149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1053 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1241  spore germination protein AF  99.58 
 
 		 473 aa  941    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0376224  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1053  GerA spore germination protein  100 
 
 		 473 aa  942    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.273737  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0751  GerA spore germination protein  45.86 
 
 		 473 aa  427  1e-118  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0629  GerA spore germination protein  43.17 
 
 		 500 aa  404  1e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0193  GerA spore germination protein  39.35 
 
 		 487 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1373  GerA spore germination protein  39.52 
 
 		 528 aa  360  4e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2069  GerA spore germination protein  38.56 
 
 		 505 aa  359  7e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0159495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3436  GerA spore germination protein  37.66 
 
 		 497 aa  355  1e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07080  GerA spore germination protein  37.23 
 
 		 501 aa  340  4e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1245  GerA spore germination protein  40.78 
 
 		 496 aa  338  9.999999999999999e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1110  GerA spore germination protein  39.7 
 
 		 509 aa  335  9e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0381  GerA spore germination protein  37.67 
 
 		 492 aa  325  1e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1611  GerA spore germination protein  38.18 
 
 		 493 aa  318  2e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000599872  unclonable  8.60289e-23 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2763  GerA spore germination protein  36.23 
 
 		 490 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4134  stage V sporulation protein AF  35.89 
 
 		 490 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4173  stage V sporulation protein AF  36.11 
 
 		 490 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271517  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3894  GerA spore germination protein  35.34 
 
 		 490 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.422224  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1065  stage V sporulation protein AF  35.89 
 
 		 490 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.396265  normal  0.413408 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3820  stage V sporulation protein AF  35.67 
 
 		 490 aa  303  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4196  stage V sporulation protein AF  35.67 
 
 		 490 aa  303  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00517617  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3975  stage V sporulation protein AF  35.67 
 
 		 490 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3805  stage V sporulation protein AF  35.67 
 
 		 490 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4286  stage V sporulation protein AF  35.67 
 
 		 490 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.41401  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4085  stage V sporulation protein AF  35.67 
 
 		 490 aa  301  2e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000209358 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2243  GerA spore germination protein  36.49 
 
 		 490 aa  301  2e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1562  GerA spore germination protein  32.17 
 
 		 499 aa  249  9e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.791927  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0139  spore germination protein KA  28.48 
 
 		 523 aa  223  4e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00100  GerA spore germination protein  32.35 
 
 		 531 aa  223  7e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2663  GerA spore germination protein  28.32 
 
 		 517 aa  220  5e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0297  GerA spore germination protein  30.34 
 
 		 512 aa  219  8.999999999999998e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2042  GerA spore germination protein  28.6 
 
 		 560 aa  219  1e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.480991 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1014  GerA spore germination protein  29.27 
 
 		 533 aa  216  8e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000120979 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2464  GerA spore germination protein  27.02 
 
 		 541 aa  212  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2853  spore germination protein  27.85 
 
 		 524 aa  212  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0927787  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3659  GerA spore germination protein  27.62 
 
 		 510 aa  212  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3138  spore germination protein GerAA  27.85 
 
 		 524 aa  211  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3160  spore germination protein GerAA  28.06 
 
 		 524 aa  210  3e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.275074 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0803  GerA spore germination protein  28.99 
 
 		 511 aa  211  3e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.905177  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3167  spore germination protein GerAA  27.64 
 
 		 524 aa  209  7e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.580414  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3202  spore germination protein KA  29.6 
 
 		 530 aa  209  7e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2101  spore germination protein GerAA  27.22 
 
 		 524 aa  209  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0603  GerA spore germination protein  30.94 
 
 		 534 aa  204  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1461  GerA spore germination protein  29.32 
 
 		 558 aa  204  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0054  GerA spore germination protein  26.68 
 
 		 544 aa  204  4e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2062  GerA spore germination protein  29.12 
 
 		 511 aa  203  6e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2904  GerA family spore germination protein  29.57 
 
 		 437 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0141963  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2765  GerA spore germination protein  28.07 
 
 		 490 aa  201  3e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000513551  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1732  GerA spore germination protein  31.37 
 
