149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1110 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1110  GerA spore germination protein  100 
 
 		 509 aa  1024    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2069  GerA spore germination protein  56.55 
 
 		 505 aa  588  1e-167  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0159495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3436  GerA spore germination protein  55.3 
 
 		 497 aa  550  1e-155  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0629  GerA spore germination protein  49.69 
 
 		 500 aa  538  9.999999999999999e-153  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1373  GerA spore germination protein  50.81 
 
 		 528 aa  531  1e-149  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1245  GerA spore germination protein  54.62 
 
 		 496 aa  511  1e-144  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0193  GerA spore germination protein  48.36 
 
 		 487 aa  502  1e-141  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0381  GerA spore germination protein  47.85 
 
 		 492 aa  463  1e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2243  GerA spore germination protein  47.65 
 
 		 490 aa  448  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2763  GerA spore germination protein  46.04 
 
 		 490 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3975  stage V sporulation protein AF  45.74 
 
 		 490 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3805  stage V sporulation protein AF  45.74 
 
 		 490 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3820  stage V sporulation protein AF  45.74 
 
 		 490 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4286  stage V sporulation protein AF  45.74 
 
 		 490 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.41401  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3894  GerA spore germination protein  45.95 
 
 		 490 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.422224  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4196  stage V sporulation protein AF  45.74 
 
 		 490 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00517617  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4085  stage V sporulation protein AF  45.74 
 
 		 490 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000209358 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1065  stage V sporulation protein AF  45.53 
 
 		 490 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.396265  normal  0.413408 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4134  stage V sporulation protein AF  45.74 
 
 		 490 aa  437  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07080  GerA spore germination protein  45.21 
 
 		 501 aa  438  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4173  stage V sporulation protein AF  45.53 
 
 		 490 aa  437  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271517  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1611  GerA spore germination protein  44.15 
 
 		 493 aa  432  1e-119  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000599872  unclonable  8.60289e-23 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1241  spore germination protein AF  39.7 
 
 		 473 aa  373  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0376224  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1053  GerA spore germination protein  39.7 
 
 		 473 aa  373  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.273737  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0751  GerA spore germination protein  36.52 
 
 		 473 aa  338  1.9999999999999998e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1562  GerA spore germination protein  39.63 
 
 		 499 aa  332  1e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.791927  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0139  spore germination protein KA  31.36 
 
 		 523 aa  269  8e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0297  GerA spore germination protein  34.23 
 
 		 512 aa  265  1e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2042  GerA spore germination protein  32.12 
 
 		 560 aa  264  3e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.480991 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3202  spore germination protein KA  33.33 
 
 		 530 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0054  GerA spore germination protein  33.96 
 
 		 544 aa  261  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3167  spore germination protein GerAA  32.66 
 
 		 524 aa  260  4e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.580414  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3138  spore germination protein GerAA  32.66 
 
 		 524 aa  259  6e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2853  spore germination protein  32.66 
 
 		 524 aa  259  7e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0927787  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2101  spore germination protein GerAA  32.45 
 
 		 524 aa  259  9e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3659  GerA spore germination protein  31.61 
 
 		 510 aa  259  1e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2167  GerA spore germination protein  32.94 
 
 		 541 aa  256  6e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.087983  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2278  GerA spore germination protein  31.64 
 
 		 537 aa  256  9e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3160  spore germination protein GerAA  32.45 
 
 		 524 aa  254  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.275074 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1194  grkA; spore germination protein, GrkA  31.58 
 
 		 537 aa  253  4.0000000000000004e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.616884  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2464  GerA spore germination protein  32.06 
 
 		 541 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00100  GerA spore germination protein  37.22 
 
 		 531 aa  250  3e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0603  GerA spore germination protein  34.13 
 
 		 534 aa  250  4e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0604  GerA spore germination protein  32.46 
 
 		 534 aa  249  1e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0803  GerA spore germination protein  31.98 
 
 		 511 aa  248  2e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.905177  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2765  GerA spore germination protein  32.98 
 
 		 490 aa  246  4.9999999999999997e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000513551  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3282  GerA spore germination protein  33.94 
 
 		 499 aa  246  8e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000691632  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2062  GerA spore germination protein  31.12 
 
