21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3737 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3737  zinc finger SWIM domain-containing protein  100 
 
 		 461 aa  910    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.436415  normal  0.0662307 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4848  zinc finger SWIM domain-containing protein  44.78 
 
 		 481 aa  328  1.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3510  SWIM zinc finger domain-containing protein  42.44 
 
 		 440 aa  302  1e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2427  zinc finger SWIM domain protein  38.72 
 
 		 442 aa  273  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579091 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6475  zinc finger SWIM domain protein  37.1 
 
 		 457 aa  246  6e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.021657  normal  0.0781791 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2175  zinc finger SWIM domain-containing protein  38.55 
 
 		 425 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4020  zinc finger SWIM domain-containing protein  33.77 
 
 		 441 aa  231  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1844  zinc finger SWIM domain protein  39.82 
 
 		 449 aa  231  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000517508  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4681  zinc finger SWIM domain protein  36.14 
 
 		 435 aa  226  7e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0758  zinc finger SWIM domain protein  35.81 
 
 		 434 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7993  zinc finger SWIM domain protein  36.28 
 
 		 459 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2049  zinc finger SWIM domain protein  36.67 
 
 		 464 aa  197  4.0000000000000005e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00765998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1514  zinc finger SWIM domain-containing protein  35.56 
 
 		 455 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.543823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1514  zinc finger SWIM domain protein  38.17 
 
 		 455 aa  183  7e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0734155  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4582  zinc finger SWIM domain protein  35.63 
 
 		 415 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1457  hypothetical protein  34.05 
 
 		 444 aa  180  4.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.041762  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1793  zinc finger SWIM domain protein  39.77 
 
 		 455 aa  176  7e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253806  normal  0.0159475 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2405  zinc finger SWIM domain protein  34.57 
 
 		 435 aa  173  5.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000238386  decreased coverage  0.000116263 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1551  zinc finger SWIM domain-containing protein  36.5 
 
 		 1059 aa  162  9e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.712758 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1275  zinc finger SWIM domain protein  39.76 
 
 		 426 aa  146  6e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137787  normal  0.0755473 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2017  zinc finger SWIM domain protein  33.16 
 
 		 481 aa  105  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>