21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4848 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4848  zinc finger SWIM domain-containing protein  100 
 
 		 481 aa  960    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3737  zinc finger SWIM domain-containing protein  44.76 
 
 		 461 aa  303  5.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.436415  normal  0.0662307 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3510  SWIM zinc finger domain-containing protein  40.72 
 
 		 440 aa  288  2e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2427  zinc finger SWIM domain protein  35.97 
 
 		 442 aa  252  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579091 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1844  zinc finger SWIM domain protein  39.87 
 
 		 449 aa  238  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000517508  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6475  zinc finger SWIM domain protein  36.11 
 
 		 457 aa  229  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.021657  normal  0.0781791 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2175  zinc finger SWIM domain-containing protein  39.01 
 
 		 425 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4681  zinc finger SWIM domain protein  36.61 
 
 		 435 aa  226  5.0000000000000005e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4020  zinc finger SWIM domain-containing protein  32.96 
 
 		 441 aa  222  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1514  zinc finger SWIM domain protein  41.07 
 
 		 455 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0734155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0758  zinc finger SWIM domain protein  34.9 
 
 		 434 aa  213  7.999999999999999e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2049  zinc finger SWIM domain protein  37.05 
 
 		 464 aa  211  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00765998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1793  zinc finger SWIM domain protein  40.64 
 
 		 455 aa  210  4e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253806  normal  0.0159475 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1514  zinc finger SWIM domain-containing protein  41.74 
 
 		 455 aa  210  6e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.543823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7993  zinc finger SWIM domain protein  35.49 
 
 		 459 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2405  zinc finger SWIM domain protein  39.46 
 
 		 435 aa  186  6e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000238386  decreased coverage  0.000116263 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4582  zinc finger SWIM domain protein  35.1 
 
 		 415 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1457  hypothetical protein  32.56 
 
 		 444 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.041762  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1275  zinc finger SWIM domain protein  35.54 
 
 		 426 aa  172  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137787  normal  0.0755473 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1551  zinc finger SWIM domain-containing protein  34.3 
 
 		 1059 aa  137  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.712758 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2017  zinc finger SWIM domain protein  28.49 
 
 		 481 aa  84  0.000000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>