21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0758 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0758  zinc finger SWIM domain protein  100 
 
 		 434 aa  892    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2427  zinc finger SWIM domain protein  37.91 
 
 		 442 aa  312  5.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579091 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4020  zinc finger SWIM domain-containing protein  37.73 
 
 		 441 aa  280  3e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3510  SWIM zinc finger domain-containing protein  35.55 
 
 		 440 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1844  zinc finger SWIM domain protein  36.64 
 
 		 449 aa  249  7e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000517508  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2175  zinc finger SWIM domain-containing protein  34.95 
 
 		 425 aa  228  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4848  zinc finger SWIM domain-containing protein  34.26 
 
 		 481 aa  223  7e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4681  zinc finger SWIM domain protein  33.1 
 
 		 435 aa  218  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1514  zinc finger SWIM domain protein  38.32 
 
 		 455 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0734155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6475  zinc finger SWIM domain protein  30.94 
 
 		 457 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.021657  normal  0.0781791 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1793  zinc finger SWIM domain protein  37.72 
 
 		 455 aa  211  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253806  normal  0.0159475 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1514  zinc finger SWIM domain-containing protein  35.44 
 
 		 455 aa  205  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.543823  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4582  zinc finger SWIM domain protein  32.67 
 
 		 415 aa  199  7.999999999999999e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7993  zinc finger SWIM domain protein  32.72 
 
 		 459 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3737  zinc finger SWIM domain-containing protein  34.42 
 
 		 461 aa  196  5.000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.436415  normal  0.0662307 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2049  zinc finger SWIM domain protein  32.19 
 
 		 464 aa  196  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00765998  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1275  zinc finger SWIM domain protein  32.71 
 
 		 426 aa  187  3e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137787  normal  0.0755473 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2405  zinc finger SWIM domain protein  32.85 
 
 		 435 aa  176  7e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000238386  decreased coverage  0.000116263 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1457  hypothetical protein  29.42 
 
 		 444 aa  172  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.041762  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1551  zinc finger SWIM domain-containing protein  30.7 
 
 		 1059 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.712758 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2017  zinc finger SWIM domain protein  30.99 
 
 		 481 aa  93.2  8e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>