21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7993 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7993  zinc finger SWIM domain protein  100 
 
 		 459 aa  899    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6475  zinc finger SWIM domain protein  44.16 
 
 		 457 aa  297  3e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.021657  normal  0.0781791 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2175  zinc finger SWIM domain-containing protein  44.6 
 
 		 425 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1844  zinc finger SWIM domain protein  40.48 
 
 		 449 aa  276  4e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000517508  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2427  zinc finger SWIM domain protein  35.98 
 
 		 442 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579091 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4681  zinc finger SWIM domain protein  41.63 
 
 		 435 aa  265  2e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1457  hypothetical protein  41.22 
 
 		 444 aa  260  4e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.041762  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4582  zinc finger SWIM domain protein  43.43 
 
 		 415 aa  258  1e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2049  zinc finger SWIM domain protein  41.12 
 
 		 464 aa  234  3e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00765998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3510  SWIM zinc finger domain-containing protein  35.81 
 
 		 440 aa  225  1e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2405  zinc finger SWIM domain protein  43.16 
 
 		 435 aa  219  5e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000238386  decreased coverage  0.000116263 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1275  zinc finger SWIM domain protein  43.71 
 
 		 426 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137787  normal  0.0755473 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4020  zinc finger SWIM domain-containing protein  32.96 
 
 		 441 aa  211  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0758  zinc finger SWIM domain protein  32.72 
 
 		 434 aa  209  9e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4848  zinc finger SWIM domain-containing protein  35.49 
 
 		 481 aa  204  4e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3737  zinc finger SWIM domain-containing protein  34.66 
 
 		 461 aa  191  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.436415  normal  0.0662307 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1514  zinc finger SWIM domain-containing protein  36.75 
 
 		 455 aa  189  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.543823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1514  zinc finger SWIM domain protein  37.08 
 
 		 455 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0734155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1793  zinc finger SWIM domain protein  36.97 
 
 		 455 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253806  normal  0.0159475 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1551  zinc finger SWIM domain-containing protein  35.41 
 
 		 1059 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.712758 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2017  zinc finger SWIM domain protein  33.14 
 
 		 481 aa  92.4  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>