23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2405 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2405  zinc finger SWIM domain protein  100 
 
 		 435 aa  842    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000238386  decreased coverage  0.000116263 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6475  zinc finger SWIM domain protein  42.14 
 
 		 457 aa  274  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.021657  normal  0.0781791 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2049  zinc finger SWIM domain protein  44.62 
 
 		 464 aa  269  8e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00765998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4681  zinc finger SWIM domain protein  42.47 
 
 		 435 aa  266  5e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1844  zinc finger SWIM domain protein  42.86 
 
 		 449 aa  253  3e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000517508  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2175  zinc finger SWIM domain-containing protein  44.5 
 
 		 425 aa  253  6e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2427  zinc finger SWIM domain protein  36.34 
 
 		 442 aa  246  8e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579091 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7993  zinc finger SWIM domain protein  43.75 
 
 		 459 aa  233  6e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1275  zinc finger SWIM domain protein  45.76 
 
 		 426 aa  231  2e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137787  normal  0.0755473 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1457  hypothetical protein  40.72 
 
 		 444 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.041762  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4848  zinc finger SWIM domain-containing protein  36.05 
 
 		 481 aa  207  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3510  SWIM zinc finger domain-containing protein  33.71 
 
 		 440 aa  204  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4020  zinc finger SWIM domain-containing protein  32.53 
 
 		 441 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4582  zinc finger SWIM domain protein  41.22 
 
 		 415 aa  188  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0758  zinc finger SWIM domain protein  30.18 
 
 		 434 aa  188  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1551  zinc finger SWIM domain-containing protein  37.5 
 
 		 1059 aa  180  4e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.712758 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1514  zinc finger SWIM domain-containing protein  35.71 
 
 		 455 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.543823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3737  zinc finger SWIM domain-containing protein  34.39 
 
 		 461 aa  171  3e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.436415  normal  0.0662307 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1514  zinc finger SWIM domain protein  34.3 
 
 		 455 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0734155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1793  zinc finger SWIM domain protein  34.6 
 
 		 455 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253806  normal  0.0159475 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2017  zinc finger SWIM domain protein  41.11 
 
 		 481 aa  83.2  0.000000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3863  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 446 aa  44.3  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.165954  normal  0.826823 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.25 
 
 		 1104 aa  43.9  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0578806 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>