149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2243 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_4134  stage V sporulation protein AF  61.75 
 
 
490 aa  636    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3975  stage V sporulation protein AF  61.54 
 
 
490 aa  636    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3805  stage V sporulation protein AF  61.54 
 
 
490 aa  636    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3820  stage V sporulation protein AF  61.54 
 
 
490 aa  637    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4286  stage V sporulation protein AF  61.54 
 
 
490 aa  636    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.41401  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2763  GerA spore germination protein  62.66 
 
 
490 aa  648    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0381  GerA spore germination protein  89.46 
 
 
492 aa  880    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3894  GerA spore germination protein  61.2 
 
 
490 aa  637    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.422224  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2243  GerA spore germination protein  100 
 
 
490 aa  992    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4196  stage V sporulation protein AF  61.54 
 
 
490 aa  637    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00517617  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4173  stage V sporulation protein AF  61.12 
 
 
490 aa  635    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271517  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4085  stage V sporulation protein AF  61.54 
 
 
490 aa  635    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000209358 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1065  stage V sporulation protein AF  61.33 
 
 
490 aa  635    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.396265  normal  0.413408 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0629  GerA spore germination protein  48.13 
 
 
500 aa  509  1e-143  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0193  GerA spore germination protein  48.67 
 
 
487 aa  498  1e-140  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3436  GerA spore germination protein  46.53 
 
 
497 aa  491  1e-137  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2069  GerA spore germination protein  46.36 
 
 
505 aa  482  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0159495  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1373  GerA spore germination protein  47.35 
 
 
528 aa  476  1e-133  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1110  GerA spore germination protein  47.65 
 
 
509 aa  457  1e-127  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1245  GerA spore germination protein  48.14 
 
 
496 aa  439  9.999999999999999e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1611  GerA spore germination protein  43.75 
 
 
493 aa  419  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000599872  unclonable  8.60289e-23 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07080  GerA spore germination protein  39.58 
 
 
501 aa  393  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1053  GerA spore germination protein  36.71 
 
 
473 aa  334  2e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.273737  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1241  spore germination protein AF  36.49 
 
 
473 aa  333  3e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0376224  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1562  GerA spore germination protein  36.48 
 
 
499 aa  325  1e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.791927  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0751  GerA spore germination protein  32.27 
 
 
473 aa  278  1e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3202  spore germination protein KA  33.99 
 
 
530 aa  265  1e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2101  spore germination protein GerAA  30.3 
 
 
524 aa  244  3e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3138  spore germination protein GerAA  30.1 
 
 
524 aa  242  9e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3167  spore germination protein GerAA  30.1 
 
 
524 aa  242  1e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.580414  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3160  spore germination protein GerAA  29.94 
 
 
524 aa  242  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.275074 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2904  GerA family spore germination protein  33.25 
 
 
437 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0141963  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1194  grkA; spore germination protein, GrkA  31.06 
 
 
537 aa  240  4e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.616884  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2853  spore germination protein  29.9 
 
 
524 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0927787  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2928  spore germination protein GerAA  33.01 
 
 
437 aa  239  1e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3150  spore germination protein GerAA  33.01 
 
 
437 aa  239  1e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1014  GerA spore germination protein  31.46 
 
 
533 aa  235  1.0000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000120979 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2278  GerA spore germination protein  32.54 
 
 
537 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2042  GerA spore germination protein  30.18 
 
 
560 aa  232  1e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.480991 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0297  GerA spore germination protein  30.56 
 
 
512 aa  231  2e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0054  GerA spore germination protein  29.59 
 
 
544 aa  228  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2663  GerA spore germination protein  29.07 
 
 
517 aa  228  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2464  GerA spore germination protein  28.46 
 
 
541 aa  226  7e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0803  GerA spore germination protein  27.54 
 
 
511 aa  223  7e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.905177  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3659  GerA spore germination protein  29.85 
 
 
510 aa  223  8e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0603  GerA spore germination protein  32 
 
 
534 aa  219  7.999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0139  spore germination protein KA  28.61 
 
 
523 aa  219  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0585  GerA spore germination protein  28.97 
 
