21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4681 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4681  zinc finger SWIM domain protein  100 
 
 		 435 aa  860    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2049  zinc finger SWIM domain protein  46.36 
 
 		 464 aa  290  3e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00765998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6475  zinc finger SWIM domain protein  39.87 
 
 		 457 aa  277  3e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.021657  normal  0.0781791 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1844  zinc finger SWIM domain protein  43.15 
 
 		 449 aa  276  6e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000517508  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1275  zinc finger SWIM domain protein  47.69 
 
 		 426 aa  267  2e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137787  normal  0.0755473 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2175  zinc finger SWIM domain-containing protein  43.75 
 
 		 425 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2427  zinc finger SWIM domain protein  35.07 
 
 		 442 aa  252  9.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579091 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1514  zinc finger SWIM domain-containing protein  39.82 
 
 		 455 aa  242  1e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.543823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1514  zinc finger SWIM domain protein  39.14 
 
 		 455 aa  239  8e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0734155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1793  zinc finger SWIM domain protein  39.14 
 
 		 455 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253806  normal  0.0159475 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2405  zinc finger SWIM domain protein  41.55 
 
 		 435 aa  232  9e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000238386  decreased coverage  0.000116263 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7993  zinc finger SWIM domain protein  41.27 
 
 		 459 aa  226  5.0000000000000005e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4848  zinc finger SWIM domain-containing protein  36.38 
 
 		 481 aa  221  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0758  zinc finger SWIM domain protein  33.1 
 
 		 434 aa  203  5e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1457  hypothetical protein  37.42 
 
 		 444 aa  202  8e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.041762  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3510  SWIM zinc finger domain-containing protein  34.23 
 
 		 440 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4582  zinc finger SWIM domain protein  38.61 
 
 		 415 aa  197  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3737  zinc finger SWIM domain-containing protein  35.33 
 
 		 461 aa  194  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.436415  normal  0.0662307 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4020  zinc finger SWIM domain-containing protein  32.62 
 
 		 441 aa  187  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1551  zinc finger SWIM domain-containing protein  34.97 
 
 		 1059 aa  147  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.712758 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2017  zinc finger SWIM domain protein  24.65 
 
 		 481 aa  108  3e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>