21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4582 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4582  zinc finger SWIM domain protein  100 
 
 		 415 aa  817    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1457  hypothetical protein  46.01 
 
 		 444 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.041762  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6475  zinc finger SWIM domain protein  44.5 
 
 		 457 aa  279  6e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.021657  normal  0.0781791 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1844  zinc finger SWIM domain protein  44.99 
 
 		 449 aa  273  3e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000517508  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2175  zinc finger SWIM domain-containing protein  45.86 
 
 		 425 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7993  zinc finger SWIM domain protein  43.18 
 
 		 459 aa  236  8e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2427  zinc finger SWIM domain protein  35.4 
 
 		 442 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579091 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2049  zinc finger SWIM domain protein  41.9 
 
 		 464 aa  211  1e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00765998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4681  zinc finger SWIM domain protein  38.61 
 
 		 435 aa  206  9e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0758  zinc finger SWIM domain protein  32.9 
 
 		 434 aa  202  8e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1275  zinc finger SWIM domain protein  42.51 
 
 		 426 aa  194  3e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137787  normal  0.0755473 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4020  zinc finger SWIM domain-containing protein  31.19 
 
 		 441 aa  192  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4848  zinc finger SWIM domain-containing protein  35.1 
 
 		 481 aa  185  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3510  SWIM zinc finger domain-containing protein  33.41 
 
 		 440 aa  177  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3737  zinc finger SWIM domain-containing protein  34.68 
 
 		 461 aa  177  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.436415  normal  0.0662307 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2405  zinc finger SWIM domain protein  40.49 
 
 		 435 aa  160  4e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000238386  decreased coverage  0.000116263 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1514  zinc finger SWIM domain-containing protein  35.38 
 
 		 455 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.543823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1551  zinc finger SWIM domain-containing protein  37.98 
 
 		 1059 aa  150  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.712758 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1514  zinc finger SWIM domain protein  37.59 
 
 		 455 aa  146  6e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0734155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1793  zinc finger SWIM domain protein  36.03 
 
 		 455 aa  138  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253806  normal  0.0159475 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2017  zinc finger SWIM domain protein  33.59 
 
 		 481 aa  75.9  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>