149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0751 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0751  GerA spore germination protein  100 
 
 		 473 aa  959    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1241  spore germination protein AF  45.65 
 
 		 473 aa  426  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0376224  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1053  GerA spore germination protein  45.86 
 
 		 473 aa  427  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.273737  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0629  GerA spore germination protein  38.28 
 
 		 500 aa  341  2e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0193  GerA spore germination protein  35.38 
 
 		 487 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2069  GerA spore germination protein  34.41 
 
 		 505 aa  317  4e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0159495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1373  GerA spore germination protein  35.19 
 
 		 528 aa  315  8e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07080  GerA spore germination protein  35.39 
 
 		 501 aa  315  9.999999999999999e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1110  GerA spore germination protein  36.52 
 
 		 509 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3436  GerA spore germination protein  33.69 
 
 		 497 aa  301  2e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1245  GerA spore germination protein  34.58 
 
 		 496 aa  274  3e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4134  stage V sporulation protein AF  33.26 
 
 		 490 aa  271  2e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1611  GerA spore germination protein  34.39 
 
 		 493 aa  271  2e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000599872  unclonable  8.60289e-23 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4085  stage V sporulation protein AF  33.26 
 
 		 490 aa  270  4e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000209358 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3975  stage V sporulation protein AF  33.26 
 
 		 490 aa  269  8e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3805  stage V sporulation protein AF  33.26 
 
 		 490 aa  269  8e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4286  stage V sporulation protein AF  33.26 
 
 		 490 aa  269  8e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.41401  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3820  stage V sporulation protein AF  33.05 
 
 		 490 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4196  stage V sporulation protein AF  33.05 
 
 		 490 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00517617  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4173  stage V sporulation protein AF  32.83 
 
 		 490 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271517  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1065  stage V sporulation protein AF  32.83 
 
 		 490 aa  266  4e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.396265  normal  0.413408 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3894  GerA spore germination protein  32.61 
 
 		 490 aa  266  5e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.422224  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0381  GerA spore germination protein  31.26 
 
 		 492 aa  264  3e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2763  GerA spore germination protein  32.61 
 
 		 490 aa  264  3e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1562  GerA spore germination protein  31.14 
 
 		 499 aa  257  4e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.791927  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2243  GerA spore germination protein  31.91 
 
 		 490 aa  248  1e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1014  GerA spore germination protein  27.97 
 
 		 533 aa  220  5e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000120979 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0139  spore germination protein KA  27 
 
 		 523 aa  207  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2042  GerA spore germination protein  26.84 
 
 		 560 aa  205  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.480991 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0297  GerA spore germination protein  27.23 
 
 		 512 aa  202  9.999999999999999e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3202  spore germination protein KA  27.02 
 
 		 530 aa  201  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3659  GerA spore germination protein  26.51 
 
 		 510 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2464  GerA spore germination protein  26.95 
 
 		 541 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0603  GerA spore germination protein  29.88 
 
 		 534 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0892  GerA spore germination protein  30.51 
 
 		 504 aa  190  4e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00100  GerA spore germination protein  26.28 
 
 		 531 aa  188  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0604  GerA spore germination protein  26.45 
 
 		 534 aa  187  3e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1461  GerA spore germination protein  27.2 
 
 		 558 aa  186  7e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2438  GerA spore germination protein  26.07 
 
 		 587 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2853  spore germination protein  26.78 
 
 		 524 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0927787  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2278  GerA spore germination protein  25.59 
 
 		 537 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3167  spore germination protein GerAA  27 
 
 		 524 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.580414  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3138  spore germination protein GerAA  27.06 
 
 		 524 aa  184  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2101  spore germination protein GerAA  26.57 
 
 		 524 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2167  GerA spore germination protein  26.6 
 
 		 541 aa  182  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.087983  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3160  spore germination protein GerAA  26.78 
 
 		 524 aa  182  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.275074 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0803  GerA spore germination protein  25.64 
 
 		 511 aa  182  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.905177  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4666  spore germination protein GerKA  27.65 
 