 
552 aa  218  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.70288  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0876  GerA spore germination protein  28.6 
 
 
530 aa  216  9.999999999999999e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00100  GerA spore germination protein  28.34 
 
 
531 aa  215  1.9999999999999998e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2953  GerA spore germination protein  28.37 
 
 
622 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0846  GerA spore germination protein  28.77 
 
 
540 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2438  GerA spore germination protein  30.41 
 
 
587 aa  213  7e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0667  GerA spore germination protein  26.65 
 
 
589 aa  211  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1971  GerA spore germination protein  26.36 
 
 
592 aa  209  8e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2167  GerA spore germination protein  28.6 
 
 
541 aa  209  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.087983  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0654  GerA spore germination protein  28.26 
 
 
530 aa  209  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0438  GerA spore germination protein  30.07 
 
 
599 aa  209  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.561382  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0057  GerA spore germination protein  29.09 
 
 
523 aa  207  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0604  GerA spore germination protein  29.03 
 
 
534 aa  208  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3282  GerA spore germination protein  28.28 
 
 
499 aa  208  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000691632  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0675  spore germination protein GerLA  26.23 
 
 
478 aa  205  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0619  spore germination protein  26.44 
 
 
492 aa  206  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0709  spore germination protein GerLA  26.23 
 
 
478 aa  205  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0763  spore germination protein GerLA  26.23 
 
 
489 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000217603 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0778  spore germination protein GerLA  26.65 
 
 
492 aa  204  4e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0619  spore germination protein  26.64 
 
 
492 aa  204  4e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2456  GerA spore germination protein  27.99 
 
 
520 aa  204  4e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0837  spore germination protein GerLA  25.96 
 
 
489 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0829  GerA spore germination protein  27.54 
 
 
492 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0624  GerA spore germination protein  28.12 
 
 
492 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0078  germination protein  29.49 
 
 
517 aa  200  3.9999999999999996e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4594  spore germination protein GerLA  26.44 
 
 
492 aa  200  5e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1936  GerA spore germination protein  29.28 
 
 
596 aa  200  5e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1732  GerA spore germination protein  28.26 
 
 
633 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0743  spore germination protein GerLA  26.38 
 
 
492 aa  199  9e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.702364  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1962  GerA spore germination protein  26.92 
 
 
525 aa  197  3e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.346602  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2753  spore germination protein XA  29.29 
 
 
454 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.32378  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0157  spore germination protein xa  26.58 
 
 
492 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1461  GerA spore germination protein  28.54 
 
 
558 aa  196  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2062  GerA spore germination protein  25.51 
 
 
511 aa  195  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0548  GerA spore germination protein  30.32 
 
 
500 aa  194  4e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5573  GerA spore germination protein  27.48 
 
 
515 aa  193  5e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.32214 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0671  spore germination protein GerKA  30.07 
 
 
500 aa  193  6e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0521  GerA spore germination protein  25.25 
 
 
578 aa  193  7e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0765  spore germination protein GerKA  30.13 
 
 
500 aa  193  7e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0691  spore germination protein GerKA  30.38 
 
 
500 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4666  spore germination protein GerKA  29.98 
 
 
500 aa  192  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.5266399999999997e-20 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0546  spore germination protein KA  30.38 
 
 
500 aa  192  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0597  GerA spore germination protein  27.68 
 
 
488 aa  191  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2765  GerA spore germination protein  29.03 
 
 
490 aa  191  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000513551  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0602  spore germination protein GerKA  30.13 
 
 
500 aa  190  4e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0635  spore germination protein GerKA  30.13 
 
 
500 aa  190  4e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0546  spore germination protein KA  29.87 
 
 
500 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1709  GerZA  25.38 
 
 
497 aa  186  8e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000504866 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2341  GerA spore germination protein  25 
 
 
502 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532317  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2458  GerA spore germination protein  26.59 
 
 
512 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3369  spore germination protein  27.65 
 
 
512 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0478776  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1767  GerA spore germination protein  26.32 
 
 
504 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3633  spore germination protein  27.65 
 
 
512 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>