination protein  30.46 
 
 
512 aa  206  8e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2438  GerA spore germination protein  30.92 
 
 
587 aa  205  2e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1956  GerA spore germination protein  31.02 
 
 
531 aa  205  2e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0604  GerA spore germination protein  29.6 
 
 
534 aa  204  4e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0675  spore germination protein GerLA  29.29 
 
 
478 aa  202  9e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0709  spore germination protein GerLA  29.29 
 
 
478 aa  202  9e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0619  spore germination protein  29.68 
 
 
492 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0763  spore germination protein GerLA  29.29 
 
 
489 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000217603 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0837  spore germination protein GerLA  30.13 
 
 
489 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0619  spore germination protein  29.29 
 
 
492 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2341  GerA spore germination protein  28 
 
 
502 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532317  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1461  GerA spore germination protein  27.1 
 
 
558 aa  199  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0778  spore germination protein GerLA  29.08 
 
 
492 aa  197  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0624  GerA spore germination protein  29.92 
 
 
492 aa  197  5.000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1709  GerZA  27.45 
 
 
497 aa  197  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000504866 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5573  GerA spore germination protein  27.49 
 
 
515 aa  196  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.32214 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4594  spore germination protein GerLA  29.26 
 
 
492 aa  195  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0743  spore germination protein GerLA  29.26 
 
 
492 aa  194  4e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.702364  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>