38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1551 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1551  zinc finger SWIM domain-containing protein  100 
 
 		 1059 aa  2013    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.712758 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6475  zinc finger SWIM domain protein  38.63 
 
 		 457 aa  219  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.021657  normal  0.0781791 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1844  zinc finger SWIM domain protein  40.09 
 
 		 449 aa  219  2.9999999999999998e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000517508  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2427  zinc finger SWIM domain protein  34.13 
 
 		 442 aa  211  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579091 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4020  zinc finger SWIM domain-containing protein  32.74 
 
 		 441 aa  206  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2175  zinc finger SWIM domain-containing protein  40.13 
 
 		 425 aa  202  3e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3510  SWIM zinc finger domain-containing protein  33.41 
 
 		 440 aa  198  6e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4681  zinc finger SWIM domain protein  36.77 
 
 		 435 aa  193  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0758  zinc finger SWIM domain protein  31.16 
 
 		 434 aa  189  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4848  zinc finger SWIM domain-containing protein  34.44 
 
 		 481 aa  186  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1457  hypothetical protein  37.74 
 
 		 444 aa  185  5.0000000000000004e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.041762  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2049  zinc finger SWIM domain protein  39.86 
 
 		 464 aa  185  5.0000000000000004e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00765998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2405  zinc finger SWIM domain protein  39.32 
 
 		 435 aa  182  4e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000238386  decreased coverage  0.000116263 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3737  zinc finger SWIM domain-containing protein  36.87 
 
 		 461 aa  176  2.9999999999999996e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.436415  normal  0.0662307 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4582  zinc finger SWIM domain protein  39.13 
 
 		 415 aa  175  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7993  zinc finger SWIM domain protein  39.46 
 
 		 459 aa  164  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1275  zinc finger SWIM domain protein  45.48 
 
 		 426 aa  156  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137787  normal  0.0755473 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1514  zinc finger SWIM domain protein  37.99 
 
 		 455 aa  149  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0734155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1514  zinc finger SWIM domain-containing protein  46.56 
 
 		 455 aa  139  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.543823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1793  zinc finger SWIM domain protein  46.56 
 
 		 455 aa  139  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253806  normal  0.0159475 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2428  hypothetical protein  30.72 
 
 		 499 aa  127  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138458 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2174  hypothetical protein  35.01 
 
 		 450 aa  119  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6474  hypothetical protein  31.05 
 
 		 469 aa  117  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00505706  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1843  hypothetical protein  31.99 
 
 		 546 aa  112  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00395513  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4581  hypothetical protein  30.11 
 
 		 500 aa  108  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4847  hypothetical protein  35.66 
 
 		 587 aa  105  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.123529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4682  hypothetical protein  31.14 
 
 		 488 aa  101  8e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7992  hypothetical protein  30.05 
 
 		 542 aa  95.5  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4021  hypothetical protein  29.93 
 
 		 478 aa  83.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1458  hypothetical protein  29.92 
 
 		 490 aa  81.3  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.0011946  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2048  hypothetical protein  32.09 
 
 		 571 aa  80.5  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.925315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3738  hypothetical protein  31.35 
 
 		 528 aa  79.7  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.071134 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2017  zinc finger SWIM domain protein  29.24 
 
 		 481 aa  75.9  0.000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0757  hypothetical protein  22.81 
 
 		 482 aa  72.8  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1513  hypothetical protein  33.53 
 
 		 526 aa  66.2  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0129482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3511  hypothetical protein  26.67 
 
 		 534 aa  58.9  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1792  hypothetical protein  34.73 
 
 		 527 aa  55.8  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0147658  normal  0.03061 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1276  hypothetical protein  28.81 
 
 		 488 aa  52.8  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.466916  normal  0.0454363 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>