More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4841 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4841  glutamine--scyllo-inositol transaminase  100 
 
 
392 aa  792    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.645054  normal  0.0428099 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1659  glutamine--scyllo-inositol transaminase  77.78 
 
 
388 aa  613  9.999999999999999e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  0.520835 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0429  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  79.58 
 
 
388 aa  609  1e-173  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1255  glutamine--scyllo-inositol transaminase  72.89 
 
 
388 aa  562  1.0000000000000001e-159  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3287  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  69.76 
 
 
388 aa  546  1e-154  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3196  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  67.9 
 
 
388 aa  511  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3954  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  40.73 
 
 
397 aa  245  9e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3628  glutamine--scyllo-inositol transaminase  39.53 
 
 
397 aa  238  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6578  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  35.49 
 
 
406 aa  229  4e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3211  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.26 
 
 
407 aa  229  5e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0837  glutamine--scyllo-inositol transaminase  35.48 
 
 
433 aa  226  6e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2068  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  42.82 
 
 
380 aa  226  6e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3347  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  38.28 
 
 
409 aa  213  5.999999999999999e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4492  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  31.88 
 
 
462 aa  191  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.920863 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1929  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.34 
 
 
362 aa  182  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3126  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.51 
 
 
368 aa  181  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0901  glutamine--scyllo-inositol transaminase  31.83 
 
 
382 aa  181  2e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.343988  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2810  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  44.76 
 
 
380 aa  180  4e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3018  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  37.16 
 
 
518 aa  180  4.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1325  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  40.86 
 
 
368 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0028  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.91 
 
 
403 aa  179  7e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4428  glutamine--scyllo-inositol transaminase  41.41 
 
 
583 aa  177  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.586345 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0752  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  38.02 
 
 
368 aa  177  4e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.582657 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0205  glutamine--scyllo-inositol transaminase  34.43 
 
 
364 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.737866  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1191  glutamine--scyllo-inositol transaminase  44.74 
 
 
365 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1290  glutamine--scyllo-inositol transaminase  41.25 
 
 
372 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0634  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  42.67 
 
 
374 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.797926 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1860  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  39.37 
 
 
362 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.169913  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0603  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  29.51 
 
 
470 aa  173  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0689  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  42.49 
 
 
369 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.530508  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1968  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  39.84 
 
 
413 aa  172  6.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0281049 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0354  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  28.97 
 
 
474 aa  172  7.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000278055  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2142  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.23 
 
 
362 aa  172  9e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.785412 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0781  glutamine--scyllo-inositol transaminase  39.84 
 
 
425 aa  171  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.196688  normal  0.5278 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3061  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.12 
 
 
393 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0709  glutamine--scyllo-inositol transaminase  35.71 
 
 
368 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0824  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  38.13 
 
 
359 aa  171  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1239  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  42.24 
 
 
368 aa  170  4e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.868639  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3363  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.86 
 
 
423 aa  170  5e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0556402 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0245  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.86 
 
 
357 aa  170  5e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.4037 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0477  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  40.82 
 
 
364 aa  170  5e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.485963  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0790  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  44.3 
 
 
368 aa  169  8e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2724  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  30.77 
 
 
391 aa  169  9e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0724  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.69 
 
 
387 aa  169  9e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.297651  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3423  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  40.08 
 
 
366 aa  169  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0969116  normal  0.511513 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2375  PLP-dependent transaminase  41.08 
 
 
415 aa  168  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184111  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3190  glutamine--scyllo-inositol transaminase  41.67 
 
 
366 aa  169  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1353  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  34.35 
 
 
370 aa  167  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1934  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  40.21 
 
 
387 aa  167  2e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1137  aspartate aminotransferase  36.7 
 
 
360 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3037  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  31.34 
 
 
408 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0163402  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0616  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.19 
 
 
358 aa  167  4e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.141663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3818  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  31.9 
 
 
400 aa  167  4e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.361845 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1701  glutamine--scyllo-inositol transaminase  35.97 
 
 
417 aa  166  5e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1530  putative aminotransferase  37.13 
 
 
404 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1460  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.66 
 
 
363 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.594691  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2577  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.49 
 
 
365 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.176672  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00203  aminotransferase  44.98 
 
 
370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.460173  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4210  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  39.33 
 
 
362 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0952  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  39.3 
 
 
366 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2700  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  43.65 
 
 
372 aa  164  3e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0386  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  33.73 
 
 
387 aa  164  3e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.351187  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1610  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  37.14 
 
 
357 aa  164  3e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2262  pleiotropic regulatory protein  35.89 
 
 
363 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02340  putative eps aminotransferase protein  31.23 
 
 
395 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0229942 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3378  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  40.16 
 
 
368 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.65764  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3157  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.6 
 
 
371 aa  163  6e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1610  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  40 
 
 
367 aa  161  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.988475  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29860  predicted PLP-dependent enzyme possibly involved in cell wall biogenesis  39.42 
 
 
369 aa  162  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0110  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.54 
 
 
406 aa  162  1e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0204  glutamine--scyllo-inositol transaminase  39.15 
 
 
385 aa  162  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0082  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  30.48 
 
 
371 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0080  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  30.48 
 
 
371 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.182547 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6418  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  38.4 
 
 
367 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.50729  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2233  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  39.52 
 
 
363 aa  161  2e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1698  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.43 
 
 
373 aa  160  3e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2600  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  34.81 
 
 
362 aa  160  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6222  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  36.45 
 
 
367 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.239921  normal  0.132866 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2093  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  39.76 
 
 
404 aa  160  3e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.325531  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0404  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  38.1 
 
 
404 aa  160  3e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.542778 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1130  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  30.02 
 
 
404 aa  160  5e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00734669  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5774  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  37.37 
 
 
369 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0703  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  35.17 
 
 
394 aa  159  6e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000106143  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1398  glutamine--scyllo-inositol transaminase  43.59 
 
 
420 aa  159  8e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0711  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase family protein  35.98 
 
 
388 aa  159  9e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001765  4-keto-6-deoxy-N-Acetyl-D-hexosaminyl-(Lipid carrier) aminotransferase  29.46 
 
 
391 aa  159  9e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000522375  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4762  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.36 
 
 
383 aa  158  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000017153  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0121  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.62 
 
 
358 aa  158  1e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3037  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.65 
 
 
367 aa  158  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.418977  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0368  glutamine--scyllo-inositol transaminase  35.86 
 
 
396 aa  159  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2941  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  42.86 
 
 
374 aa  159  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3259  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  34.28 
 
 
372 aa  158  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8499  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  33.82 
 
 
387 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1506  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.11 
 
 
535 aa  158  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0812  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  31.12 
 
 
364 aa  158  2e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.317419  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3402  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  37.7 
 
 
507 aa  158  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2570  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.61 
 
 
372 aa  158  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0579  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35 
 
 
394 aa  157  3e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.11165  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1688  glutamine--scyllo-inositol transaminase  41.74 
 
 
369 aa  157  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1184  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.2 
 
 
366 aa  157  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.375079 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>