 		 633 aa  201  3e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1194  grkA; spore germination protein, GrkA  29.38 
 
 		 537 aa  200  3.9999999999999996e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.616884  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2928  spore germination protein GerAA  29.09 
 
 		 437 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3150  spore germination protein GerAA  29.09 
 
 		 437 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0892  GerA spore germination protein  28.36 
 
 		 504 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0078  germination protein  28.98 
 
 		 517 aa  196  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2167  GerA spore germination protein  28.39 
 
 		 541 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.087983  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2456  GerA spore germination protein  28.39 
 
 		 520 aa  194  3e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0604  GerA spore germination protein  29.18 
 
 		 534 aa  192  9e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1936  GerA spore germination protein  27.37 
 
 		 596 aa  192  1e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0829  GerA spore germination protein  29.85 
 
 		 492 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2438  GerA spore germination protein  26.43 
 
 		 587 aa  191  2.9999999999999997e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3282  GerA spore germination protein  27.84 
 
 		 499 aa  189  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000691632  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2278  GerA spore germination protein  28.95 
 
 		 537 aa  189  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2953  GerA spore germination protein  28.31 
 
 		 622 aa  189  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0667  GerA spore germination protein  25.78 
 
 		 589 aa  187  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0876  GerA spore germination protein  26.83 
 
 		 530 aa  186  6e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1767  GerA spore germination protein  27.93 
 
 		 504 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0585  GerA spore germination protein  26.47 
 
 		 552 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.70288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0438  GerA spore germination protein  26.51 
 
 		 599 aa  181  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.561382  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0057  GerA spore germination protein  27.16 
 
 		 523 aa  181  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0765  spore germination protein GerKA  27.67 
 
 		 500 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0597  GerA spore germination protein  25.65 
 
 		 488 aa  177  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1971  GerA spore germination protein  29.37 
 
 		 592 aa  177  3e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0619  spore germination protein  27.06 
 
 		 492 aa  176  6e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0619  spore germination protein  26.9 
 
 		 492 aa  176  6e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0521  GerA spore germination protein  27.39 
 
 		 578 aa  176  7e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0675  spore germination protein GerLA  27.06 
 
 		 478 aa  176  9e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0709  spore germination protein GerLA  27.06 
 
 		 478 aa  176  9e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0763  spore germination protein GerLA  27.06 
 
 		 489 aa  176  9e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000217603 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0837  spore germination protein GerLA  27.06 
 
 		 489 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0691  spore germination protein GerKA  27.23 
 
 		 500 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0546  spore germination protein KA  27.23 
 
 		 500 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1956  GerA spore germination protein  30.19 
 
 		 531 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0602  spore germination protein GerKA  27.02 
 
 		 500 aa  173  5e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0635  spore germination protein GerKA  27.02 
 
 		 500 aa  173  5e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0546  spore germination protein KA  26.8 
 
 		 500 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0548  GerA spore germination protein  26.84 
 
 		 500 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4666  spore germination protein GerKA  26.97 
 
 		 500 aa  172  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.5266399999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0671  spore germination protein GerKA  28.91 
 
 		 500 aa  172  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3014  GerA spore germination protein  27.97 
 
 		 519 aa  172  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0157  spore germination protein xa  25.52 
 
 		 492 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5573  GerA spore germination protein  27.86 
 
 		 515 aa  170  5e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.32214 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1558  GerA spore germination protein  27.92 
 
 		 495 aa  170  5e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0778  spore germination protein GerLA  26.55 
 
 		 492 aa  169  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3282  spore germination protein  31.47 
 
 		 512 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0624  GerA spore germination protein  26.37 
 
 		 492 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3369  spore germination protein  31.81 
 
 		 512 aa  167  5e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0478776  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3633  spore germination protein  31.81 
 
 		 512 aa  167  5e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3332  spore germination protein  31.81 
 
 		 512 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0643  GerA spore germination protein  27.21 
 
 		 503 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2753  spore germination protein XA  26.85 
 
 		 454 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.32378  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0615  GerABKA family spore germination protein  28.48 
 
 		 473 aa  166  9e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>