 		 511 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2456  GerA spore germination protein  30.35 
 
 		 520 aa  244  1.9999999999999999e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1014  GerA spore germination protein  30.39 
 
 		 533 aa  244  3e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000120979 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0597  GerA spore germination protein  32.47 
 
 		 488 aa  242  1e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1461  GerA spore germination protein  32.27 
 
 		 558 aa  241  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2904  GerA family spore germination protein  33.97 
 
 		 437 aa  240  4e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0141963  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2928  spore germination protein GerAA  34.21 
 
 		 437 aa  240  5e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3150  spore germination protein GerAA  34.21 
 
 		 437 aa  240  5e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2953  GerA spore germination protein  31.98 
 
 		 622 aa  239  8e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2663  GerA spore germination protein  29.38 
 
 		 517 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0585  GerA spore germination protein  31.65 
 
 		 552 aa  238  2e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.70288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0057  GerA spore germination protein  33.62 
 
 		 523 aa  237  4e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0837  spore germination protein GerLA  32.12 
 
 		 489 aa  236  7e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0675  spore germination protein GerLA  31.48 
 
 		 478 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0709  spore germination protein GerLA  31.48 
 
 		 478 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0763  spore germination protein GerLA  31.48 
 
 		 489 aa  233  9e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000217603 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0619  spore germination protein  31.48 
 
 		 492 aa  232  1e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0619  spore germination protein  31.48 
 
 		 492 aa  231  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2438  GerA spore germination protein  30.6 
 
 		 587 aa  231  2e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0876  GerA spore germination protein  29.13 
 
 		 530 aa  230  4e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0624  GerA spore germination protein  32.26 
 
 		 492 aa  228  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4666  spore germination protein GerKA  31.76 
 
 		 500 aa  227  4e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.5266399999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4594  spore germination protein GerLA  30.9 
 
 		 492 aa  227  4e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0743  spore germination protein GerLA  30.98 
 
 		 492 aa  226  7e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.702364  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0654  GerA spore germination protein  31.06 
 
 		 530 aa  225  1e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0765  spore germination protein GerKA  31.01 
 
 		 500 aa  224  4e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0778  spore germination protein GerLA  30.75 
 
 		 492 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0548  GerA spore germination protein  31.46 
 
 		 500 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0667  GerA spore germination protein  29.64 
 
 		 589 aa  223  8e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0671  spore germination protein GerKA  30.77 
 
 		 500 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0846  GerA spore germination protein  29.48 
 
 		 540 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0546  spore germination protein KA  31.46 
 
 		 500 aa  221  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0691  spore germination protein GerKA  31.46 
 
 		 500 aa  220  5e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0546  spore germination protein KA  31.46 
 
 		 500 aa  220  5e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0602  spore germination protein GerKA  31.46 
 
 		 500 aa  220  6e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0635  spore germination protein GerKA  31.46 
 
 		 500 aa  220  6e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1936  GerA spore germination protein  31.36 
 
 		 596 aa  219  1e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0078  germination protein  31.79 
 
 		 517 aa  218  2e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0438  GerA spore germination protein  31.44 
 
 		 599 aa  217  4e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.561382  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0829  GerA spore germination protein  30.83 
 
 		 492 aa  215  1.9999999999999998e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1956  GerA spore germination protein  32.17 
 
 		 531 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2753  spore germination protein XA  29.35 
 
 		 454 aa  211  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.32378  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1732  GerA spore germination protein  30.95 
 
 		 633 aa  211  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0521  GerA spore germination protein  27.53 
 
 		 578 aa  211  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3599  spore germination protein  30.15 
 
 		 512 aa  209  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1634  spore germination protein  29.68 
 
 		 512 aa  207  3e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3369  spore germination protein  29.72 
 
 		 512 aa  206  6e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0478776  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3332  spore germination protein  29.72 
 
 		 512 aa  206  6e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3633  spore germination protein  29.72 
 
 		 512 aa  206  6e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3582  spore germination protein  29.72 
 
 		 512 aa  206  7e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5573  GerA spore germination protein  28.02 
 
 		 515 aa  206  7e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.32214 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3014  GerA spore germination protein  28.95 
 
 		 519 aa  206  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3282  spore germination protein  30 
 
 		 512 aa  206  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>