More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1659 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0429  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  83.25 
 
 
388 aa  664    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1659  glutamine--scyllo-inositol transaminase  100 
 
 
388 aa  797    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  0.520835 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4841  glutamine--scyllo-inositol transaminase  77.78 
 
 
392 aa  607  9.999999999999999e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.645054  normal  0.0428099 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1255  glutamine--scyllo-inositol transaminase  72.47 
 
 
388 aa  570  1e-161  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3287  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  71.62 
 
 
388 aa  566  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3196  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  70.71 
 
 
388 aa  543  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3211  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  38.16 
 
 
407 aa  250  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3347  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  41.21 
 
 
409 aa  248  1e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3954  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  39.36 
 
 
397 aa  246  6.999999999999999e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6578  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  37.37 
 
 
406 aa  241  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3628  glutamine--scyllo-inositol transaminase  38.83 
 
 
397 aa  240  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2068  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  42.19 
 
 
380 aa  240  4e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0837  glutamine--scyllo-inositol transaminase  37.34 
 
 
433 aa  239  8e-62  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4492  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  32.91 
 
 
462 aa  211  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.920863 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0752  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.05 
 
 
368 aa  196  7e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.582657 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0354  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  31.58 
 
 
474 aa  196  7e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000278055  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2810  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  45.56 
 
 
380 aa  193  4e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0386  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  37.97 
 
 
387 aa  191  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.351187  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3157  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.83 
 
 
371 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001765  4-keto-6-deoxy-N-Acetyl-D-hexosaminyl-(Lipid carrier) aminotransferase  33.08 
 
 
391 aa  191  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000522375  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3061  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.56 
 
 
393 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0901  glutamine--scyllo-inositol transaminase  32.1 
 
 
382 aa  191  2.9999999999999997e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.343988  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0603  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  31.58 
 
 
470 aa  189  8e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1137  aspartate aminotransferase  36.63 
 
 
360 aa  188  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3818  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.58 
 
 
400 aa  187  3e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.361845 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2142  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.81 
 
 
362 aa  186  5e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.785412 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2577  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  39.34 
 
 
365 aa  184  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.176672  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3037  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.06 
 
 
408 aa  184  3e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0163402  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2724  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.49 
 
 
391 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0368  glutamine--scyllo-inositol transaminase  37.06 
 
 
396 aa  183  5.0000000000000004e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1325  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  39.62 
 
 
368 aa  182  6e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1239  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  41.2 
 
 
368 aa  181  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.868639  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1964  perosamine synthetase  33.92 
 
 
591 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3363  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  31.97 
 
 
423 aa  181  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0556402 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0666  aminotransferase  33.92 
 
 
586 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.198261  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0571  aminotransferase  33.92 
 
 
586 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1929  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  40.7 
 
 
362 aa  181  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0056  perosamine synthetase  34.69 
 
 
375 aa  180  4e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0267366  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1981  perosamine synthetase  32.56 
 
 
591 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0028  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.16 
 
 
403 aa  179  7e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4210  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  41.54 
 
 
362 aa  179  8e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2126  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  38.55 
 
 
372 aa  178  1e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0334323  normal  0.0133651 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1130  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  32.84 
 
 
404 aa  178  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00734669  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2600  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  35.96 
 
 
362 aa  177  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3402  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.66 
 
 
507 aa  177  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1860  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  40.65 
 
 
362 aa  177  4e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.169913  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3059  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.64 
 
 
370 aa  176  4e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1683  glutamine--scyllo-inositol transaminase  37.08 
 
 
369 aa  176  5e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0415301 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3190  glutamine--scyllo-inositol transaminase  41.3 
 
 
366 aa  176  6e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3018  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  41.15 
 
 
518 aa  176  6e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0579  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.59 
 
 
394 aa  176  6e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.11165  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1610  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  38.52 
 
 
357 aa  176  7e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4223  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  32.88 
 
 
374 aa  176  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206706  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1688  glutamine--scyllo-inositol transaminase  41.91 
 
 
369 aa  176  8e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0689  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  39.75 
 
 
369 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.530508  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1937  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  32.41 
 
 
392 aa  175  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0110  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.15 
 
 
406 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0245  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  38.46 
 
 
357 aa  175  9.999999999999999e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.4037 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1968  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  38.77 
 
 
413 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0281049 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3126  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  37.16 
 
 
368 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1650  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase family protein  38.75 
 
 
389 aa  174  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4428  glutamine--scyllo-inositol transaminase  41.95 
 
 
583 aa  174  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.586345 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0204  glutamine--scyllo-inositol transaminase  39.77 
 
 
385 aa  173  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1514  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  38.96 
 
 
373 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25161  putative pleiotropic regulatory protein  39.92 
 
 
408 aa  173  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02340  putative eps aminotransferase protein  33.75 
 
 
395 aa  173  5e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0229942 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1698  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.82 
 
 
373 aa  173  5e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1701  glutamine--scyllo-inositol transaminase  36.97 
 
 
417 aa  173  5e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4737  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  33.33 
 
 
383 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.383646  normal  0.301664 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1353  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  35.37 
 
 
370 aa  173  5.999999999999999e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0724  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  39.45 
 
 
387 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.297651  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3660  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  33.33 
 
 
383 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.795674  normal  0.3486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7630  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  33.06 
 
 
373 aa  172  5.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409815  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2700  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  39.6 
 
 
372 aa  172  6.999999999999999e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0781  glutamine--scyllo-inositol transaminase  41.1 
 
 
425 aa  172  6.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.196688  normal  0.5278 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03641  putative pleiotropic regulatory protein  38.59 
 
 
389 aa  172  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0562447  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0634  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  40.64 
 
 
374 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.797926 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1530  putative aminotransferase  33.42 
 
 
404 aa  172  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2646  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  31.38 
 
 
392 aa  172  1e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0352  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  33.87 
 
 
455 aa  172  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.354297  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1670  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.27 
 
 
391 aa  172  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0312  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.56 
 
 
387 aa  172  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.991338  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4504  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  38.56 
 
 
382 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0669579  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0638  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  39.68 
 
 
400 aa  171  2e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.36704 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1610  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  41.45 
 
 
367 aa  171  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.988475  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4213  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  38.14 
 
 
382 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3134  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  40.73 
 
 
368 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08620  predicted PLP-dependent enzyme possibly involved in cell wall biogenesis  39.14 
 
 
370 aa  171  3e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0477  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  38.6 
 
 
364 aa  170  4e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.485963  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0790  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  41.7 
 
 
368 aa  170  5e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2941  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  38.17 
 
 
374 aa  169  5e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2093  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  37.34 
 
 
404 aa  169  8e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.325531  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3813  glutamine--scyllo-inositol transaminase  34.15 
 
 
420 aa  169  9e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0824  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  38 
 
 
359 aa  168  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0802  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.53 
 
 
396 aa  168  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.53692  normal  0.746169 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4056  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  38.41 
 
 
377 aa  167  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03111  putative pleiotropic regulatory protein  38.65 
 
 
397 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1846  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.08 
 
 
404 aa  168  2e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0996906 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1191  glutamine--scyllo-inositol transaminase  37.9 
 
 
365 aa  168  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3423  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.24 
 
 
366 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0969116  normal  0.511513 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>