22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1275 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1275  zinc finger SWIM domain protein  100 
 
 		 426 aa  813    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137787  normal  0.0755473 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2049  zinc finger SWIM domain protein  58.16 
 
 		 464 aa  408  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00765998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4681  zinc finger SWIM domain protein  48.04 
 
 		 435 aa  320  1.9999999999999998e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6475  zinc finger SWIM domain protein  44.96 
 
 		 457 aa  319  7e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.021657  normal  0.0781791 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1844  zinc finger SWIM domain protein  47.74 
 
 		 449 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000517508  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2427  zinc finger SWIM domain protein  40.32 
 
 		 442 aa  293  4e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579091 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2175  zinc finger SWIM domain-containing protein  46.65 
 
 		 425 aa  271  2e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2405  zinc finger SWIM domain protein  47.17 
 
 		 435 aa  251  2e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000238386  decreased coverage  0.000116263 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7993  zinc finger SWIM domain protein  44.19 
 
 		 459 aa  247  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4582  zinc finger SWIM domain protein  43.98 
 
 		 415 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1457  hypothetical protein  43.51 
 
 		 444 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.041762  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3510  SWIM zinc finger domain-containing protein  37.27 
 
 		 440 aa  230  3e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4020  zinc finger SWIM domain-containing protein  34.93 
 
 		 441 aa  219  7.999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4848  zinc finger SWIM domain-containing protein  37.59 
 
 		 481 aa  213  3.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0758  zinc finger SWIM domain protein  32.71 
 
 		 434 aa  212  9e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1514  zinc finger SWIM domain protein  37.84 
 
 		 455 aa  187  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0734155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1793  zinc finger SWIM domain protein  37.39 
 
 		 455 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253806  normal  0.0159475 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1514  zinc finger SWIM domain-containing protein  37.39 
 
 		 455 aa  169  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.543823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3737  zinc finger SWIM domain-containing protein  34.82 
 
 		 461 aa  160  5e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.436415  normal  0.0662307 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2017  zinc finger SWIM domain protein  32.93 
 
 		 481 aa  92  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1551  zinc finger SWIM domain-containing protein  60 
 
 		 1059 aa  84  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.712758 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30090  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  31.65 
 
 		 1227 aa  43.5  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>