 		 500 aa  178  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.5266399999999997e-20 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0054  GerA spore germination protein  24.84 
 
 		 544 aa  177  4e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0438  GerA spore germination protein  25.93 
 
 		 599 aa  177  5e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.561382  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1194  grkA; spore germination protein, GrkA  27.11 
 
 		 537 aa  176  7e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.616884  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0548  GerA spore germination protein  27.08 
 
 		 500 aa  176  8e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0765  spore germination protein GerKA  27.1 
 
 		 500 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0671  spore germination protein GerKA  28.57 
 
 		 500 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0546  spore germination protein KA  26.39 
 
 		 500 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0691  spore germination protein GerKA  26.18 
 
 		 500 aa  172  9e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0546  spore germination protein KA  26.18 
 
 		 500 aa  172  9e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2062  GerA spore germination protein  26.13 
 
 		 511 aa  172  9e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1767  GerA spore germination protein  26.11 
 
 		 504 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2928  spore germination protein GerAA  27.71 
 
 		 437 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2904  GerA family spore germination protein  27.71 
 
 		 437 aa  171  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0141963  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3150  spore germination protein GerAA  27.71 
 
 		 437 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0602  spore germination protein GerKA  25.97 
 
 		 500 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0635  spore germination protein GerKA  25.97 
 
 		 500 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1936  GerA spore germination protein  25.42 
 
 		 596 aa  169  8e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0667  GerA spore germination protein  24.84 
 
 		 589 aa  169  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1732  GerA spore germination protein  27.76 
 
 		 633 aa  169  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2663  GerA spore germination protein  23.26 
 
 		 517 aa  168  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1956  GerA spore germination protein  29.32 
 
 		 531 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2456  GerA spore germination protein  25.11 
 
 		 520 aa  167  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5573  GerA spore germination protein  25.7 
 
 		 515 aa  167  5e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.32214 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2765  GerA spore germination protein  27.72 
 
 		 490 aa  167  5e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000513551  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0199  spore germination protein, gerabka family  26.52 
 
 		 511 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0236  spore germination protein, gerabka family  26.52 
 
 		 511 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2953  GerA spore germination protein  24.84 
 
 		 622 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1971  GerA spore germination protein  23.91 
 
 		 592 aa  163  7e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0597  GerA spore germination protein  26.39 
 
 		 488 aa  162  9e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0057  GerA spore germination protein  25.98 
 
 		 523 aa  162  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0078  germination protein  27.59 
 
 		 517 aa  162  1e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0876  GerA spore germination protein  24.89 
 
 		 530 aa  161  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3282  GerA spore germination protein  24.74 
 
 		 499 aa  159  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000691632  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2753  spore germination protein XA  26.52 
 
 		 454 aa  158  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.32378  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3582  spore germination protein  28.51 
 
 		 512 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0829  GerA spore germination protein  29.33 
 
 		 492 aa  156  6e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3682  spore germination protein  28.05 
 
 		 512 aa  156  7e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3369  spore germination protein  28.28 
 
 		 512 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0478776  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3633  spore germination protein  28.28 
 
 		 512 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3599  spore germination protein  27.56 
 
 		 512 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3332  spore germination protein  28.28 
 
 		 512 aa  155  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0157  spore germination protein xa  26.5 
 
 		 492 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0846  GerA spore germination protein  24.79 
 
 		 540 aa  154  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0521  GerA spore germination protein  23.8 
 
 		 578 aa  152  8.999999999999999e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3282  spore germination protein  28.05 
 
 		 512 aa  152  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0654  GerA spore germination protein  25.9 
 
 		 530 aa  152  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1634  spore germination protein  26.55 
 
 		 512 aa  152  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3070  GerA spore germination protein  24.11 
 
 		 496 aa  151  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2458  GerA spore germination protein  27.85 
 
 		 512 aa  150  7e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0675  spore germination protein GerLA  23.56 
 
 		 478 aa  149  9e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0709  spore germination protein GerLA  23.56 
 
 		 478 aa  149  9e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0763  spore germination protein GerLA  23.56 
 
 		 489 aa  149  9e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000217603 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>